Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MBS2

Protein Details
Accession C5MBS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51NESSPLTKSSRKNNQNHSSSSHydrophilic
63-89QPEYLQQEREKQQRQKQQYSRSAANKSHydrophilic
193-222SDDLKNKMKKNEKNRIRTLRRKPRFHYTRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-216NKMKKNEKNRIRTLRRKPR
Subcellular Location(s) plas 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002610  Peptidase_S54_rhomboid  
IPR022764  Peptidase_S54_rhomboid_dom  
IPR035952  Rhomboid-like_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004252  F:serine-type endopeptidase activity  
GO:0006508  P:proteolysis  
KEGG ctp:CTRG_03514  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01694  Rhomboid  
Amino Acid Sequences MYSNTPYSQNNRNGSSSSEEEFDNFNFRDLNESSPLTKSSRKNNQNHSSSSLPTLPPKPLHMQPEYLQQEREKQQRQKQQYSRSAANKSNNQQYPYSSDQQNNLKKMPSTHVTEYELTNFATRDLPPIPPESNSRNYNSHNDNRGSTMTFASNPFTDMNYISRNYDNVDLPPSPPSSDPFKTEEMPSDDDFHSDDLKNKMKKNEKNRIRTLRRKPRFHYTRLPYFTIVISVIQIIVFIVELAKMSQLTGSAFQTKPYFNPMLGPSTYLLIYMGARYVPCMHQIKGITDDTSIMFPCANSTTESTFVCPLNELCGLSGIPQDGDAWLPNQWYRIFIPIFLHAGFLHIIFNLLLQVTMGASIERNIGILKYAIIYIVSGIGGFLLGANFTPQGIASTGASGALFGIVATNIILFIYTGRKNTNMYGTKHYALFICIMIAEIVITFVLGLLPGLDNFSHLGGFAMGILTSILLLKDPFWVFKDGIITYPKNPSTWQQFKNNWNPLFAIEDKIKNRFIIWCHVRIAALSLIIVYYALLCKNFFNANLNQGNRCSWCRYFNCIPVKGWCDIGNVSVTTQTTSNTDSASATPTPSQTTVSTNIYSTAIYTTTLPTSVENSGSSSSSSNSNSQSEGTNGGLKRRFAESFSINAKRDVDVSSQYGIGSGLYLVLFFFTISFLKKKKII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.43
4 0.36
5 0.32
6 0.27
7 0.26
8 0.28
9 0.25
10 0.25
11 0.22
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.24
16 0.23
17 0.26
18 0.24
19 0.26
20 0.27
21 0.28
22 0.31
23 0.3
24 0.36
25 0.38
26 0.44
27 0.53
28 0.61
29 0.68
30 0.77
31 0.82
32 0.82
33 0.8
34 0.75
35 0.68
36 0.6
37 0.56
38 0.49
39 0.42
40 0.41
41 0.4
42 0.41
43 0.39
44 0.42
45 0.43
46 0.45
47 0.5
48 0.46
49 0.47
50 0.43
51 0.52
52 0.52
53 0.49
54 0.46
55 0.41
56 0.46
57 0.49
58 0.57
59 0.56
60 0.6
61 0.67
62 0.74
63 0.82
64 0.84
65 0.85
66 0.86
67 0.86
68 0.83
69 0.83
70 0.8
71 0.77
72 0.74
73 0.74
74 0.72
75 0.69
76 0.72
77 0.68
78 0.63
79 0.58
80 0.53
81 0.52
82 0.49
83 0.49
84 0.44
85 0.42
86 0.46
87 0.54
88 0.59
89 0.56
90 0.52
91 0.49
92 0.46
93 0.46
94 0.46
95 0.42
96 0.41
97 0.41
98 0.42
99 0.43
100 0.43
101 0.4
102 0.37
103 0.33
104 0.26
105 0.23
106 0.19
107 0.16
108 0.17
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.19
113 0.19
114 0.24
115 0.24
116 0.24
117 0.29
118 0.31
119 0.37
120 0.38
121 0.41
122 0.42
123 0.44
124 0.5
125 0.52
126 0.54
127 0.54
128 0.53
129 0.5
130 0.47
131 0.45
132 0.39
133 0.33
134 0.27
135 0.21
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.16
146 0.17
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.22
153 0.2
154 0.18
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.22
159 0.21
160 0.19
161 0.18
162 0.2
163 0.23
164 0.25
165 0.27
166 0.28
167 0.3
168 0.31
169 0.31
170 0.33
171 0.31
172 0.32
173 0.3
174 0.3
175 0.27
176 0.26
177 0.25
178 0.21
179 0.2
180 0.17
181 0.2
182 0.22
183 0.3
184 0.34
185 0.38
186 0.46
187 0.53
188 0.6
189 0.67
190 0.72
191 0.74
192 0.78
193 0.84
194 0.86
195 0.86
196 0.88
197 0.89
198 0.89
199 0.89
200 0.89
201 0.84
202 0.84
203 0.81
204 0.78
205 0.77
206 0.74
207 0.74
208 0.7
209 0.67
210 0.57
211 0.5
212 0.43
213 0.34
214 0.26
215 0.16
216 0.11
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.22
244 0.22
245 0.17
246 0.2
247 0.2
248 0.22
249 0.21
250 0.21
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.12
255 0.1
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.14
266 0.16
267 0.16
268 0.2
269 0.22
270 0.22
271 0.25
272 0.25
273 0.19
274 0.17
275 0.17
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.16
325 0.14
326 0.14
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.02
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.04
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.03
391 0.02
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.02
397 0.03
398 0.02
399 0.03
400 0.08
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.25
408 0.27
409 0.29
410 0.35
411 0.37
412 0.38
413 0.37
414 0.36
415 0.27
416 0.22
417 0.2
418 0.13
419 0.09
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.03
436 0.03
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.03
450 0.04
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.13
463 0.16
464 0.16
465 0.17
466 0.21
467 0.16
468 0.19
469 0.23
470 0.22
471 0.22
472 0.29
473 0.28
474 0.25
475 0.27
476 0.29
477 0.35
478 0.42
479 0.45
480 0.48
481 0.54
482 0.62
483 0.71
484 0.75
485 0.66
486 0.58
487 0.53
488 0.45
489 0.42
490 0.34
491 0.28
492 0.22
493 0.27
494 0.29
495 0.32
496 0.32
497 0.27
498 0.28
499 0.28
500 0.27
501 0.32
502 0.34
503 0.34
504 0.34
505 0.35
506 0.34
507 0.29
508 0.29
509 0.2
510 0.15
511 0.11
512 0.09
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.04
517 0.04
518 0.05
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.11
524 0.13
525 0.13
526 0.17
527 0.19
528 0.26
529 0.32
530 0.34
531 0.34
532 0.34
533 0.36
534 0.34
535 0.35
536 0.34
537 0.3
538 0.37
539 0.38
540 0.45
541 0.48
542 0.53
543 0.59
544 0.56
545 0.55
546 0.53
547 0.53
548 0.46
549 0.42
550 0.35
551 0.29
552 0.26
553 0.25
554 0.21
555 0.17
556 0.16
557 0.17
558 0.15
559 0.14
560 0.14
561 0.13
562 0.13
563 0.15
564 0.15
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.14
569 0.18
570 0.16
571 0.16
572 0.17
573 0.18
574 0.2
575 0.2
576 0.21
577 0.19
578 0.22
579 0.24
580 0.27
581 0.26
582 0.24
583 0.24
584 0.23
585 0.21
586 0.18
587 0.15
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.13
594 0.13
595 0.12
596 0.15
597 0.16
598 0.17
599 0.15
600 0.16
601 0.17
602 0.17
603 0.18
604 0.15
605 0.15
606 0.18
607 0.21
608 0.23
609 0.25
610 0.26
611 0.26
612 0.26
613 0.26
614 0.23
615 0.23
616 0.21
617 0.24
618 0.24
619 0.3
620 0.33
621 0.33
622 0.34
623 0.36
624 0.35
625 0.31
626 0.37
627 0.33
628 0.35
629 0.43
630 0.48
631 0.44
632 0.46
633 0.45
634 0.39
635 0.37
636 0.33
637 0.29
638 0.25
639 0.27
640 0.25
641 0.24
642 0.23
643 0.22
644 0.18
645 0.14
646 0.1
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.08
658 0.12
659 0.19
660 0.22