Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MA29

Protein Details
Accession C5MA29    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1036-1059ELKQKITEFKQSKKQEKLDQEDVVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0031398  P:positive regulation of protein ubiquitination  
GO:0070936  P:protein K48-linked ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG ctp:CTRG_02341  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSSADEIRAKRLARLAAMSSSSSSSTQQSPANQESNTQPTNQPSPTIDSSEKSQPIVKPEPEKPATPVKTPVDQSLPKEDQISQWIRLELEYIFQATIKSSDSNTKGLIFLPNLAYEITEASVKLNEDHIESIFMEILTEVGIPKRYKIPMEYLYTVYHGAFKAKRTLPVKASFYEDKIAFLNKVISLSTSYASMGFQVPDMFLNNDLRQSLDFFINRFGDVSSFLMDIIQFSIEDESLLELLNLFFPYISAKLQRANLGERTYLNYISIFQSLVSLKPVAAIFSQIQGFQPPDINNPLDYEQKTLLGPLLRISPLLNEMGICYFEGDVSSMTPAQLNNTYGSIVSELKVIIDHMLAIVDKLIRGSAKTREDLLKWFAKLINLSHLRRGSHANFEKLPSDGIMYNISMVLIRLSLPFLDHPTFGKIDKIDVNYFLKSNLIDISEESRVNSTIEEANNYYSEKKAAASPEELAAPNFISDCFNLTLAYLHYGMGGIFNKYERISRQIQQMEPRLATLESGGAIPGVTPAMANSMRRELPRFKNDMRLLRTRKQVVKAVFNDRSLQLEVFDFVIGAVTFITRMIDSKHQYPLVKLSIPIFKISNISQLDDHEFLKTKTPEPWKYYPEFILEGIINYCKFSANYIGCPLVSNEDKLNIFVELSTILLRCPELIGNPHMKANLVELLYIGSLPMQNGNPGFMANIFNGNRMVMDNILYSLLDFYVMVEKTGASSQFYDKFNSRYYISVILEELWKNPRYRFQLTDYSKNNVDFFIRFIARMLNDTTYLLDETFNCLNSIHDLQQELKKRQAQGEADETMGTDEELSNNLEENERKVKSYMGLSNKTMELFKLFTEEVPSGFVLPEIVDRLAGMLDYNLSIMVGPKCSNLKVAEPEKYGFEPKKILTDLVQIYVNLSTQPAFVTAVARDGRSFNISYFKKAENILRTKTFVKNEVINTLVEFANQAETTRVAEENEELELGEIPDEFLDPLMFTLMEDPVILPSSKISIDRSTIKAHLLSDSTDPFNRMPLKLEDVIDDVELKQKITEFKQSKKQEKLDQEDVVMKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.36
3 0.34
4 0.36
5 0.33
6 0.28
7 0.27
8 0.25
9 0.22
10 0.21
11 0.2
12 0.21
13 0.24
14 0.27
15 0.31
16 0.36
17 0.41
18 0.44
19 0.41
20 0.41
21 0.43
22 0.47
23 0.43
24 0.39
25 0.36
26 0.38
27 0.44
28 0.42
29 0.39
30 0.34
31 0.4
32 0.4
33 0.42
34 0.39
35 0.34
36 0.38
37 0.43
38 0.42
39 0.37
40 0.4
41 0.37
42 0.42
43 0.48
44 0.5
45 0.49
46 0.53
47 0.61
48 0.59
49 0.58
50 0.54
51 0.56
52 0.54
53 0.5
54 0.53
55 0.47
56 0.51
57 0.51
58 0.52
59 0.5
60 0.5
61 0.51
62 0.52
63 0.5
64 0.44
65 0.45
66 0.41
67 0.35
68 0.4
69 0.4
70 0.34
71 0.34
72 0.34
73 0.32
74 0.31
75 0.29
76 0.2
77 0.18
78 0.15
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.22
89 0.25
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.26
94 0.26
95 0.29
96 0.21
97 0.21
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.18
102 0.17
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.13
121 0.12
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.13
130 0.14
131 0.16
132 0.23
133 0.25
134 0.28
135 0.31
136 0.37
137 0.38
138 0.45
139 0.45
140 0.42
141 0.4
142 0.38
143 0.36
144 0.28
145 0.25
146 0.18
147 0.21
148 0.21
149 0.23
150 0.3
151 0.32
152 0.4
153 0.41
154 0.47
155 0.48
156 0.54
157 0.55
158 0.47
159 0.51
160 0.46
161 0.45
162 0.44
163 0.37
164 0.3
165 0.28
166 0.28
167 0.22
168 0.2
169 0.21
170 0.15
171 0.16
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.18
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.23
203 0.23
204 0.22
205 0.2
206 0.18
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.14
240 0.18
241 0.21
242 0.25
243 0.26
244 0.29
245 0.32
246 0.31
247 0.31
248 0.28
249 0.3
250 0.28
251 0.25
252 0.22
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.16
257 0.12
258 0.09
259 0.12
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.11
264 0.1
265 0.13
266 0.13
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.12
278 0.16
279 0.14
280 0.17
281 0.2
282 0.21
283 0.19
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.24
288 0.23
289 0.2
290 0.2
291 0.2
292 0.18
293 0.18
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.05
351 0.07
352 0.1
353 0.16
354 0.2
355 0.21
356 0.24
357 0.26
358 0.27
359 0.3
360 0.32
361 0.29
362 0.26
363 0.27
364 0.25
365 0.23
366 0.23
367 0.21
368 0.25
369 0.27
370 0.28
371 0.32
372 0.34
373 0.32
374 0.33
375 0.38
376 0.31
377 0.34
378 0.37
379 0.36
380 0.34
381 0.35
382 0.35
383 0.29
384 0.27
385 0.17
386 0.15
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.13
413 0.14
414 0.17
415 0.19
416 0.17
417 0.2
418 0.22
419 0.2
420 0.2
421 0.18
422 0.15
423 0.12
424 0.12
425 0.1
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.11
430 0.13
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.09
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.14
445 0.13
446 0.1
447 0.11
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.12
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.12
459 0.11
460 0.09
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.09
474 0.07
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.06
479 0.07
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.1
487 0.09
488 0.14
489 0.18
490 0.21
491 0.28
492 0.31
493 0.33
494 0.38
495 0.41
496 0.38
497 0.34
498 0.31
499 0.24
500 0.2
501 0.18
502 0.12
503 0.07
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.04
508 0.04
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.02
514 0.02
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.11
520 0.13
521 0.14
522 0.18
523 0.22
524 0.29
525 0.35
526 0.39
527 0.38
528 0.46
529 0.5
530 0.53
531 0.51
532 0.53
533 0.53
534 0.53
535 0.58
536 0.55
537 0.54
538 0.51
539 0.52
540 0.46
541 0.48
542 0.46
543 0.48
544 0.45
545 0.41
546 0.39
547 0.33
548 0.33
549 0.25
550 0.21
551 0.14
552 0.11
553 0.1
554 0.09
555 0.08
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.04
566 0.03
567 0.04
568 0.06
569 0.12
570 0.14
571 0.17
572 0.2
573 0.23
574 0.24
575 0.24
576 0.27
577 0.24
578 0.22
579 0.2
580 0.2
581 0.21
582 0.21
583 0.21
584 0.17
585 0.15
586 0.17
587 0.16
588 0.2
589 0.17
590 0.18
591 0.17
592 0.18
593 0.2
594 0.19
595 0.19
596 0.14
597 0.14
598 0.13
599 0.2
600 0.2
601 0.18
602 0.24
603 0.32
604 0.37
605 0.43
606 0.48
607 0.46
608 0.47
609 0.48
610 0.42
611 0.37
612 0.31
613 0.24
614 0.21
615 0.16
616 0.14
617 0.12
618 0.12
619 0.09
620 0.08
621 0.08
622 0.07
623 0.07
624 0.08
625 0.14
626 0.14
627 0.16
628 0.17
629 0.18
630 0.17
631 0.18
632 0.17
633 0.14
634 0.14
635 0.13
636 0.12
637 0.14
638 0.14
639 0.14
640 0.15
641 0.1
642 0.1
643 0.08
644 0.08
645 0.05
646 0.06
647 0.06
648 0.05
649 0.05
650 0.06
651 0.06
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.09
657 0.13
658 0.17
659 0.18
660 0.19
661 0.18
662 0.18
663 0.17
664 0.16
665 0.16
666 0.12
667 0.11
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.07
673 0.04
674 0.04
675 0.05
676 0.07
677 0.06
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.08
685 0.09
686 0.08
687 0.14
688 0.13
689 0.14
690 0.14
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.13
695 0.07
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.05
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.09
708 0.09
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.1
713 0.12
714 0.12
715 0.08
716 0.1
717 0.14
718 0.19
719 0.21
720 0.23
721 0.24
722 0.26
723 0.28
724 0.29
725 0.27
726 0.22
727 0.24
728 0.26
729 0.24
730 0.22
731 0.19
732 0.18
733 0.19
734 0.18
735 0.18
736 0.18
737 0.2
738 0.21
739 0.23
740 0.29
741 0.33
742 0.38
743 0.4
744 0.4
745 0.48
746 0.51
747 0.59
748 0.55
749 0.52
750 0.5
751 0.48
752 0.42
753 0.32
754 0.29
755 0.2
756 0.19
757 0.2
758 0.18
759 0.16
760 0.16
761 0.19
762 0.17
763 0.18
764 0.19
765 0.14
766 0.15
767 0.15
768 0.15
769 0.13
770 0.13
771 0.11
772 0.1
773 0.09
774 0.13
775 0.14
776 0.14
777 0.13
778 0.12
779 0.13
780 0.16
781 0.18
782 0.16
783 0.16
784 0.17
785 0.2
786 0.26
787 0.34
788 0.33
789 0.37
790 0.4
791 0.41
792 0.44
793 0.48
794 0.45
795 0.41
796 0.44
797 0.38
798 0.34
799 0.31
800 0.27
801 0.2
802 0.17
803 0.12
804 0.07
805 0.06
806 0.06
807 0.07
808 0.08
809 0.07
810 0.08
811 0.09
812 0.11
813 0.12
814 0.16
815 0.22
816 0.22
817 0.23
818 0.24
819 0.25
820 0.25
821 0.3
822 0.33
823 0.34
824 0.38
825 0.38
826 0.4
827 0.4
828 0.38
829 0.32
830 0.25
831 0.19
832 0.15
833 0.14
834 0.15
835 0.15
836 0.14
837 0.17
838 0.17
839 0.15
840 0.16
841 0.16
842 0.12
843 0.12
844 0.11
845 0.08
846 0.08
847 0.09
848 0.09
849 0.09
850 0.08
851 0.08
852 0.08
853 0.08
854 0.07
855 0.06
856 0.04
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.05
861 0.05
862 0.05
863 0.08
864 0.09
865 0.11
866 0.11
867 0.14
868 0.17
869 0.18
870 0.22
871 0.2
872 0.24
873 0.31
874 0.36
875 0.39
876 0.4
877 0.4
878 0.4
879 0.41
880 0.43
881 0.37
882 0.34
883 0.33
884 0.31
885 0.37
886 0.35
887 0.33
888 0.28
889 0.33
890 0.31
891 0.29
892 0.29
893 0.22
894 0.22
895 0.21
896 0.19
897 0.12
898 0.11
899 0.09
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.09
905 0.11
906 0.1
907 0.16
908 0.17
909 0.17
910 0.17
911 0.18
912 0.19
913 0.21
914 0.21
915 0.17
916 0.26
917 0.26
918 0.3
919 0.33
920 0.33
921 0.33
922 0.36
923 0.42
924 0.42
925 0.48
926 0.49
927 0.49
928 0.51
929 0.52
930 0.55
931 0.52
932 0.47
933 0.45
934 0.45
935 0.44
936 0.44
937 0.41
938 0.34
939 0.3
940 0.28
941 0.23
942 0.16
943 0.14
944 0.11
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.12
949 0.12
950 0.14
951 0.16
952 0.16
953 0.13
954 0.14
955 0.15
956 0.14
957 0.14
958 0.13
959 0.11
960 0.1
961 0.11
962 0.1
963 0.08
964 0.07
965 0.07
966 0.07
967 0.07
968 0.07
969 0.06
970 0.06
971 0.06
972 0.06
973 0.07
974 0.07
975 0.06
976 0.08
977 0.08
978 0.08
979 0.08
980 0.08
981 0.09
982 0.11
983 0.11
984 0.09
985 0.1
986 0.12
987 0.13
988 0.15
989 0.18
990 0.19
991 0.25
992 0.3
993 0.33
994 0.36
995 0.36
996 0.37
997 0.35
998 0.33
999 0.31
1000 0.27
1001 0.26
1002 0.25
1003 0.27
1004 0.28
1005 0.28
1006 0.3
1007 0.26
1008 0.32
1009 0.34
1010 0.3
1011 0.31
1012 0.31
1013 0.36
1014 0.37
1015 0.38
1016 0.33
1017 0.31
1018 0.31
1019 0.27
1020 0.24
1021 0.18
1022 0.2
1023 0.2
1024 0.18
1025 0.17
1026 0.19
1027 0.25
1028 0.28
1029 0.39
1030 0.4
1031 0.48
1032 0.58
1033 0.67
1034 0.74
1035 0.77
1036 0.82
1037 0.8
1038 0.84
1039 0.84
1040 0.82
1041 0.74
1042 0.67