Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M617

Protein Details
Accession C5M617    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-137IANNKFHQKKIKKLLKQLKNGMVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051254  P:positive regulation of RNA metabolic process  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG ctp:CTRG_01298  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MEIYKSVEKQSKLKTFSNQSIMMTFMDKNHGDDDDDDDDSSDDFLSGSEEEEEDYSDLPEDAVESIHFLKDSILQLSEQTAKLDHEYEKLAAKKIRKNNLATIEAKKEKIQSTIANNKFHQKKIKKLLKQLKNGMVTEFNLIWMLKTDLEKYMSSNGDYAFTKETELYDDIFTQIAAVDEDYSEIHDDSQLMEEAPEQLPPQQQKPSTNGSALTSSSSQTTPSPRIAKANGHVKESSGEPTSRSHQLSSVSTDTSHHSSVQQNSHNQQHESDIHHSSAQLLPKKSPEITSPGFVRTLKPASTPSKPVGSLKWSAAAAAAIPEVHERAKSVEPESNGLHQVKSNSVEAQLVKDESKQQNQKSPFVTPAPLQVGNINTEQFKDVIKNSSLSKTESGLFSDMNLVRVPPGIQDLVISFASKRYNDEFKVLVDSNDFNQFNLPLNKPYLPEIVQPNYYSQFTNFSFKHPGQLTKFQSYWNQVRASFGFEKLVNEIKTLTAQNLPENVPTITELTFVLFYGFYYGVTPAENLIAESYLFELGWKPYKTQLEGNHNNNLINSPLSATPNGVESKNKSSYYYYWFKRVKLISRGEEVGQTSNIEFGDYQVFDLTFWEIFVKYGFKFDYSLCQLEPSKSLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.71
4 0.7
5 0.62
6 0.55
7 0.5
8 0.46
9 0.38
10 0.32
11 0.24
12 0.19
13 0.23
14 0.22
15 0.23
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.22
20 0.26
21 0.23
22 0.24
23 0.22
24 0.2
25 0.2
26 0.18
27 0.17
28 0.11
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.12
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.11
57 0.15
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.16
62 0.17
63 0.2
64 0.23
65 0.19
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.19
70 0.22
71 0.2
72 0.19
73 0.21
74 0.21
75 0.27
76 0.28
77 0.32
78 0.34
79 0.4
80 0.47
81 0.53
82 0.62
83 0.62
84 0.65
85 0.67
86 0.69
87 0.68
88 0.63
89 0.6
90 0.59
91 0.56
92 0.53
93 0.47
94 0.45
95 0.41
96 0.4
97 0.38
98 0.35
99 0.4
100 0.5
101 0.53
102 0.54
103 0.53
104 0.59
105 0.6
106 0.6
107 0.62
108 0.58
109 0.62
110 0.67
111 0.76
112 0.74
113 0.8
114 0.84
115 0.83
116 0.86
117 0.84
118 0.81
119 0.76
120 0.69
121 0.61
122 0.53
123 0.44
124 0.38
125 0.29
126 0.21
127 0.16
128 0.15
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.23
140 0.22
141 0.21
142 0.21
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.16
148 0.15
149 0.16
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.08
161 0.08
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.11
186 0.16
187 0.18
188 0.22
189 0.25
190 0.28
191 0.31
192 0.35
193 0.39
194 0.37
195 0.35
196 0.33
197 0.28
198 0.27
199 0.24
200 0.21
201 0.16
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.17
208 0.18
209 0.23
210 0.27
211 0.26
212 0.3
213 0.32
214 0.34
215 0.36
216 0.42
217 0.38
218 0.38
219 0.37
220 0.33
221 0.32
222 0.29
223 0.25
224 0.18
225 0.16
226 0.15
227 0.17
228 0.2
229 0.24
230 0.24
231 0.21
232 0.21
233 0.23
234 0.24
235 0.25
236 0.23
237 0.19
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.18
243 0.15
244 0.16
245 0.2
246 0.25
247 0.29
248 0.31
249 0.32
250 0.35
251 0.41
252 0.41
253 0.37
254 0.33
255 0.31
256 0.29
257 0.29
258 0.29
259 0.25
260 0.22
261 0.22
262 0.21
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.21
267 0.2
268 0.21
269 0.22
270 0.24
271 0.24
272 0.22
273 0.19
274 0.21
275 0.21
276 0.23
277 0.22
278 0.21
279 0.22
280 0.21
281 0.2
282 0.18
283 0.19
284 0.16
285 0.16
286 0.21
287 0.23
288 0.26
289 0.28
290 0.26
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.24
295 0.23
296 0.22
297 0.19
298 0.2
299 0.17
300 0.16
301 0.14
302 0.12
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.03
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.08
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.16
318 0.17
319 0.19
320 0.2
321 0.19
322 0.2
323 0.19
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.15
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.18
340 0.2
341 0.28
342 0.33
343 0.34
344 0.41
345 0.44
346 0.48
347 0.43
348 0.41
349 0.37
350 0.32
351 0.31
352 0.24
353 0.25
354 0.23
355 0.21
356 0.2
357 0.18
358 0.17
359 0.18
360 0.18
361 0.14
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.21
374 0.22
375 0.22
376 0.22
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.15
382 0.14
383 0.12
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.07
393 0.09
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.1
403 0.13
404 0.13
405 0.16
406 0.18
407 0.23
408 0.24
409 0.27
410 0.26
411 0.24
412 0.29
413 0.26
414 0.22
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.24
419 0.23
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.21
424 0.25
425 0.25
426 0.2
427 0.23
428 0.25
429 0.25
430 0.27
431 0.25
432 0.22
433 0.25
434 0.28
435 0.28
436 0.29
437 0.28
438 0.28
439 0.28
440 0.27
441 0.23
442 0.18
443 0.2
444 0.2
445 0.27
446 0.24
447 0.26
448 0.32
449 0.31
450 0.38
451 0.35
452 0.4
453 0.39
454 0.48
455 0.49
456 0.48
457 0.49
458 0.44
459 0.47
460 0.47
461 0.47
462 0.44
463 0.41
464 0.35
465 0.39
466 0.37
467 0.38
468 0.33
469 0.28
470 0.26
471 0.23
472 0.24
473 0.23
474 0.29
475 0.22
476 0.21
477 0.2
478 0.18
479 0.2
480 0.2
481 0.19
482 0.16
483 0.17
484 0.19
485 0.22
486 0.23
487 0.2
488 0.22
489 0.2
490 0.17
491 0.16
492 0.15
493 0.12
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.08
501 0.07
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.11
524 0.19
525 0.2
526 0.21
527 0.27
528 0.33
529 0.36
530 0.4
531 0.46
532 0.49
533 0.58
534 0.61
535 0.61
536 0.57
537 0.54
538 0.48
539 0.4
540 0.31
541 0.23
542 0.18
543 0.13
544 0.14
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.15
549 0.18
550 0.2
551 0.2
552 0.22
553 0.24
554 0.32
555 0.37
556 0.38
557 0.37
558 0.39
559 0.42
560 0.45
561 0.5
562 0.46
563 0.5
564 0.53
565 0.52
566 0.56
567 0.59
568 0.59
569 0.59
570 0.64
571 0.59
572 0.61
573 0.62
574 0.54
575 0.51
576 0.44
577 0.37
578 0.3
579 0.25
580 0.2
581 0.19
582 0.18
583 0.15
584 0.13
585 0.12
586 0.16
587 0.15
588 0.15
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.15
593 0.16
594 0.1
595 0.11
596 0.12
597 0.1
598 0.11
599 0.13
600 0.15
601 0.13
602 0.18
603 0.19
604 0.18
605 0.2
606 0.21
607 0.29
608 0.31
609 0.34
610 0.29
611 0.34
612 0.35
613 0.36