Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDV8

Protein Details
Accession C5MDV8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-26FFKLHFVNKPLKSRKTRYIIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002454  Gamma_tubulin  
IPR008280  Tub_FtsZ_C  
IPR000217  Tubulin  
IPR018316  Tubulin/FtsZ_2-layer-sand-dom  
IPR036525  Tubulin/FtsZ_GTPase_sf  
IPR023123  Tubulin_C  
IPR017975  Tubulin_CS  
IPR003008  Tubulin_FtsZ_GTPase  
Gene Ontology GO:0008275  C:gamma-tubulin small complex  
GO:0005822  C:inner plaque of spindle pole body  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0005824  C:outer plaque of spindle pole body  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0005200  F:structural constituent of cytoskeleton  
GO:0031122  P:cytoplasmic microtubule organization  
GO:0051417  P:microtubule nucleation by spindle pole body  
GO:0007052  P:mitotic spindle organization  
GO:2000767  P:positive regulation of cytoplasmic translation  
KEGG ctp:CTRG_03860  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00091  Tubulin  
PF03953  Tubulin_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00227  TUBULIN  
CDD cd02188  gamma_tubulin  
Amino Acid Sequences MPDFFFFFKLHFVNKPLKSRKTRYIIIYFYIDFTNKPLQDTMPGETITLQVGQCGNQVGLQYWQQLSLEHGINSDGSSNPYPINTNNKFQFQNLTSTSNNNESSTKYRDDHPELFFTLSDSNRYTPRSILIDMEPSVIGKSTSTLPMFNPRNVHLSEQGNSAANNWINGYKYGTEEEEALINLIDREADKCNNLSNFQLFHSVAGGTGSGVGSKILELISDRYGHKKLLNTFSIFPSNEDTSDVVVQPYNTILTLKRLIDYSDATFIYHNDSLNRIENLLFNNNMQSNNNNNDDLFLGANKLIASVTASLSNPLRFPGYMYSSIESIISNLVPTPDLKFLTSAIAPFSSQKHNYINEYDMILELSNDRYKTNRVSNETNYITMLNYLIGDNLDQREIRKGILKSQQRTPFVPWAARSVQVVHGKKSPFIKSSNNLDGVQITNNTSIIEVFTKILKQYDLLIKRKAYLNRYYSSLEEENEVMELFSQSREAVKSIVEEYKACKELNYLDDEDDDDGDFGISGGADNDAITQDQDMDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.55
3 0.59
4 0.66
5 0.72
6 0.76
7 0.81
8 0.8
9 0.79
10 0.77
11 0.76
12 0.7
13 0.64
14 0.61
15 0.51
16 0.45
17 0.4
18 0.32
19 0.24
20 0.25
21 0.29
22 0.25
23 0.27
24 0.27
25 0.25
26 0.31
27 0.34
28 0.33
29 0.28
30 0.28
31 0.26
32 0.25
33 0.24
34 0.19
35 0.18
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.12
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.18
50 0.19
51 0.17
52 0.17
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.15
62 0.11
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.18
69 0.21
70 0.3
71 0.3
72 0.37
73 0.4
74 0.45
75 0.45
76 0.44
77 0.48
78 0.39
79 0.42
80 0.38
81 0.38
82 0.34
83 0.35
84 0.38
85 0.35
86 0.35
87 0.29
88 0.27
89 0.26
90 0.31
91 0.33
92 0.34
93 0.3
94 0.34
95 0.41
96 0.47
97 0.49
98 0.47
99 0.45
100 0.42
101 0.41
102 0.36
103 0.29
104 0.26
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.22
110 0.25
111 0.24
112 0.21
113 0.25
114 0.25
115 0.24
116 0.25
117 0.23
118 0.24
119 0.23
120 0.23
121 0.19
122 0.16
123 0.15
124 0.12
125 0.1
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.25
134 0.29
135 0.3
136 0.31
137 0.29
138 0.33
139 0.33
140 0.34
141 0.3
142 0.3
143 0.28
144 0.27
145 0.27
146 0.23
147 0.22
148 0.2
149 0.19
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.06
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.17
179 0.18
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.21
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.13
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.11
208 0.12
209 0.15
210 0.16
211 0.18
212 0.2
213 0.23
214 0.27
215 0.31
216 0.34
217 0.32
218 0.33
219 0.34
220 0.36
221 0.31
222 0.26
223 0.23
224 0.21
225 0.18
226 0.18
227 0.16
228 0.12
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.15
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.15
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.16
275 0.19
276 0.21
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.17
281 0.16
282 0.12
283 0.08
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.13
313 0.09
314 0.08
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.13
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.17
336 0.18
337 0.21
338 0.25
339 0.27
340 0.3
341 0.3
342 0.29
343 0.25
344 0.24
345 0.2
346 0.16
347 0.14
348 0.11
349 0.08
350 0.07
351 0.09
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.17
357 0.22
358 0.3
359 0.34
360 0.37
361 0.43
362 0.46
363 0.52
364 0.5
365 0.45
366 0.38
367 0.31
368 0.26
369 0.2
370 0.16
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.08
378 0.08
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.16
383 0.17
384 0.18
385 0.23
386 0.23
387 0.29
388 0.38
389 0.45
390 0.44
391 0.53
392 0.6
393 0.57
394 0.59
395 0.56
396 0.55
397 0.51
398 0.5
399 0.42
400 0.4
401 0.38
402 0.36
403 0.32
404 0.26
405 0.29
406 0.35
407 0.36
408 0.33
409 0.37
410 0.37
411 0.4
412 0.44
413 0.42
414 0.36
415 0.39
416 0.43
417 0.44
418 0.52
419 0.55
420 0.52
421 0.47
422 0.44
423 0.41
424 0.35
425 0.3
426 0.23
427 0.18
428 0.15
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.1
436 0.1
437 0.12
438 0.13
439 0.14
440 0.16
441 0.15
442 0.14
443 0.19
444 0.27
445 0.34
446 0.38
447 0.43
448 0.42
449 0.45
450 0.51
451 0.52
452 0.49
453 0.5
454 0.51
455 0.48
456 0.51
457 0.5
458 0.44
459 0.44
460 0.4
461 0.32
462 0.28
463 0.25
464 0.22
465 0.19
466 0.18
467 0.11
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.11
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.15
480 0.19
481 0.23
482 0.22
483 0.22
484 0.25
485 0.32
486 0.34
487 0.32
488 0.28
489 0.27
490 0.31
491 0.34
492 0.36
493 0.3
494 0.28
495 0.29
496 0.3
497 0.28
498 0.23
499 0.19
500 0.13
501 0.11
502 0.09
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.08