Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6U297

Protein Details
Accession A0A5N6U297    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-280ITDVRRPSTVPRKRRRRAMKRNPSTSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-273TVPRKRRRRAMKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MPDEKGKRRISTLDAPVSPPQKRSSTKPASSPENQSSTLHIHLKTTSSPDSHSLAEIEAGRIEVTDHLSIFAARLNQALRPGIPQSPRLNIPDWIGLYQRNQHPDGRHFVIHQHDHPIAGPHYDLRLQFSESSSVSWSIMYGLPGNPNSRRITRNAIETRVHCLWNHLIETASPVTGSMIIWDTGEYEVLPYQIEQPDTDDSHSETSSEKSSTLYEKESEKLCQAFQNRKIRLRLHGTRLPENYTFSLRLDKITDVRRPSTVPRKRRRRAMKRNPSTSSSDISPDSNSNATPISGHESSSVPDNHGGEHSDAEGDVDEQIRINNAYPGSTNLIGSIHQRRWFATLDRVNSGFVGEPGSGPARKNWVRRWDPKAEKMLGFEPFFVHGPDAERSVVTGRLGRDVLMDERVKGFVSRKGWRPVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.56
3 0.58
4 0.6
5 0.55
6 0.49
7 0.46
8 0.46
9 0.49
10 0.53
11 0.57
12 0.6
13 0.63
14 0.68
15 0.69
16 0.69
17 0.7
18 0.71
19 0.67
20 0.62
21 0.58
22 0.5
23 0.47
24 0.43
25 0.42
26 0.39
27 0.33
28 0.3
29 0.29
30 0.31
31 0.3
32 0.31
33 0.3
34 0.26
35 0.28
36 0.3
37 0.31
38 0.29
39 0.27
40 0.22
41 0.18
42 0.2
43 0.18
44 0.15
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.14
64 0.17
65 0.18
66 0.16
67 0.18
68 0.2
69 0.24
70 0.26
71 0.31
72 0.32
73 0.35
74 0.38
75 0.38
76 0.38
77 0.34
78 0.34
79 0.32
80 0.29
81 0.26
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.28
86 0.3
87 0.3
88 0.31
89 0.35
90 0.38
91 0.41
92 0.45
93 0.42
94 0.39
95 0.35
96 0.37
97 0.4
98 0.4
99 0.36
100 0.35
101 0.31
102 0.3
103 0.3
104 0.29
105 0.22
106 0.18
107 0.17
108 0.13
109 0.14
110 0.17
111 0.16
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.13
131 0.15
132 0.18
133 0.18
134 0.22
135 0.24
136 0.27
137 0.29
138 0.29
139 0.36
140 0.35
141 0.43
142 0.43
143 0.44
144 0.44
145 0.42
146 0.46
147 0.4
148 0.38
149 0.28
150 0.27
151 0.25
152 0.24
153 0.23
154 0.17
155 0.15
156 0.13
157 0.16
158 0.14
159 0.11
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.11
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.19
211 0.23
212 0.28
213 0.35
214 0.44
215 0.46
216 0.5
217 0.55
218 0.53
219 0.54
220 0.55
221 0.53
222 0.51
223 0.51
224 0.49
225 0.5
226 0.49
227 0.47
228 0.39
229 0.35
230 0.29
231 0.28
232 0.25
233 0.19
234 0.23
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.18
239 0.21
240 0.25
241 0.29
242 0.28
243 0.29
244 0.3
245 0.3
246 0.36
247 0.42
248 0.46
249 0.51
250 0.59
251 0.68
252 0.74
253 0.82
254 0.86
255 0.87
256 0.89
257 0.9
258 0.91
259 0.9
260 0.92
261 0.86
262 0.79
263 0.73
264 0.64
265 0.56
266 0.45
267 0.38
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.19
272 0.18
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.2
287 0.2
288 0.15
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.15
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.19
322 0.24
323 0.25
324 0.29
325 0.3
326 0.3
327 0.33
328 0.35
329 0.33
330 0.36
331 0.37
332 0.37
333 0.4
334 0.4
335 0.37
336 0.34
337 0.31
338 0.22
339 0.15
340 0.14
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.19
348 0.26
349 0.32
350 0.4
351 0.46
352 0.54
353 0.61
354 0.7
355 0.75
356 0.76
357 0.79
358 0.8
359 0.8
360 0.74
361 0.66
362 0.62
363 0.58
364 0.53
365 0.45
366 0.37
367 0.3
368 0.27
369 0.26
370 0.22
371 0.19
372 0.14
373 0.17
374 0.18
375 0.19
376 0.17
377 0.16
378 0.17
379 0.18
380 0.19
381 0.17
382 0.19
383 0.18
384 0.22
385 0.22
386 0.21
387 0.21
388 0.22
389 0.23
390 0.26
391 0.26
392 0.22
393 0.24
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.25
398 0.25
399 0.32
400 0.38
401 0.45
402 0.53