Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MEC6

Protein Details
Accession C5MEC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
575-601MNKTRKAESNVYYKKKKRRKVSINKKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
588-601KKKKRRKVSINKKI
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003511  HORMA_dom  
IPR036570  HORMA_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_04419  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02301  HORMA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50815  HORMA  
Amino Acid Sequences MGVTAEESRGFVYELISTSMYCITYLRNLFRETSYYDTKYFDTVDPDLTSSYICVKKLRKGASKSSDIFVEYIERGIFQAIQLKYLKGVSFNIHSSKNSPFNSEESYLFGIDYINNQVSLNGSNEEISSDSITKSIYSLVKRLIVLTQTLETPRKQRYFTIRLLYNETCPSEYQPPYFQDATLLEPNVIRLEADSQGIAIGTLQTGECKSSINVLVEKRNSNTCVDVDPFDLLADDYNGFDDSPLSTLHLSEKSPEAVEVTQILEPSRLVKCKICENEIDPVALGYDQPLVRDIPCFECLFKGNIDPELIILQKVRILWNFYMNHDFPSFKKSLDIIKITDPETIKKIFNRLFNDGILVTTNKATLATNSAEFQKGSGIFSSTLEGIIDNHGCELIANREYFVSFVPKLSEKLNFLDFDTKLRKIYFPNYKILKLAFVMSNLDKFKKTNPIVHKEHENDDDVVPVTAYMHSRVLNNSQTQSSESSFSPTSDYVSRSSIKFTFTNKETSPTTAHSEDDDDDDNDDNQNINLKDSSYDASEISHNLDDLSFAESLQLLSQQSVISNQQSPIELTQVMNKTRKAESNVYYKKKKRRKVSINKKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.15
6 0.16
7 0.15
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.19
12 0.25
13 0.29
14 0.31
15 0.33
16 0.35
17 0.37
18 0.38
19 0.35
20 0.36
21 0.38
22 0.37
23 0.37
24 0.37
25 0.36
26 0.34
27 0.33
28 0.28
29 0.26
30 0.25
31 0.27
32 0.25
33 0.25
34 0.23
35 0.21
36 0.19
37 0.14
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.27
42 0.31
43 0.39
44 0.47
45 0.56
46 0.58
47 0.61
48 0.7
49 0.71
50 0.75
51 0.7
52 0.64
53 0.56
54 0.48
55 0.41
56 0.32
57 0.27
58 0.19
59 0.17
60 0.15
61 0.13
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.09
66 0.17
67 0.15
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.22
72 0.24
73 0.24
74 0.18
75 0.21
76 0.2
77 0.22
78 0.26
79 0.29
80 0.29
81 0.3
82 0.31
83 0.35
84 0.4
85 0.37
86 0.37
87 0.35
88 0.36
89 0.4
90 0.39
91 0.33
92 0.28
93 0.29
94 0.25
95 0.22
96 0.19
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.11
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.13
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.22
127 0.25
128 0.26
129 0.26
130 0.24
131 0.2
132 0.2
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.19
137 0.21
138 0.21
139 0.25
140 0.32
141 0.35
142 0.35
143 0.4
144 0.46
145 0.5
146 0.54
147 0.57
148 0.54
149 0.52
150 0.57
151 0.52
152 0.45
153 0.41
154 0.36
155 0.29
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.27
160 0.27
161 0.28
162 0.29
163 0.33
164 0.33
165 0.29
166 0.24
167 0.23
168 0.25
169 0.24
170 0.21
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.14
175 0.13
176 0.08
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.13
199 0.14
200 0.18
201 0.2
202 0.25
203 0.28
204 0.3
205 0.28
206 0.29
207 0.29
208 0.26
209 0.26
210 0.21
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.16
215 0.15
216 0.14
217 0.11
218 0.1
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.25
260 0.28
261 0.27
262 0.27
263 0.27
264 0.31
265 0.29
266 0.27
267 0.19
268 0.16
269 0.14
270 0.12
271 0.09
272 0.04
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.12
305 0.12
306 0.19
307 0.2
308 0.2
309 0.25
310 0.24
311 0.25
312 0.22
313 0.22
314 0.16
315 0.21
316 0.2
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.2
321 0.23
322 0.25
323 0.21
324 0.23
325 0.25
326 0.25
327 0.27
328 0.23
329 0.2
330 0.2
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.25
335 0.26
336 0.31
337 0.34
338 0.36
339 0.35
340 0.33
341 0.33
342 0.26
343 0.22
344 0.17
345 0.13
346 0.09
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.13
391 0.11
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.17
396 0.18
397 0.21
398 0.18
399 0.2
400 0.22
401 0.21
402 0.21
403 0.25
404 0.23
405 0.26
406 0.28
407 0.27
408 0.27
409 0.27
410 0.28
411 0.26
412 0.35
413 0.4
414 0.39
415 0.47
416 0.48
417 0.48
418 0.48
419 0.44
420 0.37
421 0.27
422 0.26
423 0.19
424 0.16
425 0.18
426 0.17
427 0.21
428 0.21
429 0.23
430 0.21
431 0.21
432 0.24
433 0.31
434 0.34
435 0.38
436 0.45
437 0.52
438 0.56
439 0.6
440 0.64
441 0.57
442 0.59
443 0.53
444 0.47
445 0.4
446 0.34
447 0.32
448 0.24
449 0.2
450 0.15
451 0.11
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.11
457 0.13
458 0.14
459 0.17
460 0.21
461 0.25
462 0.27
463 0.28
464 0.27
465 0.27
466 0.28
467 0.28
468 0.25
469 0.23
470 0.19
471 0.21
472 0.21
473 0.2
474 0.21
475 0.18
476 0.2
477 0.2
478 0.22
479 0.19
480 0.23
481 0.25
482 0.22
483 0.27
484 0.25
485 0.26
486 0.28
487 0.31
488 0.35
489 0.35
490 0.41
491 0.38
492 0.41
493 0.39
494 0.38
495 0.37
496 0.32
497 0.36
498 0.3
499 0.3
500 0.27
501 0.28
502 0.25
503 0.25
504 0.24
505 0.19
506 0.19
507 0.19
508 0.18
509 0.17
510 0.16
511 0.13
512 0.11
513 0.17
514 0.16
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.19
520 0.2
521 0.16
522 0.17
523 0.15
524 0.16
525 0.17
526 0.17
527 0.18
528 0.17
529 0.14
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.14
548 0.17
549 0.18
550 0.21
551 0.22
552 0.23
553 0.24
554 0.26
555 0.24
556 0.24
557 0.21
558 0.19
559 0.25
560 0.29
561 0.35
562 0.38
563 0.39
564 0.4
565 0.44
566 0.5
567 0.49
568 0.51
569 0.52
570 0.57
571 0.65
572 0.71
573 0.76
574 0.79
575 0.83
576 0.85
577 0.88
578 0.88
579 0.89
580 0.9
581 0.91