Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MHA7

Protein Details
Accession C5MHA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-232HSRSRGHESKTPRQRDRSPTRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-232RKPGDGDRHRHSHHKSRSSSDRSHKSGSSERSHKSHSRSRGHESKTPRQRDRSPTR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ctp:CTRG_05461  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MAGDLNLKKSWNPALVKNQQKVWQEEQQKLDELKKIKEKNYEFKQEQEYLELLKLQYGDNFDTKDLKKSEKLKLSKLNWMYDDVPFENNEQVEENSSGFIESSLEFTEGKSKVENMLNGNNNMVSRKRDRGDHSDRINKIIGVGMSKPQKTTSYSDDPLAKIKQQQQQQQQAQRSSRKPGDGDRHRHSHHKSRSSSDRSHKSGSSERSHKSHSRSRGHESKTPRQRDRSPTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.56
3 0.64
4 0.64
5 0.64
6 0.64
7 0.65
8 0.64
9 0.6
10 0.59
11 0.57
12 0.59
13 0.58
14 0.54
15 0.53
16 0.49
17 0.46
18 0.44
19 0.41
20 0.42
21 0.47
22 0.5
23 0.5
24 0.58
25 0.61
26 0.65
27 0.7
28 0.73
29 0.65
30 0.65
31 0.66
32 0.6
33 0.54
34 0.46
35 0.38
36 0.29
37 0.28
38 0.24
39 0.17
40 0.14
41 0.14
42 0.11
43 0.12
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.22
50 0.23
51 0.27
52 0.27
53 0.29
54 0.34
55 0.39
56 0.47
57 0.5
58 0.53
59 0.55
60 0.62
61 0.61
62 0.63
63 0.6
64 0.55
65 0.47
66 0.47
67 0.4
68 0.32
69 0.32
70 0.24
71 0.21
72 0.18
73 0.18
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.15
100 0.17
101 0.19
102 0.15
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.19
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.16
113 0.21
114 0.22
115 0.27
116 0.32
117 0.4
118 0.47
119 0.51
120 0.54
121 0.57
122 0.56
123 0.53
124 0.49
125 0.39
126 0.31
127 0.25
128 0.18
129 0.12
130 0.12
131 0.15
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.2
136 0.21
137 0.23
138 0.26
139 0.28
140 0.31
141 0.32
142 0.35
143 0.36
144 0.34
145 0.36
146 0.33
147 0.29
148 0.27
149 0.33
150 0.36
151 0.4
152 0.48
153 0.53
154 0.61
155 0.67
156 0.69
157 0.69
158 0.7
159 0.7
160 0.7
161 0.65
162 0.63
163 0.59
164 0.56
165 0.52
166 0.53
167 0.57
168 0.58
169 0.63
170 0.62
171 0.65
172 0.64
173 0.7
174 0.69
175 0.68
176 0.69
177 0.69
178 0.67
179 0.68
180 0.75
181 0.74
182 0.76
183 0.75
184 0.75
185 0.71
186 0.71
187 0.64
188 0.6
189 0.61
190 0.6
191 0.59
192 0.57
193 0.57
194 0.57
195 0.62
196 0.62
197 0.62
198 0.63
199 0.63
200 0.66
201 0.67
202 0.72
203 0.74
204 0.74
205 0.73
206 0.73
207 0.74
208 0.75
209 0.79
210 0.78
211 0.78
212 0.8