Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MIE2

Protein Details
Accession C5MIE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-440VDTSKTPVKSRRKKLEEARSGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-281KKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007148  SSU_processome_Utp12  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG ctp:CTRG_05835  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04003  Utp12  
Amino Acid Sequences MSGPVICSKFDASGSFLATALVALDAHQVKVQSTTNQSSSSSLNTSFTLEKSNKLTNLTWIPSGNNNVELLALCLTRGTVLIYSPQTNEIISELNASANVSILDFHYSEITQSGWSCDIDGNINEWDMNTFEMKNSLKIKDIVDSIDSINRISTVFYQRQPCLLIGSNSIYLFNIKTKEVVKTFPGHIQPINTITPINDNSFMTSAKGDRFINLYQLDKITTKAVFVASSSVESLSIGIQDDKSVLVVINEEGNLEIFNNPLSEQPKSSQPSTPMSKKKRKQIGVSSRSSNGSIKLSRPEKEIKNPHDANLYINAISTLGDAILFTWLENSTVPFFDSLKWIDETGNQFLLDSTKIITKSKPDLRVTQHTTINGHDVAAPKLYSEGHTIISDGSNIRHIDEEDEDQEESLAEKLDRLSVDTSKTPVKSRRKKLEEARSGVSLSIILTQSLQNNDTSLLETVLQNRDTVTIQNTINRLDPYTAVLFLDKLSDKLQRQPTRFETFAFWLKWILVIHGPVIASLPNLNVKLATLYSVLNKKAESLPRLLELQGRLNLTNDNTTLKNEIYDQELVEEDEEVYEPSDVEYIEELDDAQYIGVISEDEDEIMDGVDDYEESEDDEDVEDEDEDDDDDEDVDIPSAADLQSDDEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.14
7 0.1
8 0.08
9 0.06
10 0.05
11 0.11
12 0.12
13 0.13
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.2
18 0.22
19 0.22
20 0.28
21 0.33
22 0.34
23 0.36
24 0.36
25 0.34
26 0.33
27 0.31
28 0.28
29 0.23
30 0.23
31 0.22
32 0.24
33 0.24
34 0.22
35 0.27
36 0.25
37 0.28
38 0.32
39 0.37
40 0.36
41 0.39
42 0.39
43 0.39
44 0.44
45 0.42
46 0.4
47 0.35
48 0.34
49 0.35
50 0.39
51 0.33
52 0.28
53 0.25
54 0.22
55 0.22
56 0.19
57 0.16
58 0.13
59 0.11
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.13
69 0.16
70 0.18
71 0.19
72 0.21
73 0.2
74 0.19
75 0.19
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.08
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.15
120 0.16
121 0.21
122 0.25
123 0.25
124 0.27
125 0.29
126 0.3
127 0.28
128 0.29
129 0.24
130 0.21
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.15
141 0.19
142 0.24
143 0.29
144 0.35
145 0.35
146 0.37
147 0.37
148 0.33
149 0.29
150 0.27
151 0.23
152 0.2
153 0.22
154 0.22
155 0.2
156 0.2
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.16
164 0.17
165 0.23
166 0.23
167 0.25
168 0.25
169 0.27
170 0.29
171 0.32
172 0.33
173 0.3
174 0.3
175 0.29
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.2
180 0.17
181 0.15
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.17
186 0.16
187 0.17
188 0.18
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.19
203 0.19
204 0.2
205 0.17
206 0.18
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.21
254 0.24
255 0.26
256 0.26
257 0.27
258 0.32
259 0.38
260 0.44
261 0.47
262 0.54
263 0.62
264 0.65
265 0.72
266 0.75
267 0.74
268 0.74
269 0.75
270 0.76
271 0.74
272 0.73
273 0.66
274 0.58
275 0.53
276 0.46
277 0.36
278 0.27
279 0.23
280 0.2
281 0.19
282 0.25
283 0.27
284 0.27
285 0.29
286 0.34
287 0.34
288 0.42
289 0.49
290 0.46
291 0.52
292 0.52
293 0.49
294 0.45
295 0.42
296 0.34
297 0.28
298 0.25
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.14
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.14
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.1
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.15
346 0.22
347 0.28
348 0.35
349 0.35
350 0.4
351 0.45
352 0.53
353 0.56
354 0.53
355 0.49
356 0.43
357 0.41
358 0.35
359 0.32
360 0.23
361 0.17
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.14
388 0.15
389 0.12
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.08
402 0.08
403 0.1
404 0.12
405 0.12
406 0.15
407 0.16
408 0.18
409 0.2
410 0.22
411 0.26
412 0.33
413 0.43
414 0.5
415 0.59
416 0.68
417 0.71
418 0.78
419 0.82
420 0.84
421 0.82
422 0.77
423 0.7
424 0.6
425 0.54
426 0.45
427 0.35
428 0.24
429 0.15
430 0.13
431 0.1
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.12
436 0.14
437 0.14
438 0.11
439 0.12
440 0.13
441 0.12
442 0.12
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.13
448 0.16
449 0.16
450 0.15
451 0.14
452 0.15
453 0.15
454 0.16
455 0.15
456 0.16
457 0.16
458 0.2
459 0.21
460 0.21
461 0.23
462 0.22
463 0.21
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.17
468 0.16
469 0.13
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.14
474 0.11
475 0.11
476 0.13
477 0.19
478 0.2
479 0.29
480 0.39
481 0.44
482 0.46
483 0.52
484 0.57
485 0.58
486 0.57
487 0.5
488 0.44
489 0.41
490 0.45
491 0.38
492 0.32
493 0.25
494 0.24
495 0.25
496 0.21
497 0.18
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.14
502 0.14
503 0.11
504 0.11
505 0.09
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.12
517 0.09
518 0.1
519 0.16
520 0.21
521 0.22
522 0.22
523 0.22
524 0.23
525 0.29
526 0.34
527 0.32
528 0.31
529 0.32
530 0.33
531 0.35
532 0.33
533 0.31
534 0.27
535 0.29
536 0.29
537 0.28
538 0.26
539 0.26
540 0.28
541 0.25
542 0.26
543 0.21
544 0.21
545 0.2
546 0.21
547 0.23
548 0.2
549 0.2
550 0.19
551 0.19
552 0.2
553 0.2
554 0.18
555 0.17
556 0.17
557 0.16
558 0.15
559 0.14
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.08
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.06
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.09
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.08
611 0.09
612 0.09
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.09
630 0.11