FuNGI

C5M4L6

Protein Details

Accession

C5M4L6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-103	VRAAIQSVRRNRKRSSKKHSDEDDYD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
87-94	RNRKRSSK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000999 RNase_III_dom IPR036389 RNase_III_sf IPR007147 TF_Vhr
Gene Ontology	GO:0004525 F:ribonuclease III activity GO:0006396 P:RNA processing
KEGG	ctp:CTRG_01006 -
Pfam	View protein in Pfam PF04001 Vhr1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50142 RNASE_3_2

Amino Acid Sequences

MDSNKKLGVTHSIRDKLNFHDERLWKRFSARRLELIDTLDLSSRKASEQEQEIRKVSEILRTEFNYHSSYAPDFNKLVRAAIQSVRRNRKRSSKKHSDEDDYDHYSTNYKKQRLEERNQHSNNFLSEIVRNDEDVYDVNYNKTKVFTNKDKANDTIDNMTKPRLPPLSNLSMNETINIPSASNAKKVILKKIETSKSCNESVSSKSENLQFLGKSFMATCIGFVFEKSFIHVNQQSLTYLRNKLTSESSLAKFFRDLDPINTNSINDEAAVISLYILLGGMVKDFGFEDIMNPICEILYASVLQEYPLVAKNSIPYRSEENMRRSSSIDSIRGNDDHSLSKLAEVATHLQIHSNQSTTSTLVSSRSMTPSGTPPPPPAPVSSSSTSTSYKKRVYLKFLNQKLEFFYPVRIAATPRFNELLENAKSAFKLPDTTIIIRHHGHVITGDLELERVFRSEEDIIELEITTHNPMPIYEMHRRMSQQVYNPVPKPTAAAAPPPSLPPTTVPSQPSVMDSHRIILPPPIQSRGAMGFNFISNSDEGAHSVTPPPSRPALLPKFQPLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.53
3	0.49
4	0.54
5	0.5
6	0.44
7	0.48
8	0.53
9	0.59
10	0.62
11	0.59
12	0.5
13	0.56
14	0.58
15	0.56
16	0.6
17	0.56
18	0.58
19	0.59
20	0.62
21	0.57
22	0.54
23	0.47
24	0.38
25	0.33
26	0.29
27	0.24
28	0.21
29	0.2
30	0.18
31	0.17
32	0.19
33	0.21
34	0.23
35	0.32
36	0.4
37	0.45
38	0.5
39	0.51
40	0.5
41	0.48
42	0.45
43	0.37
44	0.35
45	0.33
46	0.3
47	0.34
48	0.34
49	0.38
50	0.35
51	0.37
52	0.32
53	0.29
54	0.26
55	0.23
56	0.23
57	0.25
58	0.25
59	0.26
60	0.25
61	0.25
62	0.3
63	0.28
64	0.27
65	0.24
66	0.25
67	0.25
68	0.3
69	0.38
70	0.4
71	0.5
72	0.6
73	0.64
74	0.67
75	0.71
76	0.76
77	0.79
78	0.81
79	0.82
80	0.83
81	0.83
82	0.88
83	0.87
84	0.85
85	0.78
86	0.75
87	0.7
88	0.64
89	0.57
90	0.47
91	0.4
92	0.35
93	0.33
94	0.35
95	0.37
96	0.37
97	0.4
98	0.47
99	0.58
100	0.63
101	0.71
102	0.73
103	0.73
104	0.79
105	0.77
106	0.72
107	0.63
108	0.56
109	0.47
110	0.39
111	0.3
112	0.21
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.2
117	0.19
118	0.18
119	0.17
120	0.16
121	0.15
122	0.15
123	0.15
124	0.15
125	0.17
126	0.19
127	0.2
128	0.2
129	0.2
130	0.21
131	0.25
132	0.33
133	0.4
134	0.45
135	0.51
136	0.56
137	0.58
138	0.56
139	0.55
140	0.49
141	0.42
142	0.4
143	0.36
144	0.33
145	0.31
146	0.31
147	0.28
148	0.26
149	0.3
150	0.28
151	0.26
152	0.28
153	0.34
154	0.4
155	0.39
156	0.4
157	0.39
158	0.38
159	0.36
160	0.33
161	0.27
162	0.19
163	0.18
164	0.17
165	0.11
166	0.09
167	0.14
168	0.15
169	0.16
170	0.16
171	0.17
172	0.22
173	0.24
174	0.32
175	0.33
176	0.34
177	0.38
178	0.46
179	0.52
180	0.49
181	0.53
182	0.51
183	0.49
184	0.48
185	0.43
186	0.35
187	0.3
188	0.31
189	0.3
190	0.26
191	0.23
192	0.24
193	0.28
194	0.27
195	0.25
196	0.25
197	0.19
198	0.17
199	0.2
200	0.17
201	0.13
202	0.12
203	0.13
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.11
216	0.1
217	0.16
218	0.18
219	0.18
220	0.18
221	0.19
222	0.18
223	0.17
224	0.19
225	0.16
226	0.17
227	0.17
228	0.19
229	0.19
230	0.2
231	0.22
232	0.21
233	0.21
234	0.23
235	0.23
236	0.24
237	0.24
238	0.22
239	0.2
240	0.2
241	0.18
242	0.18
243	0.17
244	0.17
245	0.21
246	0.21
247	0.23
248	0.22
249	0.2
250	0.17
251	0.16
252	0.12
253	0.08
254	0.07
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.04
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.02
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.02
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.06
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.1
298	0.14
299	0.17
300	0.2
301	0.2
302	0.18
303	0.23
304	0.26
305	0.32
306	0.35
307	0.38
308	0.42
309	0.42
310	0.41
311	0.37
312	0.36
313	0.35
314	0.32
315	0.29
316	0.24
317	0.25
318	0.26
319	0.25
320	0.24
321	0.2
322	0.17
323	0.15
324	0.15
325	0.15
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.12
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.17
339	0.16
340	0.14
341	0.12
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.13
346	0.1
347	0.1
348	0.11
349	0.12
350	0.12
351	0.13
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.15
356	0.18
357	0.23
358	0.24
359	0.23
360	0.25
361	0.27
362	0.29
363	0.29
364	0.26
365	0.25
366	0.25
367	0.29
368	0.27
369	0.27
370	0.26
371	0.28
372	0.29
373	0.29
374	0.32
375	0.33
376	0.35
377	0.38
378	0.45
379	0.48
380	0.54
381	0.6
382	0.65
383	0.68
384	0.71
385	0.74
386	0.66
387	0.61
388	0.56
389	0.49
390	0.42
391	0.32
392	0.28
393	0.21
394	0.21
395	0.21
396	0.18
397	0.18
398	0.2
399	0.26
400	0.25
401	0.26
402	0.27
403	0.26
404	0.26
405	0.25
406	0.27
407	0.22
408	0.22
409	0.2
410	0.2
411	0.2
412	0.21
413	0.21
414	0.14
415	0.16
416	0.15
417	0.21
418	0.25
419	0.26
420	0.3
421	0.31
422	0.34
423	0.32
424	0.33
425	0.29
426	0.24
427	0.23
428	0.18
429	0.17
430	0.15
431	0.14
432	0.13
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.08
438	0.07
439	0.08
440	0.07
441	0.11
442	0.12
443	0.13
444	0.16
445	0.16
446	0.16
447	0.15
448	0.15
449	0.12
450	0.11
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.13
458	0.17
459	0.23
460	0.29
461	0.33
462	0.36
463	0.39
464	0.41
465	0.43
466	0.45
467	0.44
468	0.43
469	0.47
470	0.53
471	0.56
472	0.57
473	0.55
474	0.5
475	0.44
476	0.4
477	0.32
478	0.31
479	0.25
480	0.3
481	0.3
482	0.32
483	0.33
484	0.32
485	0.32
486	0.27
487	0.27
488	0.23
489	0.24
490	0.25
491	0.29
492	0.29
493	0.3
494	0.31
495	0.31
496	0.3
497	0.29
498	0.28
499	0.28
500	0.26
501	0.27
502	0.27
503	0.27
504	0.25
505	0.28
506	0.29
507	0.31
508	0.34
509	0.35
510	0.33
511	0.33
512	0.36
513	0.33
514	0.34
515	0.26
516	0.25
517	0.23
518	0.22
519	0.23
520	0.2
521	0.18
522	0.14
523	0.15
524	0.14
525	0.13
526	0.13
527	0.15
528	0.15
529	0.14
530	0.18
531	0.21
532	0.23
533	0.25
534	0.29
535	0.29
536	0.31
537	0.33
538	0.39
539	0.44
540	0.48
541	0.5

C5M4L6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer