Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MD35

Protein Details
Accession C5MD35    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-46ANRLYYLLPKIKKKKTKHECNHTDKPLKFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-32KKKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
KEGG ctp:CTRG_04136  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MGKHDLLSRESNSNPEPANRLYYLLPKIKKKKTKHECNHTDKPLKFAHSFSFTNSSPPIMLGRIRSTRRALNVYQTLRQRCCYATAASEDPVDHHKRLGLHEWPTSSNPTAYEIFGLSSKDMGMSPLELNKILKKRYVSLVKIYHPDTSLVLKHKGKEIDTDLKRKRFDMIQESYQILKNPRRRIAYNRFQTTTWEQQGMYRGHDKGPWSKENFEAHRRANAHRRRYDFKHDEEFWHAATWQDYYQMKYKRAPPTQEELDKNKYKILAGVLLFGAVGFGLQMINAVDNANKYLLETQQLNLKSMKALNDSYDNYGQGHSEADKVRRFLANRRSTMKSKQDHDDEEKLPEPNDDELLRRYAVKRLESWDRVDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.35
4 0.33
5 0.37
6 0.32
7 0.33
8 0.3
9 0.35
10 0.39
11 0.43
12 0.47
13 0.52
14 0.61
15 0.69
16 0.77
17 0.79
18 0.83
19 0.85
20 0.9
21 0.9
22 0.92
23 0.92
24 0.92
25 0.93
26 0.92
27 0.9
28 0.79
29 0.74
30 0.68
31 0.63
32 0.56
33 0.48
34 0.44
35 0.41
36 0.41
37 0.39
38 0.39
39 0.34
40 0.36
41 0.34
42 0.29
43 0.23
44 0.23
45 0.2
46 0.16
47 0.19
48 0.18
49 0.24
50 0.31
51 0.34
52 0.38
53 0.41
54 0.43
55 0.47
56 0.49
57 0.44
58 0.45
59 0.51
60 0.5
61 0.52
62 0.55
63 0.56
64 0.53
65 0.53
66 0.46
67 0.38
68 0.38
69 0.35
70 0.29
71 0.25
72 0.27
73 0.27
74 0.26
75 0.26
76 0.21
77 0.2
78 0.25
79 0.26
80 0.22
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.27
85 0.31
86 0.3
87 0.3
88 0.33
89 0.34
90 0.34
91 0.34
92 0.34
93 0.3
94 0.24
95 0.21
96 0.21
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.13
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.18
118 0.22
119 0.22
120 0.25
121 0.24
122 0.27
123 0.34
124 0.41
125 0.38
126 0.41
127 0.45
128 0.45
129 0.47
130 0.45
131 0.39
132 0.32
133 0.3
134 0.23
135 0.2
136 0.2
137 0.2
138 0.25
139 0.25
140 0.25
141 0.29
142 0.3
143 0.28
144 0.29
145 0.31
146 0.35
147 0.37
148 0.46
149 0.48
150 0.51
151 0.51
152 0.48
153 0.44
154 0.37
155 0.38
156 0.37
157 0.36
158 0.33
159 0.34
160 0.35
161 0.34
162 0.32
163 0.29
164 0.25
165 0.27
166 0.31
167 0.36
168 0.4
169 0.43
170 0.44
171 0.51
172 0.57
173 0.6
174 0.61
175 0.59
176 0.55
177 0.51
178 0.53
179 0.49
180 0.46
181 0.37
182 0.3
183 0.25
184 0.25
185 0.32
186 0.28
187 0.25
188 0.22
189 0.21
190 0.21
191 0.23
192 0.24
193 0.25
194 0.3
195 0.33
196 0.32
197 0.33
198 0.38
199 0.42
200 0.45
201 0.44
202 0.44
203 0.39
204 0.42
205 0.43
206 0.43
207 0.46
208 0.5
209 0.53
210 0.54
211 0.59
212 0.59
213 0.63
214 0.68
215 0.64
216 0.62
217 0.6
218 0.55
219 0.52
220 0.5
221 0.46
222 0.36
223 0.3
224 0.25
225 0.17
226 0.16
227 0.15
228 0.1
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.23
233 0.28
234 0.3
235 0.34
236 0.42
237 0.47
238 0.52
239 0.55
240 0.53
241 0.56
242 0.6
243 0.62
244 0.6
245 0.56
246 0.58
247 0.57
248 0.53
249 0.47
250 0.41
251 0.34
252 0.31
253 0.26
254 0.23
255 0.18
256 0.19
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.12
261 0.1
262 0.04
263 0.04
264 0.02
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.22
288 0.22
289 0.21
290 0.22
291 0.25
292 0.22
293 0.22
294 0.23
295 0.28
296 0.29
297 0.32
298 0.31
299 0.29
300 0.25
301 0.25
302 0.22
303 0.17
304 0.17
305 0.12
306 0.16
307 0.2
308 0.25
309 0.29
310 0.3
311 0.33
312 0.36
313 0.38
314 0.42
315 0.49
316 0.52
317 0.54
318 0.59
319 0.62
320 0.62
321 0.69
322 0.7
323 0.67
324 0.63
325 0.66
326 0.68
327 0.68
328 0.7
329 0.68
330 0.61
331 0.58
332 0.56
333 0.49
334 0.42
335 0.36
336 0.31
337 0.25
338 0.27
339 0.23
340 0.22
341 0.24
342 0.26
343 0.26
344 0.27
345 0.27
346 0.29
347 0.34
348 0.36
349 0.37
350 0.41
351 0.5
352 0.51