Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCK5

Protein Details
Accession C5MCK5    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MTKKLTPQEKQNRKPAVRACHydrophilic
30-50CSNERPCKNCVKRNIGHECRDHydrophilic
60-87TGNGKGSSSKTKTPRKKLKSTPITASSPHydrophilic
303-323GFNQPKKKVAKKLKESRPFISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-76TPRKK
308-315KKKVAKKL
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013767  PAS_fold  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ctp:CTRG_03956  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00989  PAS  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50112  PAS  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
cd00130  PAS  
Amino Acid Sequences MTKKLTPQEKQNRKPAVRACVFCHQKHLQCSNERPCKNCVKRNIGHECRDIVRKRVQYLTGNGKGSSSKTKTPRKKLKSTPITASSPSVASTISPLPIDAGLKQEFSTPNEIPMSEPSLTNQPLSMSPLNPQGANNITNNFNSHATSQQIKEILEVPPHVNSMMNNSGLNTNVSLTPETLMIPDHLQFHTTTMLNTTNDVLNKLLTDQFETESLISANNSNNTSHNDNFIAQNNNNNPEPSNLHNRHQFSSNYLNEEYLMLGDILLHSKPVSPSPSNTSASEYNTNTLSPTNFGFIQNIDFEGFNQPKKKVAKKLKESRPFISLGYTDDSTLRLNHAPEANGQTEDLLDHNKDDSRKNPGNGNSIINFETKYVKDYVAPFITNGLYQSVKDIYSYQIINYEYPDSYHALTKFLKERFGGNDLSIDERKEKRSKLLVILKLIASYRPTFIAAHKSLLKPQDLLFLEMSLQRSLLDYKKLVELSSSPSIMWRRTGEIIYITEEMGLLLGYSPIEILEKRFFLFSLMPDEEIIRYFKFFKNIAVNDLQSSISIKVKLINKEGRLVEFCSVYTIKRDIFDIPMLIVGQFLPVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.77
4 0.75
5 0.7
6 0.66
7 0.66
8 0.7
9 0.62
10 0.63
11 0.6
12 0.59
13 0.64
14 0.66
15 0.63
16 0.65
17 0.74
18 0.76
19 0.78
20 0.75
21 0.69
22 0.69
23 0.72
24 0.73
25 0.72
26 0.71
27 0.71
28 0.73
29 0.8
30 0.83
31 0.81
32 0.78
33 0.74
34 0.68
35 0.63
36 0.65
37 0.59
38 0.55
39 0.55
40 0.54
41 0.55
42 0.56
43 0.57
44 0.54
45 0.58
46 0.62
47 0.59
48 0.56
49 0.51
50 0.46
51 0.42
52 0.4
53 0.41
54 0.36
55 0.38
56 0.45
57 0.56
58 0.65
59 0.75
60 0.82
61 0.82
62 0.87
63 0.9
64 0.91
65 0.91
66 0.87
67 0.85
68 0.8
69 0.75
70 0.66
71 0.58
72 0.49
73 0.38
74 0.32
75 0.24
76 0.17
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.11
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.15
91 0.19
92 0.2
93 0.22
94 0.28
95 0.23
96 0.26
97 0.26
98 0.26
99 0.23
100 0.24
101 0.25
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.23
106 0.24
107 0.23
108 0.2
109 0.17
110 0.17
111 0.23
112 0.23
113 0.17
114 0.19
115 0.25
116 0.26
117 0.25
118 0.24
119 0.22
120 0.23
121 0.25
122 0.24
123 0.2
124 0.21
125 0.21
126 0.23
127 0.21
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.22
134 0.21
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.22
139 0.22
140 0.21
141 0.2
142 0.21
143 0.18
144 0.17
145 0.18
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.17
155 0.17
156 0.17
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.12
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.14
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.1
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.12
199 0.1
200 0.1
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.18
210 0.22
211 0.21
212 0.22
213 0.21
214 0.21
215 0.22
216 0.24
217 0.25
218 0.21
219 0.27
220 0.27
221 0.29
222 0.29
223 0.27
224 0.24
225 0.21
226 0.24
227 0.21
228 0.29
229 0.29
230 0.33
231 0.39
232 0.41
233 0.4
234 0.41
235 0.38
236 0.32
237 0.37
238 0.34
239 0.32
240 0.29
241 0.27
242 0.24
243 0.23
244 0.18
245 0.1
246 0.09
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.04
255 0.06
256 0.06
257 0.09
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.21
262 0.27
263 0.28
264 0.28
265 0.29
266 0.26
267 0.27
268 0.3
269 0.25
270 0.21
271 0.19
272 0.18
273 0.15
274 0.14
275 0.12
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.18
293 0.18
294 0.24
295 0.3
296 0.35
297 0.4
298 0.49
299 0.56
300 0.64
301 0.74
302 0.79
303 0.83
304 0.81
305 0.73
306 0.66
307 0.57
308 0.46
309 0.38
310 0.28
311 0.2
312 0.18
313 0.16
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.19
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.13
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.11
339 0.13
340 0.15
341 0.17
342 0.25
343 0.3
344 0.31
345 0.36
346 0.38
347 0.42
348 0.41
349 0.41
350 0.33
351 0.3
352 0.3
353 0.24
354 0.2
355 0.15
356 0.17
357 0.14
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.16
362 0.18
363 0.22
364 0.21
365 0.21
366 0.18
367 0.18
368 0.18
369 0.16
370 0.14
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.14
381 0.14
382 0.12
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.13
389 0.14
390 0.15
391 0.13
392 0.13
393 0.17
394 0.16
395 0.18
396 0.19
397 0.22
398 0.27
399 0.27
400 0.29
401 0.26
402 0.28
403 0.29
404 0.31
405 0.28
406 0.22
407 0.23
408 0.2
409 0.24
410 0.22
411 0.2
412 0.22
413 0.24
414 0.31
415 0.34
416 0.35
417 0.38
418 0.44
419 0.47
420 0.51
421 0.57
422 0.55
423 0.52
424 0.53
425 0.46
426 0.4
427 0.36
428 0.28
429 0.21
430 0.18
431 0.15
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.17
436 0.25
437 0.23
438 0.27
439 0.3
440 0.31
441 0.34
442 0.37
443 0.36
444 0.29
445 0.28
446 0.32
447 0.28
448 0.3
449 0.25
450 0.22
451 0.21
452 0.22
453 0.23
454 0.15
455 0.14
456 0.11
457 0.12
458 0.15
459 0.17
460 0.19
461 0.18
462 0.2
463 0.25
464 0.25
465 0.24
466 0.22
467 0.21
468 0.23
469 0.26
470 0.25
471 0.2
472 0.24
473 0.28
474 0.27
475 0.3
476 0.25
477 0.25
478 0.28
479 0.29
480 0.25
481 0.25
482 0.25
483 0.25
484 0.23
485 0.19
486 0.16
487 0.15
488 0.13
489 0.1
490 0.08
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.06
499 0.07
500 0.11
501 0.15
502 0.16
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.2
508 0.18
509 0.22
510 0.22
511 0.22
512 0.22
513 0.23
514 0.21
515 0.2
516 0.21
517 0.14
518 0.15
519 0.18
520 0.21
521 0.26
522 0.26
523 0.31
524 0.38
525 0.39
526 0.43
527 0.44
528 0.42
529 0.37
530 0.38
531 0.31
532 0.22
533 0.23
534 0.19
535 0.18
536 0.18
537 0.17
538 0.22
539 0.29
540 0.34
541 0.41
542 0.46
543 0.45
544 0.52
545 0.54
546 0.52
547 0.49
548 0.46
549 0.39
550 0.33
551 0.3
552 0.28
553 0.26
554 0.22
555 0.24
556 0.25
557 0.24
558 0.24
559 0.26
560 0.23
561 0.26
562 0.28
563 0.24
564 0.21
565 0.21
566 0.2
567 0.18
568 0.15
569 0.11