Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M1T7

Protein Details
Accession C5M1T7    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-100LSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCBasic
182-205QTLQRKRALKAKKVKNAQQQRDAAHydrophilic
213-233AKRLHERKEEKAEIKKKRAESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-95TGERKRK
186-195RKRALKAKKV
214-234KRLHERKEEKAEIKKKRAESL
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.833, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014401  Ribosomal_S6_euk  
IPR001377  Ribosomal_S6e  
IPR018282  Ribosomal_S6e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ctp:CTRG_00026  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01092  Ribosomal_S6e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00578  RIBOSOMAL_S6E  
Amino Acid Sequences MKLNISYPANGTQKSIDIDDEHKLRVFYEKRMGQEVEGDSVGDEFKGYIFKITGGNDKQGFPMKQGVMHPTRVRLLLSKGHSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVAQDLSVLALSIVKQGENEIEGLTDTTVPKRLGPKRANHIRKFFGLTKEDDVRDFVVRREVTKGDKTYTKAPKIQRLVTPQTLQRKRALKAKKVKNAQQQRDAAAEYAQLLAKRLHERKEEKAEIKKKRAESLKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.23
4 0.21
5 0.23
6 0.28
7 0.28
8 0.27
9 0.26
10 0.25
11 0.23
12 0.3
13 0.3
14 0.29
15 0.37
16 0.39
17 0.41
18 0.46
19 0.46
20 0.38
21 0.41
22 0.36
23 0.29
24 0.25
25 0.22
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.09
30 0.07
31 0.04
32 0.05
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.13
39 0.15
40 0.22
41 0.23
42 0.28
43 0.28
44 0.29
45 0.3
46 0.34
47 0.32
48 0.27
49 0.31
50 0.26
51 0.28
52 0.29
53 0.33
54 0.29
55 0.35
56 0.34
57 0.3
58 0.31
59 0.29
60 0.28
61 0.23
62 0.23
63 0.24
64 0.28
65 0.3
66 0.31
67 0.34
68 0.37
69 0.4
70 0.46
71 0.48
72 0.52
73 0.52
74 0.6
75 0.67
76 0.74
77 0.8
78 0.81
79 0.83
80 0.81
81 0.85
82 0.8
83 0.78
84 0.74
85 0.68
86 0.59
87 0.51
88 0.47
89 0.38
90 0.33
91 0.24
92 0.17
93 0.11
94 0.09
95 0.06
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.19
119 0.24
120 0.33
121 0.39
122 0.45
123 0.52
124 0.62
125 0.7
126 0.68
127 0.69
128 0.63
129 0.6
130 0.59
131 0.52
132 0.47
133 0.41
134 0.37
135 0.36
136 0.36
137 0.35
138 0.29
139 0.27
140 0.23
141 0.23
142 0.21
143 0.17
144 0.2
145 0.2
146 0.21
147 0.23
148 0.24
149 0.26
150 0.32
151 0.33
152 0.3
153 0.34
154 0.36
155 0.41
156 0.48
157 0.48
158 0.49
159 0.52
160 0.58
161 0.6
162 0.62
163 0.59
164 0.58
165 0.6
166 0.58
167 0.56
168 0.53
169 0.58
170 0.59
171 0.55
172 0.55
173 0.54
174 0.52
175 0.57
176 0.61
177 0.59
178 0.64
179 0.72
180 0.74
181 0.77
182 0.82
183 0.85
184 0.86
185 0.85
186 0.84
187 0.77
188 0.7
189 0.64
190 0.56
191 0.45
192 0.35
193 0.27
194 0.18
195 0.16
196 0.15
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.19
201 0.28
202 0.32
203 0.37
204 0.45
205 0.5
206 0.58
207 0.67
208 0.71
209 0.69
210 0.74
211 0.77
212 0.78
213 0.82
214 0.81
215 0.75
216 0.76