Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M3F7

Protein Details
Accession C5M3F7    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-91EGGETKKRKKQVKDPNAPKKPLTBasic
193-225AEPPTSIEEPKKKKKKSEKKEKKKKSHSSHGSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-87KKRKKQVKDPNAPK
202-219PKKKKKKSEKKEKKKKSH
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ctp:CTRG_00596  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSEIKTAKDTLVASLFSLSKAANDAANAAVEFYKVATNGSDDVAADQLKSISDALKVATDLSSGALKVEGGETKKRKKQVKDPNAPKKPLTMFFQFSYDLRKQIGVERKRKDLPSLSAIDMNSMIKERWDNITAEEKAAYKKRYDDAMIIYNEEKKKYETSLVDGTSYHPPKSVQSPIVEEVISPELLEEIHAEPPTSIEEPKKKKKKSEKKEKKKKSHSSHGSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.16
4 0.17
5 0.13
6 0.1
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.11
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.09
57 0.11
58 0.2
59 0.26
60 0.35
61 0.4
62 0.48
63 0.54
64 0.59
65 0.67
66 0.71
67 0.75
68 0.78
69 0.84
70 0.87
71 0.87
72 0.82
73 0.72
74 0.66
75 0.59
76 0.51
77 0.45
78 0.38
79 0.34
80 0.31
81 0.33
82 0.28
83 0.25
84 0.27
85 0.23
86 0.2
87 0.17
88 0.17
89 0.16
90 0.21
91 0.31
92 0.32
93 0.4
94 0.42
95 0.47
96 0.5
97 0.5
98 0.47
99 0.42
100 0.38
101 0.34
102 0.33
103 0.29
104 0.27
105 0.26
106 0.23
107 0.19
108 0.16
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.14
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.19
124 0.21
125 0.26
126 0.25
127 0.19
128 0.22
129 0.24
130 0.26
131 0.27
132 0.25
133 0.24
134 0.28
135 0.27
136 0.26
137 0.24
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.23
142 0.19
143 0.21
144 0.21
145 0.27
146 0.22
147 0.26
148 0.3
149 0.3
150 0.28
151 0.26
152 0.27
153 0.3
154 0.31
155 0.25
156 0.22
157 0.22
158 0.24
159 0.29
160 0.33
161 0.27
162 0.28
163 0.32
164 0.33
165 0.34
166 0.31
167 0.25
168 0.22
169 0.2
170 0.17
171 0.12
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.13
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.22
187 0.32
188 0.41
189 0.53
190 0.62
191 0.66
192 0.75
193 0.84
194 0.87
195 0.89
196 0.91
197 0.91
198 0.92
199 0.97
200 0.97
201 0.97
202 0.97
203 0.97
204 0.96
205 0.95