FuNGI

C5M3H3

Protein Details

Accession

C5M3H3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-60	LKKFTEIYKKSNNSNKQKLRRHKGKVLEILHN	Hydrophilic
87-115	AKKVSNNNTRMNNKKKKKTKTDMEMIIDK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
44-52	KQKLRRHKG
100-104	KKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
KEGG	ctp:CTRG_00612 -
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MFEDITFRNKDHIRVSRTSRQLLSKYKELKKFTEIYKKSNNSNKQKLRRHKGKVLEILHNELNKKLKPEETYEIWHDLANVLNKNVAKKVSNNNTRMNNKKKKKTKTDMEMIIDKENNSDTVIDKVNSFLEKSGNGDIEEFEENDHRYEEYDIIMSNKLNQFLNNFDNSNRLSKSKFIIESNGLEILPIEDDKDQSKSIFNHHLKNLTNLLHLQIMKQNWKQSYKIFSILIRFPQVDLRSIWPLGIEILLHMNEIHQKNNLWSLKVKKFFNYLSSFYSISNVNATTNSKVNNRSNVAPVWRSGSKTLTPMYIITSLWYLFILQDYEQVMNRINELILEPPYNLEGVLYFIASLCSLCNGFKIVEAWKIQNEDMVKFTNEMNQPIRSQHQVSEELNKIEKDIMNYLKKCTELQFIFPKEQIEQELKHLHHAVQEKKNITNESSSSENEEQENESDDLDWGAISSDSSENENEEEEEDDKTEEARNKSQISLLASNQPTQLDDINYNHYSDHDEEDEQEEHETEKESRRESLKQIDMTDDNITMNGHSLEKDDVSFDEIPATQPIILPDTQPIEYQDYQKDINMRGEDDDEEEEEEEEDYVNNNNNFGSFDTRRNSLELYSTKSSSVEPDLKRNIQSQNESQQTMLDFDFDFDSDSN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.64
3	0.66
4	0.7
5	0.71
6	0.67
7	0.66
8	0.67
9	0.69
10	0.67
11	0.67
12	0.7
13	0.73
14	0.75
15	0.73
16	0.7
17	0.67
18	0.67
19	0.67
20	0.68
21	0.64
22	0.63
23	0.69
24	0.69
25	0.71
26	0.74
27	0.75
28	0.75
29	0.81
30	0.84
31	0.84
32	0.89
33	0.91
34	0.92
35	0.92
36	0.91
37	0.89
38	0.89
39	0.88
40	0.87
41	0.82
42	0.8
43	0.73
44	0.69
45	0.64
46	0.58
47	0.49
48	0.44
49	0.44
50	0.37
51	0.38
52	0.37
53	0.38
54	0.38
55	0.44
56	0.46
57	0.44
58	0.48
59	0.48
60	0.47
61	0.42
62	0.38
63	0.31
64	0.25
65	0.25
66	0.24
67	0.22
68	0.19
69	0.22
70	0.24
71	0.26
72	0.28
73	0.28
74	0.25
75	0.3
76	0.4
77	0.47
78	0.55
79	0.58
80	0.62
81	0.68
82	0.74
83	0.78
84	0.78
85	0.78
86	0.79
87	0.85
88	0.87
89	0.88
90	0.91
91	0.91
92	0.91
93	0.9
94	0.89
95	0.86
96	0.82
97	0.77
98	0.68
99	0.62
100	0.53
101	0.43
102	0.34
103	0.27
104	0.22
105	0.17
106	0.16
107	0.12
108	0.14
109	0.17
110	0.16
111	0.15
112	0.16
113	0.18
114	0.18
115	0.17
116	0.15
117	0.14
118	0.14
119	0.17
120	0.19
121	0.18
122	0.17
123	0.17
124	0.16
125	0.17
126	0.17
127	0.14
128	0.12
129	0.14
130	0.15
131	0.15
132	0.15
133	0.12
134	0.12
135	0.14
136	0.14
137	0.12
138	0.12
139	0.11
140	0.12
141	0.14
142	0.12
143	0.16
144	0.18
145	0.19
146	0.19
147	0.19
148	0.19
149	0.22
150	0.26
151	0.23
152	0.23
153	0.21
154	0.24
155	0.25
156	0.28
157	0.25
158	0.24
159	0.23
160	0.25
161	0.28
162	0.3
163	0.31
164	0.28
165	0.31
166	0.32
167	0.32
168	0.31
169	0.29
170	0.22
171	0.18
172	0.17
173	0.12
174	0.1
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.1
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.17
184	0.17
185	0.21
186	0.31
187	0.33
188	0.38
189	0.4
190	0.45
191	0.42
192	0.44
193	0.43
194	0.34
195	0.32
196	0.26
197	0.24
198	0.22
199	0.21
200	0.19
201	0.19
202	0.2
203	0.25
204	0.28
205	0.32
206	0.33
207	0.36
208	0.37
209	0.37
210	0.41
211	0.37
212	0.38
213	0.34
214	0.31
215	0.32
216	0.32
217	0.3
218	0.26
219	0.23
220	0.21
221	0.24
222	0.23
223	0.21
224	0.2
225	0.2
226	0.2
227	0.2
228	0.19
229	0.14
230	0.13
231	0.11
232	0.1
233	0.07
234	0.04
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.12
241	0.14
242	0.14
243	0.14
244	0.15
245	0.16
246	0.25
247	0.25
248	0.2
249	0.24
250	0.31
251	0.37
252	0.43
253	0.43
254	0.37
255	0.4
256	0.4
257	0.42
258	0.38
259	0.33
260	0.3
261	0.31
262	0.3
263	0.25
264	0.26
265	0.2
266	0.16
267	0.14
268	0.11
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.13
274	0.15
275	0.17
276	0.23
277	0.26
278	0.3
279	0.31
280	0.31
281	0.32
282	0.31
283	0.31
284	0.25
285	0.23
286	0.22
287	0.21
288	0.2
289	0.19
290	0.2
291	0.18
292	0.2
293	0.2
294	0.16
295	0.15
296	0.14
297	0.15
298	0.13
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.08
349	0.09
350	0.13
351	0.14
352	0.15
353	0.16
354	0.17
355	0.17
356	0.18
357	0.17
358	0.14
359	0.14
360	0.15
361	0.14
362	0.13
363	0.13
364	0.17
365	0.17
366	0.2
367	0.21
368	0.21
369	0.22
370	0.23
371	0.25
372	0.22
373	0.22
374	0.21
375	0.23
376	0.25
377	0.26
378	0.3
379	0.3
380	0.28
381	0.29
382	0.26
383	0.22
384	0.2
385	0.2
386	0.15
387	0.18
388	0.23
389	0.28
390	0.29
391	0.31
392	0.3
393	0.3
394	0.3
395	0.27
396	0.28
397	0.22
398	0.27
399	0.33
400	0.33
401	0.35
402	0.34
403	0.33
404	0.26
405	0.26
406	0.24
407	0.19
408	0.18
409	0.2
410	0.25
411	0.24
412	0.27
413	0.27
414	0.24
415	0.26
416	0.32
417	0.36
418	0.37
419	0.42
420	0.42
421	0.44
422	0.47
423	0.44
424	0.38
425	0.33
426	0.28
427	0.25
428	0.25
429	0.23
430	0.25
431	0.25
432	0.24
433	0.21
434	0.22
435	0.19
436	0.17
437	0.2
438	0.15
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.11
443	0.09
444	0.08
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.06
450	0.07
451	0.07
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.09
465	0.1
466	0.13
467	0.18
468	0.21
469	0.25
470	0.29
471	0.3
472	0.31
473	0.32
474	0.31
475	0.31
476	0.31
477	0.28
478	0.32
479	0.31
480	0.32
481	0.31
482	0.27
483	0.22
484	0.2
485	0.21
486	0.14
487	0.17
488	0.17
489	0.23
490	0.23
491	0.23
492	0.21
493	0.2
494	0.22
495	0.2
496	0.22
497	0.17
498	0.17
499	0.18
500	0.22
501	0.22
502	0.19
503	0.18
504	0.15
505	0.13
506	0.13
507	0.15
508	0.14
509	0.2
510	0.24
511	0.25
512	0.3
513	0.34
514	0.38
515	0.41
516	0.48
517	0.47
518	0.47
519	0.46
520	0.46
521	0.42
522	0.4
523	0.36
524	0.27
525	0.2
526	0.17
527	0.16
528	0.11
529	0.12
530	0.1
531	0.09
532	0.09
533	0.1
534	0.12
535	0.12
536	0.13
537	0.12
538	0.12
539	0.16
540	0.16
541	0.14
542	0.15
543	0.15
544	0.16
545	0.16
546	0.16
547	0.12
548	0.12
549	0.13
550	0.14
551	0.14
552	0.14
553	0.15
554	0.18
555	0.19
556	0.18
557	0.2
558	0.23
559	0.25
560	0.29
561	0.3
562	0.29
563	0.3
564	0.31
565	0.33
566	0.3
567	0.35
568	0.32
569	0.3
570	0.29
571	0.3
572	0.28
573	0.26
574	0.25
575	0.19
576	0.18
577	0.17
578	0.15
579	0.14
580	0.13
581	0.1
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.1
586	0.15
587	0.15
588	0.15
589	0.15
590	0.16
591	0.17
592	0.18
593	0.24
594	0.21
595	0.28
596	0.31
597	0.34
598	0.35
599	0.36
600	0.36
601	0.29
602	0.34
603	0.31
604	0.35
605	0.36
606	0.36
607	0.34
608	0.34
609	0.33
610	0.29
611	0.33
612	0.34
613	0.33
614	0.41
615	0.48
616	0.52
617	0.54
618	0.56
619	0.56
620	0.56
621	0.59
622	0.58
623	0.6
624	0.61
625	0.59
626	0.53
627	0.48
628	0.41
629	0.36
630	0.29
631	0.21
632	0.15
633	0.15
634	0.17
635	0.14

C5M3H3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer