Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7APZ4

Protein Details
Accession A0A5N7APZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-318HDSRRHFRERSPRADRRNKGRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-218RRRRFDGRELRRRR
300-315RHFRERSPRADRRNKG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MEAAGVQQPPASNGDHAMDASMDIDMDLDLGPLPEAEPIEADSLGGTAPFADGAVDPQTSEAQYEKVHVRGVDELTTDNIKQFAMEHFTLEAPSRVEWIDDTSANLIYSSPEIGLQALSAFTQASEEEDTSELPALRLRSAKLLPSHPDSVLQVRSAVKTDRKKPRAHEASRFYLMHPEHDPRERLRREFDDRRRHGGGDDGDYRRRRFDGRELRRRRDRDGDELISANMYDDSGATSTDYPETGRGHDERGRRRDRDRELFPSDEGRPSGRLQNRSASPGRDTLVESGYSEHDRHDSRRHFRERSPRADRRNKGRELFPSSKSFGADADADSRELFPNKPATSYLKKELFPSKHSNHRRSDAIDAADETADLFSRRISVPLVDGSQDQRRNKNVELFPDSGESGVNIRGAAGPDQGFSIRGAANGLSIKGRGASVRELFPSKYNSNAGKELFSDKIEGRGGPRRRAEDMFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.17
4 0.16
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.09
9 0.07
10 0.05
11 0.06
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.06
19 0.05
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.05
40 0.07
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.17
52 0.19
53 0.19
54 0.22
55 0.21
56 0.22
57 0.24
58 0.25
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.22
64 0.2
65 0.16
66 0.15
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.17
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.18
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.11
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.12
119 0.1
120 0.09
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.18
127 0.19
128 0.24
129 0.25
130 0.29
131 0.31
132 0.35
133 0.36
134 0.31
135 0.32
136 0.29
137 0.29
138 0.26
139 0.22
140 0.19
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.22
145 0.26
146 0.32
147 0.42
148 0.5
149 0.56
150 0.6
151 0.63
152 0.7
153 0.73
154 0.71
155 0.71
156 0.66
157 0.66
158 0.65
159 0.61
160 0.5
161 0.46
162 0.4
163 0.34
164 0.3
165 0.28
166 0.26
167 0.3
168 0.32
169 0.29
170 0.39
171 0.39
172 0.39
173 0.41
174 0.44
175 0.49
176 0.57
177 0.63
178 0.64
179 0.64
180 0.68
181 0.64
182 0.58
183 0.49
184 0.45
185 0.37
186 0.31
187 0.33
188 0.29
189 0.34
190 0.36
191 0.37
192 0.32
193 0.32
194 0.29
195 0.26
196 0.34
197 0.39
198 0.47
199 0.57
200 0.64
201 0.71
202 0.77
203 0.77
204 0.71
205 0.7
206 0.63
207 0.59
208 0.58
209 0.51
210 0.43
211 0.4
212 0.35
213 0.25
214 0.21
215 0.14
216 0.07
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.12
233 0.12
234 0.15
235 0.2
236 0.26
237 0.33
238 0.41
239 0.47
240 0.48
241 0.53
242 0.58
243 0.62
244 0.64
245 0.61
246 0.59
247 0.57
248 0.55
249 0.5
250 0.45
251 0.38
252 0.31
253 0.27
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.24
258 0.26
259 0.29
260 0.29
261 0.35
262 0.35
263 0.39
264 0.4
265 0.34
266 0.31
267 0.29
268 0.28
269 0.22
270 0.22
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.13
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.14
281 0.16
282 0.19
283 0.27
284 0.34
285 0.4
286 0.49
287 0.57
288 0.57
289 0.62
290 0.7
291 0.69
292 0.71
293 0.74
294 0.73
295 0.75
296 0.81
297 0.81
298 0.81
299 0.82
300 0.78
301 0.72
302 0.69
303 0.66
304 0.65
305 0.63
306 0.56
307 0.52
308 0.48
309 0.45
310 0.4
311 0.33
312 0.23
313 0.2
314 0.17
315 0.13
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.21
326 0.21
327 0.22
328 0.23
329 0.28
330 0.34
331 0.38
332 0.43
333 0.42
334 0.42
335 0.46
336 0.53
337 0.5
338 0.49
339 0.53
340 0.51
341 0.56
342 0.65
343 0.68
344 0.66
345 0.67
346 0.65
347 0.59
348 0.58
349 0.52
350 0.44
351 0.38
352 0.32
353 0.28
354 0.23
355 0.19
356 0.14
357 0.1
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.14
368 0.17
369 0.17
370 0.16
371 0.17
372 0.2
373 0.27
374 0.34
375 0.36
376 0.4
377 0.44
378 0.48
379 0.51
380 0.56
381 0.52
382 0.53
383 0.55
384 0.5
385 0.46
386 0.43
387 0.39
388 0.29
389 0.25
390 0.18
391 0.13
392 0.12
393 0.11
394 0.08
395 0.09
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.15
400 0.14
401 0.13
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.13
406 0.14
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.11
411 0.13
412 0.14
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.15
421 0.21
422 0.23
423 0.26
424 0.3
425 0.32
426 0.33
427 0.36
428 0.4
429 0.35
430 0.36
431 0.4
432 0.41
433 0.43
434 0.47
435 0.44
436 0.39
437 0.4
438 0.39
439 0.35
440 0.3
441 0.29
442 0.24
443 0.28
444 0.28
445 0.27
446 0.28
447 0.36
448 0.42
449 0.47
450 0.53
451 0.53
452 0.57