FuNGI

C5MH71

Protein Details

Accession

C5MH71

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-34	QNDFLETNRKKKQEKKRRKTIQLQYQDPFP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-23	RKKKQEKKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	ctp:CTRG_05425 -

Amino Acid Sequences

MNSEQNDFLETNRKKKQEKKRRKTIQLQYQDPFPSQILFHHCIMSSIGSKDQFVSQITNQSIFKHFLDSNTSKEELSSPLPYNRLVCRGNSDVFFVSNNLVRCCTINPDTTNYKLLKVVNPFYEIISLLMNKSGTLLALIGEQEIDVVTLPANVVKGDGVYVDGSSFKIQNLTGKIRKCVWQTTAANDSMLVVLNDNSEIKAFDLTKSLEVPIINIDLKTLDNFKNQEATSIAFGSDQNLAGGLTLYVSTKSSIFAVYPFTTSSTKLVTTEEAIDVALQDTKAAMELIQEKYPTNLTEIATSPMNKAALKQFDYYLNIKNQLSGTVPIVKEVRDVYTNNPYELFVVQQNLNDFEGPVLQGPIVSVGSDIQDITSFGDNPFISFMASVGDNAVVNYYAQLAPMLMKYRASGDVSDESKESTPVVLTPRYIKPRKGFGFVDNTEIEERALVKQTQSQASFWKEELSVLDLLHTDKLPADDTNTTNNNNNSNKKLPTYFGSLDEFRFTIFMASKKIVIVDCTWVKDFVNDLVGNKVDDVAVAPHYGVASEEPEPILAFTYIKDKITSTGEYLLVFRSKTKDDLEVIQIVNTAPEDLTTEPKEILRLTDKVQSNAGLTYKAPSPFDELLAELQNLSKIKIATGGIQGNTGLDKGNVDDLENLNKLSINTIQLAKEYSIFGIKLQTRILSNLDSLKEQKSILNKIKSQCEPNDSEIKKGEEDKLTKLADRQEKLDKRFVDLQKKIYDALNKYNKERSLPISDAESSWFKEIDSIDQSVNTGVKDEVSLTEKIERLSSQVKSVLESSKAKDSKTSEVTPVEQLELERKLSKLKHWLIREDKAIQALKDKLTASLKLVDEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.68
3	0.77
4	0.78
5	0.85
6	0.87
7	0.89
8	0.93
9	0.95
10	0.95
11	0.95
12	0.94
13	0.93
14	0.9
15	0.82
16	0.77
17	0.7
18	0.6
19	0.52
20	0.42
21	0.33
22	0.25
23	0.28
24	0.29
25	0.3
26	0.3
27	0.3
28	0.29
29	0.28
30	0.29
31	0.27
32	0.23
33	0.21
34	0.25
35	0.23
36	0.24
37	0.24
38	0.25
39	0.24
40	0.22
41	0.25
42	0.23
43	0.29
44	0.31
45	0.33
46	0.32
47	0.32
48	0.34
49	0.33
50	0.31
51	0.29
52	0.28
53	0.26
54	0.35
55	0.34
56	0.35
57	0.37
58	0.37
59	0.31
60	0.31
61	0.3
62	0.25
63	0.26
64	0.27
65	0.26
66	0.29
67	0.31
68	0.32
69	0.35
70	0.34
71	0.38
72	0.34
73	0.32
74	0.35
75	0.38
76	0.4
77	0.37
78	0.36
79	0.3
80	0.29
81	0.28
82	0.22
83	0.2
84	0.2
85	0.22
86	0.2
87	0.2
88	0.2
89	0.21
90	0.21
91	0.25
92	0.26
93	0.29
94	0.31
95	0.35
96	0.39
97	0.41
98	0.45
99	0.39
100	0.37
101	0.35
102	0.35
103	0.35
104	0.37
105	0.39
106	0.36
107	0.38
108	0.37
109	0.33
110	0.32
111	0.26
112	0.2
113	0.17
114	0.15
115	0.12
116	0.13
117	0.12
118	0.11
119	0.11
120	0.11
121	0.09
122	0.08
123	0.08
124	0.06
125	0.07
126	0.07
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.05
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.1
153	0.1
154	0.09
155	0.11
156	0.12
157	0.17
158	0.22
159	0.3
160	0.34
161	0.37
162	0.41
163	0.42
164	0.48
165	0.46
166	0.47
167	0.42
168	0.46
169	0.44
170	0.46
171	0.48
172	0.42
173	0.38
174	0.31
175	0.28
176	0.19
177	0.18
178	0.12
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.07
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.14
192	0.15
193	0.16
194	0.17
195	0.17
196	0.16
197	0.15
198	0.15
199	0.13
200	0.14
201	0.13
202	0.12
203	0.12
204	0.1
205	0.11
206	0.12
207	0.15
208	0.14
209	0.19
210	0.21
211	0.22
212	0.27
213	0.26
214	0.27
215	0.23
216	0.22
217	0.19
218	0.18
219	0.17
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.1
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.05
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.12
244	0.12
245	0.13
246	0.13
247	0.15
248	0.16
249	0.16
250	0.17
251	0.14
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.13
256	0.14
257	0.14
258	0.13
259	0.11
260	0.1
261	0.1
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.11
274	0.13
275	0.14
276	0.15
277	0.15
278	0.16
279	0.18
280	0.16
281	0.13
282	0.14
283	0.13
284	0.15
285	0.16
286	0.17
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.15
291	0.16
292	0.13
293	0.14
294	0.18
295	0.21
296	0.23
297	0.23
298	0.23
299	0.24
300	0.28
301	0.29
302	0.28
303	0.25
304	0.27
305	0.25
306	0.25
307	0.23
308	0.2
309	0.2
310	0.16
311	0.15
312	0.17
313	0.17
314	0.17
315	0.18
316	0.17
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.13
321	0.14
322	0.16
323	0.25
324	0.25
325	0.24
326	0.24
327	0.22
328	0.21
329	0.2
330	0.18
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.13
338	0.12
339	0.11
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.07
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.11
367	0.09
368	0.09
369	0.08
370	0.08
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.07
389	0.09
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.1
394	0.11
395	0.12
396	0.11
397	0.11
398	0.15
399	0.16
400	0.17
401	0.15
402	0.15
403	0.14
404	0.14
405	0.11
406	0.07
407	0.06
408	0.07
409	0.1
410	0.09
411	0.1
412	0.14
413	0.19
414	0.28
415	0.3
416	0.33
417	0.34
418	0.43
419	0.45
420	0.46
421	0.42
422	0.37
423	0.43
424	0.38
425	0.39
426	0.29
427	0.28
428	0.23
429	0.22
430	0.18
431	0.1
432	0.1
433	0.07
434	0.09
435	0.08
436	0.09
437	0.12
438	0.15
439	0.18
440	0.19
441	0.19
442	0.21
443	0.23
444	0.24
445	0.21
446	0.2
447	0.16
448	0.15
449	0.15
450	0.13
451	0.11
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.08
462	0.07
463	0.09
464	0.11
465	0.13
466	0.18
467	0.19
468	0.2
469	0.22
470	0.24
471	0.28
472	0.31
473	0.33
474	0.33
475	0.35
476	0.35
477	0.34
478	0.34
479	0.29
480	0.27
481	0.3
482	0.27
483	0.25
484	0.27
485	0.25
486	0.24
487	0.24
488	0.21
489	0.14
490	0.13
491	0.1
492	0.09
493	0.09
494	0.1
495	0.12
496	0.12
497	0.13
498	0.13
499	0.14
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.15
504	0.16
505	0.17
506	0.18
507	0.17
508	0.17
509	0.16
510	0.16
511	0.11
512	0.14
513	0.12
514	0.12
515	0.14
516	0.14
517	0.13
518	0.12
519	0.12
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.05
532	0.06
533	0.07
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.11
544	0.12
545	0.12
546	0.13
547	0.12
548	0.15
549	0.18
550	0.19
551	0.16
552	0.17
553	0.17
554	0.17
555	0.17
556	0.16
557	0.15
558	0.14
559	0.13
560	0.14
561	0.15
562	0.17
563	0.19
564	0.21
565	0.21
566	0.24
567	0.25
568	0.26
569	0.24
570	0.21
571	0.2
572	0.16
573	0.15
574	0.11
575	0.09
576	0.05
577	0.05
578	0.07
579	0.07
580	0.12
581	0.13
582	0.14
583	0.14
584	0.15
585	0.16
586	0.15
587	0.17
588	0.17
589	0.17
590	0.19
591	0.26
592	0.28
593	0.28
594	0.29
595	0.26
596	0.23
597	0.23
598	0.21
599	0.15
600	0.13
601	0.14
602	0.16
603	0.18
604	0.17
605	0.16
606	0.22
607	0.22
608	0.23
609	0.21
610	0.18
611	0.18
612	0.19
613	0.18
614	0.11
615	0.11
616	0.13
617	0.12
618	0.12
619	0.13
620	0.11
621	0.11
622	0.15
623	0.15
624	0.15
625	0.2
626	0.22
627	0.2
628	0.2
629	0.2
630	0.17
631	0.16
632	0.14
633	0.09
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.13
641	0.14
642	0.18
643	0.18
644	0.18
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.14
649	0.15
650	0.13
651	0.15
652	0.17
653	0.17
654	0.17
655	0.19
656	0.17
657	0.16
658	0.15
659	0.13
660	0.13
661	0.13
662	0.12
663	0.18
664	0.19
665	0.2
666	0.21
667	0.22
668	0.21
669	0.23
670	0.25
671	0.19
672	0.19
673	0.21
674	0.22
675	0.22
676	0.24
677	0.24
678	0.23
679	0.22
680	0.24
681	0.26
682	0.34
683	0.4
684	0.45
685	0.48
686	0.52
687	0.6
688	0.62
689	0.62
690	0.58
691	0.56
692	0.52
693	0.52
694	0.57
695	0.49
696	0.49
697	0.46
698	0.43
699	0.39
700	0.38
701	0.38
702	0.36
703	0.38
704	0.38
705	0.41
706	0.39
707	0.38
708	0.39
709	0.42
710	0.43
711	0.42
712	0.43
713	0.47
714	0.54
715	0.57
716	0.61
717	0.54
718	0.51
719	0.58
720	0.62
721	0.62
722	0.59
723	0.61
724	0.57
725	0.58
726	0.53
727	0.48
728	0.47
729	0.41
730	0.46
731	0.49
732	0.49
733	0.52
734	0.57
735	0.55
736	0.52
737	0.52
738	0.47
739	0.46
740	0.44
741	0.41
742	0.38
743	0.37
744	0.33
745	0.33
746	0.29
747	0.23
748	0.23
749	0.21
750	0.17
751	0.19
752	0.19
753	0.21
754	0.22
755	0.23
756	0.21
757	0.22
758	0.22
759	0.21
760	0.21
761	0.15
762	0.13
763	0.11
764	0.11
765	0.11
766	0.12
767	0.13
768	0.15
769	0.16
770	0.16
771	0.21
772	0.22
773	0.23
774	0.24
775	0.21
776	0.23
777	0.28
778	0.28
779	0.27
780	0.31
781	0.3
782	0.3
783	0.33
784	0.33
785	0.32
786	0.35
787	0.34
788	0.4
789	0.42
790	0.4
791	0.43
792	0.43
793	0.46
794	0.49
795	0.49
796	0.45
797	0.47
798	0.49
799	0.47
800	0.44
801	0.36
802	0.3
803	0.27
804	0.27
805	0.26
806	0.26
807	0.25
808	0.24
809	0.3
810	0.32
811	0.38
812	0.43
813	0.49
814	0.55
815	0.58
816	0.68
817	0.69
818	0.72
819	0.72
820	0.65
821	0.59
822	0.58
823	0.55
824	0.46
825	0.45
826	0.43
827	0.38
828	0.39
829	0.36
830	0.35
831	0.35
832	0.36
833	0.33
834	0.35

C5MH71

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer