Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M7I8

Protein Details
Accession C5M7I8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-68SNEPRFDKAKWKNQNCYYLHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR008676  MRG  
IPR038217  MRG_C_sf  
IPR026541  MRG_dom  
IPR025995  Tudor-knot  
Gene Ontology GO:0035267  C:NuA4 histone acetyltransferase complex  
GO:1990453  C:nucleosome disassembly/reassembly complex  
GO:0032221  C:Rpd3S/Clr6-CII complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006335  P:DNA replication-dependent chromatin assembly  
GO:0016573  P:histone acetylation  
GO:0060195  P:negative regulation of antisense RNA transcription  
GO:0006337  P:nucleosome disassembly  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0030174  P:regulation of DNA-templated DNA replication initiation  
GO:0043487  P:regulation of RNA stability  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ctp:CTRG_01820  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05712  MRG  
PF11717  Tudor-knot  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51640  MRG  
Amino Acid Sequences MVATVEYKPNQLVYAYHGPLIYEAKILKIKKKNESFIINHDLQQETIESNEPRFDKAKWKNQNCYYLHYQGWNAKWDEWVGIDRIMELNNENKFKKLELDQLTKKKKAPAGSLSSSTATTTTTTTTVTTRQSNSKRSASTTNNNSQTPSKKQKTVNGKKSTTPTPRRSIQLKIPDELKTILVEDWKNVSKDRKLISLPSKYTIYQILQDYKSYRTKKLSSKQLSKLHEILNGLETYFNKSLSLILLYKFENLQYLNFLKEDTINIESSQSKVYGVEHLLRLIVLLPSLISSTTMDGVSTTVLVSELEELAEFLSNRIDIYKNTYDYTSPQYDRLART
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.28
4 0.27
5 0.27
6 0.28
7 0.29
8 0.22
9 0.17
10 0.16
11 0.19
12 0.25
13 0.28
14 0.35
15 0.41
16 0.49
17 0.56
18 0.64
19 0.67
20 0.68
21 0.74
22 0.69
23 0.68
24 0.68
25 0.59
26 0.53
27 0.48
28 0.42
29 0.33
30 0.3
31 0.23
32 0.16
33 0.15
34 0.18
35 0.15
36 0.16
37 0.21
38 0.21
39 0.23
40 0.25
41 0.26
42 0.31
43 0.4
44 0.5
45 0.55
46 0.63
47 0.7
48 0.75
49 0.83
50 0.74
51 0.72
52 0.68
53 0.62
54 0.55
55 0.48
56 0.44
57 0.41
58 0.41
59 0.39
60 0.34
61 0.3
62 0.29
63 0.27
64 0.24
65 0.19
66 0.19
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.14
76 0.18
77 0.23
78 0.23
79 0.24
80 0.24
81 0.24
82 0.27
83 0.26
84 0.3
85 0.33
86 0.41
87 0.48
88 0.57
89 0.64
90 0.63
91 0.62
92 0.59
93 0.55
94 0.52
95 0.5
96 0.48
97 0.49
98 0.48
99 0.48
100 0.44
101 0.41
102 0.36
103 0.29
104 0.21
105 0.14
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.13
114 0.15
115 0.18
116 0.19
117 0.27
118 0.32
119 0.38
120 0.42
121 0.44
122 0.42
123 0.42
124 0.47
125 0.45
126 0.47
127 0.48
128 0.51
129 0.5
130 0.49
131 0.48
132 0.44
133 0.43
134 0.43
135 0.47
136 0.43
137 0.45
138 0.49
139 0.55
140 0.62
141 0.68
142 0.7
143 0.68
144 0.66
145 0.63
146 0.64
147 0.65
148 0.63
149 0.61
150 0.57
151 0.54
152 0.56
153 0.56
154 0.55
155 0.5
156 0.48
157 0.48
158 0.44
159 0.4
160 0.39
161 0.35
162 0.34
163 0.3
164 0.24
165 0.14
166 0.13
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.17
175 0.21
176 0.2
177 0.25
178 0.26
179 0.27
180 0.26
181 0.32
182 0.38
183 0.41
184 0.4
185 0.38
186 0.38
187 0.34
188 0.34
189 0.3
190 0.23
191 0.2
192 0.21
193 0.24
194 0.23
195 0.24
196 0.25
197 0.26
198 0.34
199 0.33
200 0.35
201 0.36
202 0.42
203 0.49
204 0.56
205 0.63
206 0.64
207 0.7
208 0.74
209 0.76
210 0.74
211 0.69
212 0.65
213 0.56
214 0.49
215 0.41
216 0.32
217 0.27
218 0.23
219 0.18
220 0.15
221 0.14
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.16
230 0.11
231 0.11
232 0.13
233 0.14
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.14
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.18
256 0.14
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.16
262 0.19
263 0.18
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.16
268 0.13
269 0.11
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.12
304 0.14
305 0.12
306 0.21
307 0.27
308 0.28
309 0.3
310 0.31
311 0.31
312 0.33
313 0.39
314 0.39
315 0.34
316 0.34
317 0.39