Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MD53

Protein Details
Accession C5MD53    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-252NDKGGNKKFKKGHHNKNNKNDEKKESDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-244KGGNKKFKKGHHNKNNK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG ctp:CTRG_04154  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MTDFVYQGEDFDEKVRKQVEFYFSDSNLQSDKFLWKIYEANDGWVELKTILTFGRMKQYRPEEKVIESLKKSEKLILSSNNEMIRRKDPIKDFNEIKNTKKRNTLHIEGFPKNLSQEDVENWVNEKLIDSLPKEKEICSIRRIRSKVKKEFFGVVDVEFKTQEDCEFILNNVELSYPKGVITKEEAESMEKKDFLKKMTLLTFQEMRESGKRFGVNDVTKRRNSFNDKGGNKKFKKGHHNKNNKNDEKKESDEKLEKVDEKENQSTEVSQETEATKEAEPAKEAEPVKEAEPTKEAEPAKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.28
4 0.3
5 0.37
6 0.39
7 0.35
8 0.4
9 0.41
10 0.38
11 0.43
12 0.4
13 0.35
14 0.3
15 0.27
16 0.23
17 0.19
18 0.22
19 0.19
20 0.21
21 0.19
22 0.2
23 0.23
24 0.23
25 0.31
26 0.27
27 0.29
28 0.28
29 0.27
30 0.26
31 0.23
32 0.22
33 0.12
34 0.13
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.24
42 0.25
43 0.27
44 0.35
45 0.45
46 0.5
47 0.54
48 0.59
49 0.51
50 0.51
51 0.57
52 0.54
53 0.51
54 0.43
55 0.44
56 0.43
57 0.43
58 0.42
59 0.39
60 0.37
61 0.34
62 0.37
63 0.38
64 0.38
65 0.38
66 0.41
67 0.39
68 0.39
69 0.38
70 0.36
71 0.32
72 0.33
73 0.32
74 0.36
75 0.38
76 0.44
77 0.46
78 0.5
79 0.51
80 0.51
81 0.59
82 0.55
83 0.55
84 0.56
85 0.57
86 0.54
87 0.58
88 0.54
89 0.54
90 0.59
91 0.59
92 0.55
93 0.57
94 0.6
95 0.53
96 0.52
97 0.43
98 0.36
99 0.3
100 0.24
101 0.18
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.11
117 0.18
118 0.19
119 0.22
120 0.22
121 0.2
122 0.25
123 0.28
124 0.29
125 0.28
126 0.35
127 0.37
128 0.44
129 0.47
130 0.51
131 0.56
132 0.63
133 0.67
134 0.64
135 0.64
136 0.58
137 0.59
138 0.5
139 0.43
140 0.34
141 0.24
142 0.22
143 0.19
144 0.17
145 0.13
146 0.12
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.14
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.17
173 0.18
174 0.2
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.26
183 0.24
184 0.28
185 0.3
186 0.34
187 0.3
188 0.32
189 0.33
190 0.28
191 0.29
192 0.25
193 0.24
194 0.25
195 0.27
196 0.25
197 0.26
198 0.27
199 0.25
200 0.29
201 0.34
202 0.35
203 0.4
204 0.47
205 0.49
206 0.51
207 0.53
208 0.53
209 0.53
210 0.55
211 0.53
212 0.52
213 0.56
214 0.57
215 0.64
216 0.7
217 0.72
218 0.66
219 0.69
220 0.67
221 0.65
222 0.72
223 0.73
224 0.75
225 0.76
226 0.85
227 0.86
228 0.91
229 0.94
230 0.91
231 0.9
232 0.85
233 0.82
234 0.78
235 0.74
236 0.72
237 0.65
238 0.64
239 0.61
240 0.56
241 0.54
242 0.52
243 0.49
244 0.44
245 0.47
246 0.45
247 0.45
248 0.49
249 0.45
250 0.41
251 0.39
252 0.36
253 0.31
254 0.28
255 0.23
256 0.17
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.15
263 0.19
264 0.22
265 0.22
266 0.22
267 0.24
268 0.24
269 0.29
270 0.3
271 0.27
272 0.26
273 0.26
274 0.26
275 0.31
276 0.3
277 0.26
278 0.28
279 0.29
280 0.27
281 0.33
282 0.33