Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TJJ3

Protein Details
Accession A0A5N6TJJ3    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-133NSALSEEKPKRRGRKPASEKSENASKTKAAPRKKRTENTTKRENTVHydrophilic
277-301DEQQRPSKSKKPKAQTKKMNTITARHydrophilic
332-351KSQTVKRKSKAKPKAHEPDFBasic
604-626TAKSKTSAPSKPKSQKNPPPATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-122KPKRRGRKPASEKSENASKTKAAPRKKR
284-289KSKKPK
337-345KRKSKAKPK
493-514ARRAPSPKPRKAAAKPSRASRE
614-614K
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSTGTDIIVLSSSPDHIPTRTPAPPAYDPVKLFGLSPRSPSPPPPLSPTELFRPATRSRFFPVADKPPQTEKGEERTVKEITNLPKFNSALSEEKPKRRGRKPASEKSENASKTKAAPRKKRTENTTKRENTVNQILTGRVAKPGSTQLSTSGNKDTGVLNLETTPERKSTRGADWEHGGLQLEAAMKRRMDWTPPSKDSMHIVGLDEGGVQKEGHGFGDLLSEYGFNSEVSSCSNARVSGDDGPTKRRRIELVDPRLYPASKQASHDAEDKMSTEDEQQRPSKSKKPKAQTKKMNTITARVTARYLNELSENTDSSSKETSAPGEDSAIGKSQTVKRKSKAKPKAHEPDFVVLSPEAAAKSLENQDLIFGTCSQLEREDSPTTLREMQAAILESERCVATEPSSVITRDVRSTTTVSRFSKTRGLWSVASRDSEGSLVQQAEIIDLVDSPPTSKVPVAASNNRPKTSTKIDDRAPSLSQDQTFRTPTEDPPARRAPSPKPRKAAAKPSRASREPSSRPTGEQPTMPQYSGFTDTELSTQIAKYGFKAIKNRKKMIEMLQKCWESQHGKSMSTIPPVSQEKAPTSEPQIPSEKATRKTTTRKTTAKSKTSAPSKPKSQKNPPPATAVITPPRPSFIDVEEIQDSEEETIPSPSHYTFHPPTTKHLPISTTPSSPSRPRAKTSRSKTTTSPDLAEQITKAVRAQVPGTPSRPSWHEKIIMYDPIVLDDFAIWLNTEGLNLIGEDREVGAAFLRSWCESRGVCCCFRQSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.17
4 0.2
5 0.23
6 0.3
7 0.32
8 0.35
9 0.34
10 0.4
11 0.42
12 0.45
13 0.45
14 0.44
15 0.41
16 0.41
17 0.41
18 0.33
19 0.31
20 0.3
21 0.34
22 0.3
23 0.34
24 0.35
25 0.38
26 0.4
27 0.45
28 0.47
29 0.47
30 0.48
31 0.5
32 0.5
33 0.51
34 0.53
35 0.52
36 0.51
37 0.5
38 0.48
39 0.43
40 0.45
41 0.45
42 0.49
43 0.48
44 0.44
45 0.42
46 0.47
47 0.46
48 0.47
49 0.49
50 0.5
51 0.55
52 0.56
53 0.55
54 0.56
55 0.61
56 0.57
57 0.55
58 0.51
59 0.5
60 0.56
61 0.55
62 0.52
63 0.5
64 0.49
65 0.43
66 0.41
67 0.39
68 0.37
69 0.44
70 0.43
71 0.4
72 0.44
73 0.44
74 0.41
75 0.38
76 0.35
77 0.3
78 0.31
79 0.4
80 0.41
81 0.49
82 0.57
83 0.62
84 0.68
85 0.72
86 0.79
87 0.78
88 0.82
89 0.85
90 0.87
91 0.88
92 0.87
93 0.8
94 0.75
95 0.74
96 0.66
97 0.58
98 0.49
99 0.41
100 0.41
101 0.48
102 0.49
103 0.51
104 0.59
105 0.66
106 0.74
107 0.83
108 0.84
109 0.85
110 0.88
111 0.89
112 0.86
113 0.87
114 0.81
115 0.74
116 0.72
117 0.66
118 0.62
119 0.6
120 0.54
121 0.45
122 0.41
123 0.38
124 0.33
125 0.33
126 0.26
127 0.21
128 0.19
129 0.17
130 0.18
131 0.24
132 0.26
133 0.25
134 0.24
135 0.24
136 0.31
137 0.32
138 0.32
139 0.29
140 0.26
141 0.24
142 0.25
143 0.22
144 0.17
145 0.19
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.19
156 0.22
157 0.25
158 0.3
159 0.37
160 0.39
161 0.39
162 0.4
163 0.41
164 0.38
165 0.33
166 0.27
167 0.19
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.14
173 0.16
174 0.15
175 0.16
176 0.2
177 0.2
178 0.23
179 0.31
180 0.36
181 0.43
182 0.46
183 0.49
184 0.46
185 0.46
186 0.44
187 0.38
188 0.31
189 0.23
190 0.22
191 0.18
192 0.17
193 0.15
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.15
227 0.17
228 0.2
229 0.23
230 0.24
231 0.32
232 0.37
233 0.38
234 0.38
235 0.35
236 0.35
237 0.37
238 0.46
239 0.48
240 0.52
241 0.56
242 0.54
243 0.54
244 0.54
245 0.47
246 0.37
247 0.33
248 0.3
249 0.26
250 0.28
251 0.31
252 0.31
253 0.34
254 0.37
255 0.32
256 0.25
257 0.24
258 0.22
259 0.18
260 0.16
261 0.14
262 0.15
263 0.22
264 0.23
265 0.28
266 0.3
267 0.32
268 0.38
269 0.42
270 0.45
271 0.48
272 0.55
273 0.59
274 0.67
275 0.74
276 0.8
277 0.86
278 0.88
279 0.86
280 0.87
281 0.84
282 0.81
283 0.71
284 0.64
285 0.56
286 0.51
287 0.43
288 0.33
289 0.29
290 0.23
291 0.22
292 0.21
293 0.2
294 0.14
295 0.15
296 0.14
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.13
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.14
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.09
318 0.08
319 0.12
320 0.18
321 0.25
322 0.33
323 0.38
324 0.42
325 0.52
326 0.6
327 0.67
328 0.71
329 0.73
330 0.74
331 0.78
332 0.83
333 0.77
334 0.74
335 0.65
336 0.59
337 0.5
338 0.42
339 0.33
340 0.22
341 0.19
342 0.13
343 0.12
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.07
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.09
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.15
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.12
393 0.11
394 0.13
395 0.13
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.13
400 0.15
401 0.17
402 0.2
403 0.26
404 0.26
405 0.27
406 0.27
407 0.28
408 0.33
409 0.3
410 0.31
411 0.28
412 0.3
413 0.31
414 0.32
415 0.34
416 0.29
417 0.29
418 0.24
419 0.21
420 0.17
421 0.15
422 0.13
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.1
444 0.16
445 0.22
446 0.28
447 0.36
448 0.44
449 0.49
450 0.48
451 0.47
452 0.43
453 0.43
454 0.44
455 0.44
456 0.42
457 0.43
458 0.46
459 0.49
460 0.5
461 0.47
462 0.39
463 0.34
464 0.29
465 0.26
466 0.24
467 0.21
468 0.22
469 0.22
470 0.23
471 0.22
472 0.23
473 0.22
474 0.22
475 0.29
476 0.33
477 0.31
478 0.36
479 0.42
480 0.41
481 0.42
482 0.45
483 0.46
484 0.5
485 0.59
486 0.6
487 0.59
488 0.62
489 0.68
490 0.7
491 0.71
492 0.7
493 0.7
494 0.66
495 0.69
496 0.72
497 0.66
498 0.64
499 0.59
500 0.6
501 0.55
502 0.57
503 0.56
504 0.5
505 0.5
506 0.51
507 0.5
508 0.42
509 0.38
510 0.35
511 0.34
512 0.35
513 0.32
514 0.26
515 0.21
516 0.22
517 0.24
518 0.21
519 0.15
520 0.14
521 0.15
522 0.15
523 0.16
524 0.14
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.19
532 0.21
533 0.24
534 0.34
535 0.43
536 0.52
537 0.6
538 0.65
539 0.61
540 0.62
541 0.63
542 0.63
543 0.63
544 0.58
545 0.56
546 0.58
547 0.55
548 0.51
549 0.47
550 0.43
551 0.36
552 0.33
553 0.36
554 0.31
555 0.31
556 0.32
557 0.37
558 0.33
559 0.34
560 0.33
561 0.24
562 0.28
563 0.31
564 0.32
565 0.29
566 0.29
567 0.26
568 0.3
569 0.32
570 0.27
571 0.29
572 0.35
573 0.34
574 0.35
575 0.38
576 0.35
577 0.37
578 0.42
579 0.44
580 0.42
581 0.47
582 0.48
583 0.51
584 0.6
585 0.66
586 0.68
587 0.7
588 0.72
589 0.71
590 0.76
591 0.78
592 0.76
593 0.69
594 0.66
595 0.66
596 0.66
597 0.69
598 0.67
599 0.66
600 0.69
601 0.75
602 0.78
603 0.79
604 0.81
605 0.83
606 0.86
607 0.87
608 0.79
609 0.76
610 0.68
611 0.62
612 0.54
613 0.5
614 0.45
615 0.41
616 0.41
617 0.35
618 0.36
619 0.33
620 0.32
621 0.28
622 0.24
623 0.26
624 0.23
625 0.27
626 0.25
627 0.24
628 0.22
629 0.2
630 0.18
631 0.13
632 0.14
633 0.1
634 0.1
635 0.12
636 0.12
637 0.13
638 0.14
639 0.13
640 0.13
641 0.14
642 0.21
643 0.23
644 0.31
645 0.37
646 0.37
647 0.43
648 0.51
649 0.55
650 0.49
651 0.48
652 0.44
653 0.41
654 0.48
655 0.45
656 0.38
657 0.36
658 0.38
659 0.4
660 0.42
661 0.47
662 0.5
663 0.51
664 0.55
665 0.62
666 0.67
667 0.72
668 0.76
669 0.78
670 0.73
671 0.73
672 0.71
673 0.69
674 0.68
675 0.61
676 0.55
677 0.46
678 0.45
679 0.42
680 0.38
681 0.3
682 0.25
683 0.23
684 0.2
685 0.19
686 0.21
687 0.21
688 0.22
689 0.24
690 0.24
691 0.28
692 0.33
693 0.35
694 0.33
695 0.32
696 0.34
697 0.37
698 0.39
699 0.39
700 0.4
701 0.44
702 0.42
703 0.47
704 0.48
705 0.47
706 0.43
707 0.41
708 0.34
709 0.3
710 0.29
711 0.22
712 0.17
713 0.12
714 0.12
715 0.09
716 0.09
717 0.07
718 0.07
719 0.09
720 0.08
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.09
736 0.1
737 0.12
738 0.14
739 0.15
740 0.17
741 0.19
742 0.23
743 0.23
744 0.27
745 0.34
746 0.38
747 0.4
748 0.42