Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M4B5

Protein Details
Accession C5M4B5    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
190-214NGDDVKKSKKRKGPKEPNPLSVKKKBasic
218-247VNNDESQEKKKKPNRRRKHKKSGDGIDNEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-239KKSKKRKGPKEPNPLSVKKKKKVVNNDESQEKKKKPNRRRKHKKS
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ctp:CTRG_00905  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRQKRAKSYKKQMSVYTNTFKFRTPFQVIIDPEILITTNSQSFDILKGLARTIQSESKPMITQCCIESIYQTKNQELIDFAKSFERRKCNHKEIINPSDCIESIVNINGENKHRYIIASQDLNLRKKLRKIPGIPLIYMNRSVMVMEPLSDASKKYNENIENLKLTAGLNSKDAGKLDEIKNIQEKIGENGDDVKKSKKRKGPKEPNPLSVKKKKKVVNNDESQEKKKKPNRRRKHKKSGDGIDNEDDGKDEKIGQVESKPEEEVESRPEAEVESKVDVENSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.75
4 0.69
5 0.64
6 0.59
7 0.54
8 0.47
9 0.43
10 0.44
11 0.41
12 0.4
13 0.4
14 0.47
15 0.45
16 0.47
17 0.43
18 0.34
19 0.27
20 0.24
21 0.2
22 0.12
23 0.12
24 0.1
25 0.11
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.18
40 0.24
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.26
45 0.28
46 0.28
47 0.28
48 0.23
49 0.24
50 0.21
51 0.22
52 0.2
53 0.18
54 0.2
55 0.21
56 0.24
57 0.28
58 0.29
59 0.27
60 0.29
61 0.29
62 0.26
63 0.23
64 0.22
65 0.2
66 0.19
67 0.19
68 0.23
69 0.25
70 0.29
71 0.33
72 0.38
73 0.37
74 0.46
75 0.55
76 0.56
77 0.62
78 0.62
79 0.65
80 0.66
81 0.72
82 0.66
83 0.57
84 0.51
85 0.44
86 0.38
87 0.31
88 0.22
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.15
97 0.16
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.23
108 0.27
109 0.29
110 0.32
111 0.32
112 0.3
113 0.36
114 0.43
115 0.43
116 0.47
117 0.49
118 0.53
119 0.58
120 0.57
121 0.51
122 0.47
123 0.41
124 0.34
125 0.31
126 0.23
127 0.14
128 0.12
129 0.11
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.11
141 0.11
142 0.13
143 0.19
144 0.2
145 0.23
146 0.27
147 0.28
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.15
164 0.16
165 0.21
166 0.21
167 0.23
168 0.27
169 0.26
170 0.24
171 0.21
172 0.21
173 0.19
174 0.21
175 0.19
176 0.15
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.23
181 0.28
182 0.31
183 0.38
184 0.46
185 0.48
186 0.57
187 0.66
188 0.76
189 0.8
190 0.84
191 0.89
192 0.87
193 0.87
194 0.85
195 0.81
196 0.79
197 0.77
198 0.77
199 0.72
200 0.74
201 0.72
202 0.73
203 0.77
204 0.78
205 0.78
206 0.77
207 0.75
208 0.76
209 0.75
210 0.73
211 0.7
212 0.65
213 0.65
214 0.64
215 0.7
216 0.72
217 0.78
218 0.82
219 0.85
220 0.92
221 0.93
222 0.96
223 0.96
224 0.95
225 0.94
226 0.93
227 0.91
228 0.85
229 0.79
230 0.71
231 0.61
232 0.52
233 0.41
234 0.31
235 0.23
236 0.18
237 0.14
238 0.11
239 0.12
240 0.14
241 0.16
242 0.17
243 0.19
244 0.23
245 0.26
246 0.27
247 0.26
248 0.23
249 0.25
250 0.24
251 0.24
252 0.23
253 0.24
254 0.23
255 0.23
256 0.23
257 0.21
258 0.22
259 0.21
260 0.19
261 0.19
262 0.19
263 0.19