Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M526

Protein Details
Accession C5M526    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-172YRNIPKSKRGSNHPSRRNRGNDHydrophilic
204-252NSPPNRRSPPPPRPKSRSPYVGKNENKDDKKNKKKKKKKKGVIYADEEFBasic
300-320LEEFAKCKKIRRKVLNYLQYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-244NRRSPPPPRPKSRSPYVGKNENKDDKKNKKKKKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
KEGG ctp:CTRG_02004  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MPFFSDHAYTSITIKINQLADPNRNDEIDDSIELYLSDLIELIKIQHNPGAVEAARAIRKKIKYGDTKYVQLRALKILELLVLNGGPSIGPIIARDDKLLDVLKGIITGNGRTGDGVPYDKRVQKRVVNMAIGWKTELEDLDGYKYMQGLYRNIPKSKRGSNHPSRRNRGNDDFEDDDFNDEEPSDPYGDQDNYNGNRLRSDSNSPPNRRSPPPPRPKSRSPYVGKNENKDDKKNKKKKKKKKGVIYADEEFEIPQINYKVEAPKIRELIANCYTHTTTLNNLLLQLPADESPLDNDKVLEEFAKCKKIRRKVLNYLQYVGAGIASEKSSEVAKLDEEFLGSLIGANEQLVEAFKKFDFKAGYSKENPAPNYDEEESDSGESYYTTDSEEDEEEEEEEEISERLQNTRIQPKSPPPPRPSKPAGLSNAYSSRPKLDKVETSDSIEGDPFGDRNAVTNNHSVYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.26
4 0.27
5 0.33
6 0.33
7 0.38
8 0.41
9 0.44
10 0.41
11 0.39
12 0.38
13 0.32
14 0.3
15 0.26
16 0.23
17 0.19
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.12
23 0.09
24 0.08
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.09
30 0.13
31 0.14
32 0.16
33 0.17
34 0.18
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.17
39 0.17
40 0.18
41 0.21
42 0.25
43 0.26
44 0.29
45 0.31
46 0.34
47 0.4
48 0.46
49 0.51
50 0.56
51 0.62
52 0.69
53 0.67
54 0.72
55 0.69
56 0.67
57 0.61
58 0.54
59 0.49
60 0.43
61 0.39
62 0.32
63 0.28
64 0.22
65 0.2
66 0.16
67 0.14
68 0.1
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.11
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.19
86 0.2
87 0.14
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.15
105 0.19
106 0.25
107 0.29
108 0.32
109 0.36
110 0.41
111 0.42
112 0.49
113 0.53
114 0.52
115 0.49
116 0.46
117 0.48
118 0.44
119 0.39
120 0.31
121 0.22
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.19
138 0.28
139 0.32
140 0.37
141 0.39
142 0.42
143 0.46
144 0.51
145 0.51
146 0.52
147 0.57
148 0.64
149 0.72
150 0.76
151 0.8
152 0.79
153 0.82
154 0.8
155 0.77
156 0.74
157 0.71
158 0.63
159 0.59
160 0.55
161 0.47
162 0.42
163 0.34
164 0.28
165 0.21
166 0.18
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.18
180 0.18
181 0.23
182 0.24
183 0.21
184 0.21
185 0.23
186 0.24
187 0.21
188 0.25
189 0.27
190 0.35
191 0.44
192 0.47
193 0.49
194 0.54
195 0.56
196 0.54
197 0.57
198 0.57
199 0.59
200 0.67
201 0.71
202 0.74
203 0.76
204 0.81
205 0.79
206 0.76
207 0.74
208 0.68
209 0.69
210 0.66
211 0.69
212 0.63
213 0.61
214 0.61
215 0.6
216 0.58
217 0.56
218 0.59
219 0.6
220 0.68
221 0.74
222 0.77
223 0.8
224 0.88
225 0.91
226 0.93
227 0.94
228 0.93
229 0.93
230 0.93
231 0.93
232 0.89
233 0.84
234 0.75
235 0.64
236 0.54
237 0.43
238 0.32
239 0.22
240 0.15
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.13
248 0.15
249 0.19
250 0.21
251 0.24
252 0.26
253 0.26
254 0.27
255 0.25
256 0.29
257 0.3
258 0.27
259 0.23
260 0.25
261 0.24
262 0.22
263 0.22
264 0.16
265 0.12
266 0.17
267 0.18
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.13
274 0.08
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.08
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.08
289 0.13
290 0.17
291 0.26
292 0.26
293 0.34
294 0.42
295 0.51
296 0.6
297 0.66
298 0.72
299 0.74
300 0.84
301 0.84
302 0.78
303 0.71
304 0.61
305 0.5
306 0.41
307 0.3
308 0.19
309 0.1
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.14
343 0.14
344 0.19
345 0.21
346 0.21
347 0.3
348 0.33
349 0.4
350 0.39
351 0.45
352 0.46
353 0.49
354 0.48
355 0.42
356 0.42
357 0.37
358 0.4
359 0.35
360 0.31
361 0.28
362 0.28
363 0.25
364 0.22
365 0.2
366 0.14
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.14
392 0.19
393 0.26
394 0.36
395 0.39
396 0.39
397 0.45
398 0.53
399 0.61
400 0.66
401 0.68
402 0.66
403 0.74
404 0.76
405 0.79
406 0.76
407 0.75
408 0.72
409 0.71
410 0.7
411 0.65
412 0.61
413 0.59
414 0.57
415 0.5
416 0.47
417 0.39
418 0.4
419 0.37
420 0.39
421 0.39
422 0.41
423 0.46
424 0.5
425 0.57
426 0.53
427 0.56
428 0.55
429 0.49
430 0.43
431 0.35
432 0.27
433 0.2
434 0.18
435 0.12
436 0.11
437 0.12
438 0.11
439 0.13
440 0.19
441 0.21
442 0.23
443 0.29