Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M371

Protein Details
Accession C5M371    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-46SSTSEALKNIKNKQRRQKVFAELKHEKNKERHKLRSERAKEERLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-42KNKQRRQKVFAELKHEKNKERHKLRSERAKE
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 14, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG ctp:CTRG_00510  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSSTSEALKNIKNKQRRQKVFAELKHEKNKERHKLRSERAKEERLNPELREQRIAENIPATIDSKRVFDETIAAEVEGDDEFGNYFRNLLEEPKILLTTNANAKKPAYEFADMIMDFLPNTTFIKRKKEYTMQDMAKFCSNRGYTTLMVINEDKKKVNGITMINLPEGPTFYFSVTSITDGKRIKGHGKAGDYLPEIILNNFNSRLGKTVGRLFQSIFPHKPELQGRQVITLHNQRDYIFFRRHRYIFRNEEKVGLQELGPQFTLKLRRMQKGVRGDVVWEHRPDMERDKRKFYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.81
3 0.84
4 0.83
5 0.82
6 0.84
7 0.84
8 0.8
9 0.8
10 0.77
11 0.77
12 0.8
13 0.77
14 0.74
15 0.73
16 0.78
17 0.78
18 0.79
19 0.8
20 0.8
21 0.85
22 0.87
23 0.88
24 0.86
25 0.85
26 0.84
27 0.83
28 0.79
29 0.77
30 0.76
31 0.71
32 0.68
33 0.59
34 0.6
35 0.57
36 0.54
37 0.5
38 0.43
39 0.4
40 0.41
41 0.41
42 0.34
43 0.28
44 0.26
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.13
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.17
57 0.15
58 0.16
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.1
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.21
87 0.24
88 0.24
89 0.25
90 0.25
91 0.27
92 0.27
93 0.27
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.22
99 0.19
100 0.19
101 0.15
102 0.11
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.05
107 0.06
108 0.08
109 0.12
110 0.16
111 0.25
112 0.27
113 0.31
114 0.37
115 0.44
116 0.47
117 0.49
118 0.55
119 0.5
120 0.53
121 0.5
122 0.45
123 0.41
124 0.37
125 0.3
126 0.28
127 0.24
128 0.2
129 0.21
130 0.23
131 0.18
132 0.2
133 0.22
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.17
139 0.19
140 0.17
141 0.15
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.16
148 0.18
149 0.19
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.12
154 0.12
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.2
170 0.22
171 0.24
172 0.26
173 0.32
174 0.31
175 0.33
176 0.34
177 0.33
178 0.34
179 0.31
180 0.26
181 0.21
182 0.17
183 0.15
184 0.13
185 0.15
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.23
197 0.26
198 0.27
199 0.28
200 0.27
201 0.3
202 0.35
203 0.38
204 0.34
205 0.34
206 0.37
207 0.36
208 0.41
209 0.41
210 0.41
211 0.41
212 0.44
213 0.41
214 0.41
215 0.42
216 0.37
217 0.38
218 0.39
219 0.36
220 0.32
221 0.33
222 0.28
223 0.32
224 0.35
225 0.35
226 0.36
227 0.39
228 0.44
229 0.51
230 0.54
231 0.58
232 0.59
233 0.62
234 0.64
235 0.67
236 0.69
237 0.61
238 0.61
239 0.55
240 0.5
241 0.43
242 0.34
243 0.25
244 0.23
245 0.24
246 0.22
247 0.22
248 0.19
249 0.17
250 0.22
251 0.29
252 0.25
253 0.32
254 0.38
255 0.44
256 0.51
257 0.56
258 0.6
259 0.63
260 0.66
261 0.62
262 0.55
263 0.5
264 0.51
265 0.52
266 0.49
267 0.4
268 0.36
269 0.34
270 0.37
271 0.39
272 0.42
273 0.46
274 0.5
275 0.54