Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCR1

Protein Details
Accession C5MCR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-42DTNVTVSKPKKNPFATRPKKVTVKRTVDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, cyto 4, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR019451  Rtp1_C1  
IPR019414  Rtp1_C2  
IPR039600  TANGO6/Rtp1  
KEGG ctp:CTRG_04012  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10363  RTP1_C1  
PF10304  RTP1_C2  
Amino Acid Sequences MSPPKIEEIDNHSDTNVTVSKPKKNPFATRPKKVTVKRTVDEAYPQRKGLNKPQFKPTKPIDILFDKLQKQIDLPYDKLNIDELYNRFQLSGPDDSLVKRYVVVERLLDELLEIQRLSMNVPQTDDKNLMAISLHDIKTFSKLVNLIIIHGIYPPLNVFRIGVEFEKRQLKNISDSKKTIKLDTLPRDNIEYIEKLLVLVYDKFSRLFSYKSDVADLLFKGTGFTDFLIVAMTLITVPNFNSSHIDISKVESLASTFELFQIYTLIMASSSPQQFKRFVMSRLELLHYSRSDGLLTLVEFVLGLRDQEEINIEKFEHVSNVVLSKPKSVDARSYFTSVGAQIYNLLININRPTITSCVSFVLEKLWQRNKSVASDFVLKKIWENFNPSPREVEILVTEADLNNSINVILSLTKKGMEPDLYQAVIEPIILPLWGYYLFLKQNKKPFGIISDILTSYFTIMKDFDSDNIAGLLIIAKNLLYEHGEDWKYEIGDNDLVQIVQIKPEFTSTSKKTKVNKFIDSLDFACESLINLLQELDDSLIQKLFVSILKSWLNKDKVILGGDEPNPFLMLVDLRLLESIGEKFKDKLATNPIDMLQLVDSFLGSSKAISSDDRMQEVDSDDEDDDNEEGDDEAQSILPVLLQLLSAILSENDIIVDDQCSEVLSNIMKSLLALESTNAAAGALRTRIQDLVSGNHALSADNELDNQRQILSRAITSLNDPLVPIRAHGLYLLRQLVEKKSTVTTLDFVINLHLVQLKDPEPFIYLNVIKGLENLLEWDKVGVLQKLCKMYSNDDDEGDTDLDERVKIGEVLLRFIKHENELFGGESAELIINAVMKLIRKVGNEERDHRLDMSALSILGECVTSNIFAVNINEVLDCCIGVLDLEKSSIIRRAAIVVIHDVLVALSEKENIEFPADYRDRVKTALGYTAEFDKDYLTKEHAKKVLTYFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.26
4 0.19
5 0.23
6 0.29
7 0.38
8 0.46
9 0.54
10 0.58
11 0.64
12 0.73
13 0.76
14 0.82
15 0.83
16 0.85
17 0.85
18 0.84
19 0.86
20 0.84
21 0.84
22 0.83
23 0.82
24 0.74
25 0.74
26 0.68
27 0.61
28 0.62
29 0.61
30 0.59
31 0.54
32 0.53
33 0.49
34 0.53
35 0.57
36 0.58
37 0.59
38 0.6
39 0.61
40 0.71
41 0.77
42 0.74
43 0.76
44 0.71
45 0.71
46 0.65
47 0.63
48 0.59
49 0.54
50 0.55
51 0.53
52 0.54
53 0.45
54 0.45
55 0.44
56 0.38
57 0.34
58 0.35
59 0.37
60 0.35
61 0.35
62 0.37
63 0.39
64 0.38
65 0.38
66 0.34
67 0.27
68 0.23
69 0.27
70 0.24
71 0.26
72 0.27
73 0.27
74 0.25
75 0.25
76 0.26
77 0.24
78 0.26
79 0.22
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.26
84 0.24
85 0.2
86 0.16
87 0.17
88 0.21
89 0.23
90 0.24
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.23
95 0.21
96 0.16
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.12
101 0.1
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.18
107 0.17
108 0.21
109 0.24
110 0.24
111 0.27
112 0.27
113 0.24
114 0.22
115 0.2
116 0.17
117 0.14
118 0.13
119 0.15
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.2
124 0.21
125 0.25
126 0.25
127 0.2
128 0.17
129 0.18
130 0.18
131 0.23
132 0.22
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.15
137 0.14
138 0.15
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.19
151 0.19
152 0.24
153 0.34
154 0.33
155 0.36
156 0.39
157 0.39
158 0.44
159 0.51
160 0.53
161 0.5
162 0.55
163 0.55
164 0.58
165 0.58
166 0.51
167 0.47
168 0.47
169 0.5
170 0.55
171 0.58
172 0.53
173 0.52
174 0.53
175 0.48
176 0.42
177 0.36
178 0.28
179 0.21
180 0.19
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.18
193 0.18
194 0.18
195 0.18
196 0.23
197 0.26
198 0.26
199 0.27
200 0.24
201 0.23
202 0.25
203 0.23
204 0.18
205 0.15
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.13
229 0.14
230 0.19
231 0.19
232 0.21
233 0.17
234 0.21
235 0.23
236 0.2
237 0.18
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.05
255 0.06
256 0.11
257 0.14
258 0.17
259 0.19
260 0.22
261 0.24
262 0.26
263 0.33
264 0.31
265 0.32
266 0.35
267 0.35
268 0.35
269 0.36
270 0.37
271 0.3
272 0.27
273 0.29
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.27
317 0.28
318 0.32
319 0.32
320 0.34
321 0.31
322 0.28
323 0.28
324 0.2
325 0.17
326 0.12
327 0.1
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.05
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.12
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.12
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.21
352 0.28
353 0.29
354 0.3
355 0.34
356 0.34
357 0.35
358 0.35
359 0.3
360 0.25
361 0.32
362 0.3
363 0.29
364 0.29
365 0.24
366 0.24
367 0.28
368 0.3
369 0.23
370 0.31
371 0.34
372 0.39
373 0.42
374 0.41
375 0.37
376 0.33
377 0.33
378 0.25
379 0.21
380 0.14
381 0.12
382 0.12
383 0.09
384 0.09
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.13
411 0.1
412 0.09
413 0.06
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.07
424 0.11
425 0.16
426 0.21
427 0.24
428 0.32
429 0.35
430 0.35
431 0.34
432 0.31
433 0.29
434 0.29
435 0.26
436 0.2
437 0.18
438 0.17
439 0.16
440 0.15
441 0.12
442 0.09
443 0.1
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.04
460 0.04
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.06
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.12
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.09
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.11
492 0.11
493 0.18
494 0.2
495 0.28
496 0.33
497 0.39
498 0.45
499 0.53
500 0.61
501 0.6
502 0.6
503 0.55
504 0.53
505 0.5
506 0.45
507 0.37
508 0.28
509 0.22
510 0.18
511 0.15
512 0.11
513 0.09
514 0.07
515 0.08
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.13
535 0.17
536 0.18
537 0.2
538 0.26
539 0.27
540 0.25
541 0.26
542 0.23
543 0.22
544 0.22
545 0.21
546 0.14
547 0.17
548 0.19
549 0.19
550 0.17
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.11
555 0.07
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.05
564 0.06
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.1
569 0.11
570 0.13
571 0.19
572 0.18
573 0.22
574 0.28
575 0.3
576 0.3
577 0.31
578 0.29
579 0.24
580 0.24
581 0.19
582 0.11
583 0.08
584 0.08
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.07
595 0.08
596 0.11
597 0.17
598 0.19
599 0.2
600 0.2
601 0.19
602 0.19
603 0.2
604 0.18
605 0.11
606 0.11
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.03
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.06
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.07
669 0.07
670 0.09
671 0.09
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.14
676 0.14
677 0.16
678 0.17
679 0.18
680 0.16
681 0.17
682 0.17
683 0.13
684 0.13
685 0.13
686 0.11
687 0.1
688 0.12
689 0.12
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.11
694 0.11
695 0.12
696 0.15
697 0.15
698 0.14
699 0.16
700 0.17
701 0.16
702 0.17
703 0.19
704 0.16
705 0.14
706 0.14
707 0.12
708 0.15
709 0.14
710 0.13
711 0.13
712 0.12
713 0.12
714 0.13
715 0.15
716 0.13
717 0.17
718 0.18
719 0.16
720 0.17
721 0.2
722 0.22
723 0.23
724 0.22
725 0.2
726 0.21
727 0.22
728 0.22
729 0.22
730 0.19
731 0.18
732 0.19
733 0.16
734 0.15
735 0.15
736 0.13
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.1
741 0.11
742 0.14
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.16
747 0.15
748 0.15
749 0.15
750 0.18
751 0.17
752 0.17
753 0.18
754 0.18
755 0.16
756 0.16
757 0.16
758 0.1
759 0.09
760 0.11
761 0.11
762 0.11
763 0.11
764 0.11
765 0.1
766 0.11
767 0.14
768 0.16
769 0.16
770 0.19
771 0.24
772 0.28
773 0.28
774 0.31
775 0.32
776 0.34
777 0.39
778 0.42
779 0.39
780 0.36
781 0.36
782 0.32
783 0.32
784 0.26
785 0.19
786 0.12
787 0.12
788 0.11
789 0.1
790 0.1
791 0.08
792 0.09
793 0.09
794 0.09
795 0.11
796 0.11
797 0.15
798 0.18
799 0.18
800 0.18
801 0.21
802 0.23
803 0.23
804 0.24
805 0.22
806 0.21
807 0.22
808 0.22
809 0.2
810 0.18
811 0.14
812 0.12
813 0.11
814 0.08
815 0.07
816 0.06
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.07
821 0.07
822 0.08
823 0.1
824 0.14
825 0.18
826 0.19
827 0.26
828 0.34
829 0.43
830 0.48
831 0.53
832 0.55
833 0.55
834 0.56
835 0.5
836 0.42
837 0.34
838 0.27
839 0.25
840 0.18
841 0.14
842 0.12
843 0.11
844 0.1
845 0.09
846 0.09
847 0.06
848 0.06
849 0.07
850 0.06
851 0.06
852 0.07
853 0.07
854 0.08
855 0.09
856 0.11
857 0.11
858 0.11
859 0.11
860 0.11
861 0.13
862 0.12
863 0.11
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.08
870 0.08
871 0.09
872 0.1
873 0.1
874 0.13
875 0.18
876 0.17
877 0.17
878 0.17
879 0.2
880 0.21
881 0.22
882 0.22
883 0.19
884 0.19
885 0.18
886 0.17
887 0.14
888 0.12
889 0.11
890 0.1
891 0.08
892 0.07
893 0.09
894 0.1
895 0.11
896 0.13
897 0.12
898 0.15
899 0.14
900 0.15
901 0.23
902 0.24
903 0.26
904 0.29
905 0.32
906 0.31
907 0.32
908 0.34
909 0.28
910 0.29
911 0.33
912 0.31
913 0.29
914 0.29
915 0.32
916 0.3
917 0.26
918 0.24
919 0.19
920 0.19
921 0.21
922 0.22
923 0.23
924 0.31
925 0.36
926 0.45
927 0.47
928 0.47
929 0.49