Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TRI2

Protein Details
Accession A0A5N6TRI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-58SRLNRAFGKKTQKRRKAVPPGLSEHydrophilic
204-235RESHRHNRNTGPSKNRPAKHAHENRKQTRWFGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-51GKKTQKRRKA
214-223GPSKNRPAKH
Subcellular Location(s) mito 9, extr 5, E.R. 4, nucl 2, cyto 2, plas 2, cyto_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025187  DUF4112  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13430  DUF4112  
Amino Acid Sequences MSGQLVSLVGKRILAESARNHFGQEDPYFEEVPASRLNRAFGKKTQKRRKAVPPGLSENDRKVLTQVKRRAYRLDLCLFSLCGIRFGWSSVIALVPFAGDAADAALAMMVVKTCEKIDGGLPARLRMMMMINVIIDFVIGLVPFVGDIADAMYKCNTRNAVILEKYLREKGAKTISKQRNDVDPSLPDEFDRYDQTLVDGPSRRESHRHNRNTGPSKNRPAKHAHENRKQTRWFGGASHPADDLERGVVDNSQARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.25
4 0.31
5 0.34
6 0.34
7 0.33
8 0.31
9 0.31
10 0.32
11 0.27
12 0.24
13 0.24
14 0.27
15 0.27
16 0.26
17 0.27
18 0.21
19 0.22
20 0.24
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.26
25 0.31
26 0.36
27 0.38
28 0.4
29 0.5
30 0.55
31 0.65
32 0.73
33 0.76
34 0.78
35 0.82
36 0.85
37 0.85
38 0.86
39 0.83
40 0.79
41 0.78
42 0.76
43 0.71
44 0.63
45 0.55
46 0.5
47 0.42
48 0.34
49 0.28
50 0.31
51 0.34
52 0.41
53 0.46
54 0.5
55 0.57
56 0.59
57 0.62
58 0.59
59 0.59
60 0.56
61 0.54
62 0.46
63 0.41
64 0.39
65 0.34
66 0.29
67 0.25
68 0.18
69 0.14
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.08
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.02
87 0.02
88 0.02
89 0.02
90 0.02
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.02
95 0.02
96 0.02
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.12
106 0.14
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.1
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.04
123 0.03
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.15
146 0.17
147 0.22
148 0.22
149 0.24
150 0.23
151 0.24
152 0.25
153 0.24
154 0.22
155 0.17
156 0.17
157 0.21
158 0.29
159 0.31
160 0.33
161 0.43
162 0.5
163 0.55
164 0.58
165 0.55
166 0.53
167 0.54
168 0.52
169 0.45
170 0.38
171 0.37
172 0.35
173 0.33
174 0.24
175 0.21
176 0.2
177 0.19
178 0.2
179 0.17
180 0.15
181 0.15
182 0.17
183 0.19
184 0.18
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.29
189 0.32
190 0.33
191 0.35
192 0.43
193 0.48
194 0.56
195 0.62
196 0.62
197 0.68
198 0.76
199 0.8
200 0.8
201 0.78
202 0.77
203 0.79
204 0.81
205 0.76
206 0.7
207 0.69
208 0.68
209 0.69
210 0.71
211 0.71
212 0.72
213 0.8
214 0.83
215 0.85
216 0.81
217 0.73
218 0.69
219 0.62
220 0.53
221 0.45
222 0.45
223 0.45
224 0.44
225 0.41
226 0.35
227 0.32
228 0.31
229 0.29
230 0.22
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.14