Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4B4

Protein Details
Accession C5M4B4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-465ARERDRKKAIRNNTRNNVNHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000716  Thyroglobulin_1  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ctp:CTRG_00904  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS51162  THYROGLOBULIN_1_2  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MEPDEQHDPGSKLKQADSSHRNEQLQEEIEIVIVNADGSNARSHLDEDDNDNYSSENEARTSEEEEEDDDEEDDDEIPDESLGTTIIREIQDGTYICLVCTGEIDKDSKIWTCEECFRVYDLDCIQDWAIRGSSTKNKTWRCPSCNSSIKKIPRKFTCWCGKITDPEKNPLMPFSCGNSCNYKYEDCIHNCLNVCHPGKHPICGAMGPMMRCKCGKEERQLPCLITPYDDGWRCEDECNIKICDLNHKCQKGCHSGFCGLCNEVITMKCYCGDTDLSIKCHEKEIKPCENEKGEKWIGIGSCGKTKKVYYDCNEHYDLKECQPPLSTIPKCKFSPDVISTCYCGKTKVDLQNRSKCTDPVPECENVCGKLLPCGCHCKFKCHEGECYCISVFETKCACGHESYLAPCKFIQSGVQPKCEHKCSVLLNCRKHYHRVECCPYEKVGLARERDRKKAIRNNTRNNVNHDIMTIEAAHICTRTCNRVKACGKHECHALCHSGPCEVCLESTNDDLICHCGKTIIPAPVRCGTTLVCHEQCVRVPPCGHRAEPHECHDDTVSCPKCTALVSRECDCGAKSDLPGILCSQERVSCGKMCQIPKDCGHPCLRTCSAECTKLDNHISSKLCQSYCKKIRTSCPHYCKLKCHFNKVGVSPNCDVVSCSEDVMVSCECGRLTKKIKCGANVDTPSSIGSVLECDEECAIIKRDAALRAAFMGTPEPETAEDSIPYSEFVLTTYEKQKTWCSKVESTIKSFIENYNTQIENDVKLPKRSYHFPAMTSPQRHYIHELAKAYNAYTESQDKEPNRSVFLVITRLTKIPSLSVHDAVEMLHELEKEKLKIDEMKQEDINEALFNSIVIQDLFFGIIKDDLERELKPFYEGQDYIFEWIKDSTFIFYSPENYKSMDIEKENKLYMLVKTFKKIVREKSLAFDCKLCLVDDSVSYILKIDGASREASAPAESDQKSNQSKNSFDILQNDELVNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.5
4 0.52
5 0.54
6 0.58
7 0.63
8 0.62
9 0.56
10 0.54
11 0.51
12 0.46
13 0.39
14 0.31
15 0.24
16 0.22
17 0.2
18 0.17
19 0.1
20 0.07
21 0.06
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.11
30 0.13
31 0.16
32 0.2
33 0.21
34 0.24
35 0.29
36 0.3
37 0.3
38 0.29
39 0.25
40 0.21
41 0.23
42 0.19
43 0.16
44 0.14
45 0.15
46 0.18
47 0.2
48 0.23
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.23
54 0.21
55 0.19
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.13
78 0.18
79 0.19
80 0.2
81 0.21
82 0.21
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.14
87 0.16
88 0.15
89 0.12
90 0.14
91 0.16
92 0.15
93 0.16
94 0.19
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.24
100 0.31
101 0.32
102 0.33
103 0.31
104 0.31
105 0.31
106 0.29
107 0.29
108 0.23
109 0.24
110 0.21
111 0.22
112 0.21
113 0.2
114 0.2
115 0.17
116 0.17
117 0.14
118 0.15
119 0.18
120 0.27
121 0.31
122 0.37
123 0.44
124 0.5
125 0.58
126 0.68
127 0.72
128 0.7
129 0.72
130 0.71
131 0.72
132 0.74
133 0.7
134 0.68
135 0.67
136 0.72
137 0.74
138 0.76
139 0.76
140 0.75
141 0.77
142 0.74
143 0.74
144 0.75
145 0.67
146 0.62
147 0.59
148 0.55
149 0.58
150 0.59
151 0.58
152 0.51
153 0.54
154 0.54
155 0.5
156 0.47
157 0.42
158 0.38
159 0.31
160 0.29
161 0.27
162 0.3
163 0.28
164 0.3
165 0.33
166 0.33
167 0.34
168 0.35
169 0.32
170 0.29
171 0.34
172 0.4
173 0.36
174 0.4
175 0.38
176 0.4
177 0.4
178 0.38
179 0.36
180 0.36
181 0.36
182 0.33
183 0.33
184 0.39
185 0.39
186 0.4
187 0.37
188 0.32
189 0.3
190 0.27
191 0.26
192 0.22
193 0.23
194 0.21
195 0.27
196 0.25
197 0.26
198 0.26
199 0.27
200 0.29
201 0.35
202 0.41
203 0.45
204 0.54
205 0.58
206 0.64
207 0.64
208 0.58
209 0.51
210 0.48
211 0.38
212 0.3
213 0.25
214 0.21
215 0.26
216 0.28
217 0.27
218 0.26
219 0.28
220 0.28
221 0.27
222 0.28
223 0.26
224 0.27
225 0.29
226 0.27
227 0.24
228 0.25
229 0.25
230 0.32
231 0.32
232 0.37
233 0.43
234 0.46
235 0.47
236 0.48
237 0.54
238 0.53
239 0.52
240 0.49
241 0.46
242 0.47
243 0.47
244 0.46
245 0.41
246 0.32
247 0.28
248 0.23
249 0.19
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.2
262 0.22
263 0.23
264 0.26
265 0.28
266 0.26
267 0.32
268 0.35
269 0.33
270 0.39
271 0.46
272 0.52
273 0.54
274 0.56
275 0.56
276 0.57
277 0.55
278 0.48
279 0.48
280 0.4
281 0.36
282 0.33
283 0.3
284 0.23
285 0.23
286 0.25
287 0.18
288 0.24
289 0.25
290 0.25
291 0.25
292 0.26
293 0.31
294 0.34
295 0.41
296 0.39
297 0.47
298 0.5
299 0.53
300 0.55
301 0.49
302 0.43
303 0.39
304 0.36
305 0.3
306 0.31
307 0.26
308 0.24
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.31
313 0.31
314 0.34
315 0.38
316 0.43
317 0.42
318 0.43
319 0.42
320 0.35
321 0.4
322 0.37
323 0.36
324 0.33
325 0.34
326 0.33
327 0.31
328 0.31
329 0.23
330 0.19
331 0.17
332 0.19
333 0.26
334 0.33
335 0.41
336 0.48
337 0.56
338 0.64
339 0.66
340 0.63
341 0.57
342 0.49
343 0.43
344 0.43
345 0.37
346 0.33
347 0.33
348 0.34
349 0.33
350 0.34
351 0.32
352 0.24
353 0.22
354 0.18
355 0.15
356 0.17
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.28
361 0.28
362 0.37
363 0.38
364 0.41
365 0.41
366 0.47
367 0.53
368 0.46
369 0.54
370 0.46
371 0.5
372 0.43
373 0.42
374 0.35
375 0.26
376 0.24
377 0.21
378 0.19
379 0.19
380 0.18
381 0.17
382 0.18
383 0.19
384 0.2
385 0.15
386 0.16
387 0.13
388 0.14
389 0.16
390 0.24
391 0.22
392 0.22
393 0.22
394 0.22
395 0.19
396 0.18
397 0.18
398 0.16
399 0.26
400 0.28
401 0.34
402 0.34
403 0.37
404 0.42
405 0.42
406 0.36
407 0.28
408 0.3
409 0.28
410 0.36
411 0.41
412 0.45
413 0.47
414 0.51
415 0.55
416 0.52
417 0.55
418 0.53
419 0.54
420 0.54
421 0.58
422 0.6
423 0.6
424 0.6
425 0.55
426 0.48
427 0.4
428 0.33
429 0.25
430 0.24
431 0.23
432 0.24
433 0.29
434 0.37
435 0.4
436 0.43
437 0.47
438 0.46
439 0.51
440 0.56
441 0.6
442 0.63
443 0.69
444 0.74
445 0.76
446 0.8
447 0.74
448 0.72
449 0.68
450 0.57
451 0.47
452 0.38
453 0.3
454 0.21
455 0.19
456 0.12
457 0.06
458 0.05
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.07
464 0.08
465 0.15
466 0.17
467 0.23
468 0.24
469 0.34
470 0.4
471 0.44
472 0.49
473 0.52
474 0.52
475 0.48
476 0.52
477 0.43
478 0.4
479 0.35
480 0.31
481 0.23
482 0.22
483 0.19
484 0.17
485 0.16
486 0.14
487 0.13
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.12
492 0.1
493 0.11
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.11
499 0.09
500 0.08
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.11
505 0.15
506 0.19
507 0.21
508 0.22
509 0.26
510 0.29
511 0.3
512 0.26
513 0.23
514 0.17
515 0.17
516 0.2
517 0.21
518 0.18
519 0.18
520 0.19
521 0.19
522 0.2
523 0.24
524 0.22
525 0.2
526 0.22
527 0.23
528 0.3
529 0.32
530 0.31
531 0.27
532 0.32
533 0.36
534 0.38
535 0.4
536 0.38
537 0.35
538 0.35
539 0.33
540 0.28
541 0.22
542 0.27
543 0.26
544 0.21
545 0.21
546 0.2
547 0.2
548 0.2
549 0.22
550 0.18
551 0.22
552 0.26
553 0.28
554 0.29
555 0.29
556 0.28
557 0.25
558 0.22
559 0.18
560 0.15
561 0.14
562 0.15
563 0.16
564 0.16
565 0.16
566 0.14
567 0.13
568 0.11
569 0.12
570 0.11
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.15
575 0.15
576 0.16
577 0.2
578 0.25
579 0.25
580 0.31
581 0.34
582 0.36
583 0.36
584 0.44
585 0.4
586 0.4
587 0.43
588 0.4
589 0.36
590 0.39
591 0.39
592 0.33
593 0.33
594 0.36
595 0.35
596 0.35
597 0.35
598 0.33
599 0.32
600 0.34
601 0.35
602 0.29
603 0.27
604 0.29
605 0.3
606 0.27
607 0.3
608 0.29
609 0.28
610 0.32
611 0.34
612 0.39
613 0.45
614 0.5
615 0.5
616 0.51
617 0.61
618 0.65
619 0.7
620 0.69
621 0.69
622 0.71
623 0.75
624 0.74
625 0.72
626 0.69
627 0.71
628 0.65
629 0.66
630 0.63
631 0.62
632 0.63
633 0.58
634 0.6
635 0.52
636 0.52
637 0.44
638 0.41
639 0.35
640 0.29
641 0.26
642 0.18
643 0.18
644 0.14
645 0.13
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.12
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.11
656 0.13
657 0.18
658 0.26
659 0.31
660 0.38
661 0.44
662 0.48
663 0.49
664 0.52
665 0.5
666 0.51
667 0.49
668 0.44
669 0.37
670 0.34
671 0.3
672 0.25
673 0.2
674 0.1
675 0.08
676 0.06
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.08
684 0.1
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.13
689 0.16
690 0.18
691 0.2
692 0.17
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.14
697 0.11
698 0.11
699 0.09
700 0.11
701 0.1
702 0.1
703 0.1
704 0.12
705 0.13
706 0.12
707 0.12
708 0.11
709 0.12
710 0.11
711 0.11
712 0.1
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.1
717 0.11
718 0.15
719 0.21
720 0.23
721 0.23
722 0.26
723 0.33
724 0.39
725 0.43
726 0.46
727 0.46
728 0.47
729 0.55
730 0.62
731 0.59
732 0.55
733 0.56
734 0.5
735 0.45
736 0.43
737 0.37
738 0.34
739 0.3
740 0.28
741 0.28
742 0.28
743 0.26
744 0.28
745 0.27
746 0.22
747 0.24
748 0.28
749 0.26
750 0.29
751 0.32
752 0.34
753 0.38
754 0.42
755 0.46
756 0.48
757 0.47
758 0.45
759 0.49
760 0.52
761 0.55
762 0.52
763 0.48
764 0.47
765 0.47
766 0.46
767 0.46
768 0.45
769 0.41
770 0.45
771 0.45
772 0.37
773 0.38
774 0.36
775 0.31
776 0.26
777 0.23
778 0.17
779 0.18
780 0.21
781 0.21
782 0.24
783 0.31
784 0.3
785 0.36
786 0.42
787 0.4
788 0.39
789 0.37
790 0.35
791 0.3
792 0.31
793 0.29
794 0.23
795 0.24
796 0.23
797 0.23
798 0.23
799 0.22
800 0.2
801 0.19
802 0.2
803 0.25
804 0.27
805 0.28
806 0.27
807 0.25
808 0.25
809 0.22
810 0.2
811 0.14
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.11
816 0.15
817 0.19
818 0.19
819 0.2
820 0.2
821 0.22
822 0.29
823 0.32
824 0.37
825 0.37
826 0.42
827 0.41
828 0.41
829 0.38
830 0.32
831 0.28
832 0.19
833 0.15
834 0.11
835 0.09
836 0.08
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.06
842 0.06
843 0.07
844 0.08
845 0.07
846 0.07
847 0.07
848 0.08
849 0.08
850 0.09
851 0.1
852 0.11
853 0.14
854 0.15
855 0.16
856 0.18
857 0.18
858 0.19
859 0.2
860 0.2
861 0.25
862 0.25
863 0.25
864 0.27
865 0.27
866 0.28
867 0.29
868 0.27
869 0.21
870 0.21
871 0.2
872 0.16
873 0.16
874 0.16
875 0.14
876 0.15
877 0.15
878 0.15
879 0.2
880 0.23
881 0.25
882 0.23
883 0.24
884 0.25
885 0.25
886 0.28
887 0.3
888 0.31
889 0.35
890 0.39
891 0.41
892 0.41
893 0.38
894 0.36
895 0.33
896 0.3
897 0.32
898 0.34
899 0.33
900 0.37
901 0.43
902 0.45
903 0.51
904 0.56
905 0.57
906 0.6
907 0.63
908 0.61
909 0.64
910 0.7
911 0.66
912 0.6
913 0.53
914 0.44
915 0.41
916 0.4
917 0.32
918 0.24
919 0.21
920 0.21
921 0.19
922 0.21
923 0.19
924 0.18
925 0.17
926 0.16
927 0.14
928 0.13
929 0.13
930 0.11
931 0.13
932 0.15
933 0.16
934 0.16
935 0.17
936 0.17
937 0.18
938 0.16
939 0.14
940 0.14
941 0.21
942 0.21
943 0.23
944 0.26
945 0.33
946 0.4
947 0.44
948 0.49
949 0.47
950 0.48
951 0.49
952 0.53
953 0.48
954 0.44
955 0.46
956 0.44
957 0.41
958 0.4