Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TJU9

Protein Details
Accession A0A5N6TJU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-171FSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPHydrophilic
366-386MKSNKRGTYYRKRTRWARAQSHydrophilic
543-563AGNPGRKKRKVVTQQTSTPADHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 12.5, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYVRPHQYVALRLPSEFTKIQKIEPDSTVFLGKFGSFPTNQIIGRPFYLTFEILDNSDENGNCLRVIPAAELHAETLIAEGEGDGDEVEVNEDGTPVRTNRETVDDASTQKLTVEEIEALKKECGGAGREIIAKLLESHSALDQKTTFSLAKYMLRKRRKYMKRFTVLPLDVSILMNHMMEDKDAAKIMEMRDESMGLLGCMGNVHHGGNLSLDEALAVKPNGRYLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPHDGEEYEEQVSSEQPKTDEADQTQNDEHPAADSTSKRPLRGQMPAPQNSITLLHPNKQANLSLLKYFGFSQDSLDDSHPLSRHLKTVSWLQLLDPSSDPIYSQEPEILSEEELFAMKSNKRGTYYRKRTRWARAQSVVNEARAGEFDGLIVATLMDPTSVLKHTVPLLSGSAHVSVYAPSIEPLTELMDLYSTQRRTAYINRRQLLREQKLQDSEQNNASENEPQDSEFPELLEEFTLDPTLLLVPTIETSRVRPWQVLPGRTHPMMSLRGGAEGYIFHAIRVIPTQQIIQAAGNPGRKKRKVVTQQTSTPADSASGVDVEMKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.38
4 0.39
5 0.35
6 0.32
7 0.33
8 0.34
9 0.37
10 0.42
11 0.46
12 0.45
13 0.45
14 0.47
15 0.39
16 0.39
17 0.4
18 0.32
19 0.27
20 0.23
21 0.2
22 0.16
23 0.16
24 0.19
25 0.15
26 0.18
27 0.23
28 0.26
29 0.26
30 0.29
31 0.3
32 0.28
33 0.29
34 0.3
35 0.25
36 0.22
37 0.25
38 0.22
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.16
43 0.17
44 0.15
45 0.14
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.14
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.11
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.06
78 0.05
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.19
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.3
94 0.28
95 0.29
96 0.31
97 0.29
98 0.23
99 0.21
100 0.19
101 0.14
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.16
107 0.17
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.15
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.18
118 0.19
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.11
128 0.12
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.18
136 0.16
137 0.13
138 0.15
139 0.16
140 0.22
141 0.29
142 0.37
143 0.44
144 0.53
145 0.58
146 0.64
147 0.73
148 0.76
149 0.79
150 0.81
151 0.82
152 0.8
153 0.8
154 0.76
155 0.75
156 0.65
157 0.56
158 0.46
159 0.37
160 0.29
161 0.25
162 0.2
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.11
177 0.11
178 0.15
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.06
187 0.07
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.09
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.11
253 0.13
254 0.15
255 0.17
256 0.16
257 0.22
258 0.21
259 0.24
260 0.23
261 0.21
262 0.2
263 0.17
264 0.15
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.09
269 0.1
270 0.12
271 0.21
272 0.22
273 0.22
274 0.23
275 0.27
276 0.28
277 0.33
278 0.36
279 0.35
280 0.41
281 0.43
282 0.44
283 0.39
284 0.35
285 0.3
286 0.27
287 0.19
288 0.19
289 0.17
290 0.18
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.24
295 0.24
296 0.19
297 0.21
298 0.19
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.11
314 0.14
315 0.13
316 0.15
317 0.17
318 0.16
319 0.18
320 0.19
321 0.19
322 0.18
323 0.25
324 0.27
325 0.26
326 0.25
327 0.22
328 0.25
329 0.25
330 0.25
331 0.18
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.1
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.12
343 0.14
344 0.13
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.09
353 0.1
354 0.15
355 0.18
356 0.2
357 0.24
358 0.29
359 0.37
360 0.45
361 0.56
362 0.61
363 0.65
364 0.71
365 0.75
366 0.8
367 0.81
368 0.79
369 0.77
370 0.73
371 0.72
372 0.66
373 0.67
374 0.59
375 0.5
376 0.41
377 0.31
378 0.25
379 0.19
380 0.18
381 0.09
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.13
401 0.13
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.11
428 0.17
429 0.15
430 0.16
431 0.17
432 0.18
433 0.22
434 0.32
435 0.4
436 0.43
437 0.52
438 0.55
439 0.58
440 0.59
441 0.63
442 0.64
443 0.61
444 0.6
445 0.55
446 0.57
447 0.58
448 0.58
449 0.58
450 0.49
451 0.46
452 0.42
453 0.39
454 0.35
455 0.31
456 0.3
457 0.27
458 0.26
459 0.25
460 0.2
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.22
465 0.17
466 0.16
467 0.15
468 0.14
469 0.14
470 0.13
471 0.11
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.08
484 0.09
485 0.11
486 0.11
487 0.14
488 0.21
489 0.27
490 0.28
491 0.29
492 0.31
493 0.39
494 0.46
495 0.49
496 0.48
497 0.49
498 0.54
499 0.52
500 0.5
501 0.41
502 0.39
503 0.36
504 0.32
505 0.29
506 0.23
507 0.24
508 0.23
509 0.21
510 0.17
511 0.13
512 0.14
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.15
517 0.15
518 0.16
519 0.19
520 0.19
521 0.15
522 0.17
523 0.18
524 0.18
525 0.2
526 0.2
527 0.17
528 0.19
529 0.22
530 0.27
531 0.33
532 0.35
533 0.42
534 0.51
535 0.55
536 0.59
537 0.61
538 0.67
539 0.71
540 0.78
541 0.79
542 0.78
543 0.81
544 0.81
545 0.78
546 0.68
547 0.58
548 0.47
549 0.38
550 0.29
551 0.22
552 0.17
553 0.12
554 0.11