FuNGI

C5M9B5

Protein Details

Accession

C5M9B5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
616-637	AIQQEKQQQQQQQQQQQRRKAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 7.5, plas 7, mito 6, cyto_nucl 5, E.R. 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019049 Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
KEGG	ctp:CTRG_02987 -
Pfam	View protein in Pfam PF09531 Ndc1_Nup

Amino Acid Sequences

MEPLKAYNYQHIFNKVLNKRLKYVLNVNLIWSVTLNVVYNLMPFTSGSSSYGSSFLSFLCVKLPVFFIALTIIRQLRKKTLTVDYSNHKTLGSQIYYSIISSNFLINWFGYYLSIFLIYSVLLIFNFDFTLDYYLLSKEYRRYPLINDEWVYFWYQVAFISFLYTCNQLIFQRQRLNFQFGVKRNNPENYLFKHLPILLGNSFGLNLFIIILSPLTYWILKYYIYKSFTLITLILGLDTAIPPFNTSLSTFIKLGYSSFFLILSWEVANHAFNVYATIGCLDGKKPISTYSADPIQCLLSGLRDVDPKFQLSRLTAFQELAYLATSSDKEAVKLRIQLFSARSKKTHVWPAIFEECSLIIQETTDRINYRSSNDLAALKAVQLGIKNDINVGFKKDNDIFGNSFISSPSKSPEVMKKFQPESKETPKSPNKWIEVINQQVIVPAKSLIASFSTQYFKPHGIKFDYSKYMKTYYEYRNKFLETSFGIFFRTTLKRDGESRVINPVNFGNAIISISNLVQFSTEEGINDDVCKLLNLLEHPIRASTNYIDYLPASIYLTSYQKENSNYKRNLLIGILHDLAIHEFYQICIKFNGKLNDLILTPRTYKLAKWVIDKEIAIQQEKQQQQQQQQQQQRRKAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.48
3	0.53
4	0.57
5	0.55
6	0.55
7	0.6
8	0.6
9	0.56
10	0.59
11	0.59
12	0.58
13	0.54
14	0.51
15	0.47
16	0.42
17	0.35
18	0.27
19	0.2
20	0.12
21	0.13
22	0.12
23	0.1
24	0.11
25	0.11
26	0.11
27	0.11
28	0.1
29	0.09
30	0.08
31	0.11
32	0.12
33	0.13
34	0.14
35	0.15
36	0.17
37	0.17
38	0.18
39	0.16
40	0.14
41	0.14
42	0.12
43	0.15
44	0.14
45	0.13
46	0.14
47	0.16
48	0.15
49	0.16
50	0.18
51	0.14
52	0.15
53	0.15
54	0.13
55	0.14
56	0.15
57	0.14
58	0.16
59	0.19
60	0.22
61	0.26
62	0.29
63	0.34
64	0.37
65	0.4
66	0.41
67	0.47
68	0.5
69	0.52
70	0.55
71	0.56
72	0.59
73	0.58
74	0.52
75	0.43
76	0.36
77	0.35
78	0.37
79	0.31
80	0.25
81	0.23
82	0.25
83	0.25
84	0.25
85	0.21
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.11
91	0.11
92	0.12
93	0.1
94	0.11
95	0.1
96	0.1
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.07
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.05
109	0.04
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.1
118	0.09
119	0.1
120	0.11
121	0.11
122	0.12
123	0.13
124	0.14
125	0.17
126	0.23
127	0.28
128	0.31
129	0.32
130	0.35
131	0.44
132	0.46
133	0.46
134	0.41
135	0.37
136	0.35
137	0.33
138	0.32
139	0.22
140	0.17
141	0.12
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.07
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.12
152	0.11
153	0.11
154	0.13
155	0.12
156	0.2
157	0.25
158	0.3
159	0.37
160	0.38
161	0.46
162	0.47
163	0.53
164	0.46
165	0.47
166	0.48
167	0.44
168	0.53
169	0.49
170	0.51
171	0.5
172	0.52
173	0.49
174	0.46
175	0.47
176	0.42
177	0.47
178	0.41
179	0.37
180	0.36
181	0.33
182	0.29
183	0.24
184	0.23
185	0.15
186	0.16
187	0.15
188	0.12
189	0.12
190	0.1
191	0.1
192	0.06
193	0.05
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.11
209	0.14
210	0.19
211	0.22
212	0.22
213	0.22
214	0.23
215	0.22
216	0.21
217	0.18
218	0.12
219	0.1
220	0.1
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.11
235	0.13
236	0.15
237	0.15
238	0.15
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.11
273	0.12
274	0.14
275	0.16
276	0.17
277	0.17
278	0.22
279	0.22
280	0.22
281	0.21
282	0.19
283	0.16
284	0.15
285	0.12
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.1
291	0.11
292	0.14
293	0.15
294	0.16
295	0.16
296	0.16
297	0.16
298	0.14
299	0.16
300	0.15
301	0.16
302	0.16
303	0.15
304	0.14
305	0.13
306	0.12
307	0.1
308	0.08
309	0.06
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.12
318	0.15
319	0.16
320	0.22
321	0.22
322	0.21
323	0.22
324	0.24
325	0.24
326	0.31
327	0.35
328	0.31
329	0.31
330	0.32
331	0.36
332	0.38
333	0.44
334	0.39
335	0.36
336	0.35
337	0.4
338	0.41
339	0.37
340	0.31
341	0.23
342	0.19
343	0.17
344	0.15
345	0.09
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.13
355	0.14
356	0.16
357	0.19
358	0.19
359	0.18
360	0.19
361	0.19
362	0.16
363	0.16
364	0.13
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.14
376	0.15
377	0.15
378	0.19
379	0.17
380	0.16
381	0.21
382	0.21
383	0.23
384	0.22
385	0.25
386	0.2
387	0.21
388	0.22
389	0.18
390	0.17
391	0.14
392	0.14
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.16
399	0.25
400	0.3
401	0.34
402	0.38
403	0.43
404	0.46
405	0.48
406	0.49
407	0.46
408	0.47
409	0.53
410	0.56
411	0.5
412	0.56
413	0.61
414	0.61
415	0.64
416	0.63
417	0.56
418	0.52
419	0.53
420	0.49
421	0.47
422	0.47
423	0.41
424	0.33
425	0.3
426	0.29
427	0.27
428	0.22
429	0.15
430	0.11
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.12
439	0.15
440	0.15
441	0.17
442	0.19
443	0.21
444	0.26
445	0.28
446	0.3
447	0.32
448	0.36
449	0.38
450	0.42
451	0.46
452	0.42
453	0.42
454	0.4
455	0.38
456	0.35
457	0.34
458	0.36
459	0.38
460	0.46
461	0.48
462	0.48
463	0.48
464	0.49
465	0.47
466	0.39
467	0.34
468	0.27
469	0.27
470	0.24
471	0.21
472	0.21
473	0.19
474	0.19
475	0.21
476	0.22
477	0.2
478	0.24
479	0.27
480	0.28
481	0.32
482	0.37
483	0.38
484	0.38
485	0.38
486	0.42
487	0.41
488	0.38
489	0.37
490	0.32
491	0.27
492	0.22
493	0.21
494	0.12
495	0.1
496	0.11
497	0.09
498	0.09
499	0.07
500	0.07
501	0.09
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.09
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.11
511	0.13
512	0.13
513	0.13
514	0.11
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.1
521	0.11
522	0.17
523	0.2
524	0.21
525	0.21
526	0.22
527	0.22
528	0.2
529	0.21
530	0.17
531	0.18
532	0.19
533	0.18
534	0.18
535	0.18
536	0.18
537	0.15
538	0.14
539	0.11
540	0.1
541	0.1
542	0.12
543	0.15
544	0.14
545	0.16
546	0.17
547	0.21
548	0.27
549	0.36
550	0.42
551	0.5
552	0.52
553	0.54
554	0.57
555	0.53
556	0.49
557	0.41
558	0.35
559	0.28
560	0.3
561	0.27
562	0.22
563	0.21
564	0.19
565	0.18
566	0.16
567	0.13
568	0.09
569	0.08
570	0.09
571	0.17
572	0.17
573	0.18
574	0.19
575	0.21
576	0.25
577	0.33
578	0.38
579	0.33
580	0.37
581	0.36
582	0.36
583	0.35
584	0.33
585	0.29
586	0.26
587	0.26
588	0.24
589	0.27
590	0.25
591	0.25
592	0.31
593	0.37
594	0.38
595	0.44
596	0.48
597	0.49
598	0.52
599	0.52
600	0.46
601	0.43
602	0.42
603	0.37
604	0.34
605	0.35
606	0.4
607	0.44
608	0.47
609	0.49
610	0.52
611	0.59
612	0.66
613	0.7
614	0.71
615	0.77
616	0.81
617	0.84

C5M9B5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer