Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TFH5

Protein Details
Accession A0A5N6TFH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-50YNAYRAHTTRKLHKLRKKIGQTTPKGRKYTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-46KLHKLRKKIGQTTPKGR
395-395K
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026258  SRP68  
IPR034652  SRP68-RBD  
IPR038253  SRP68_N_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0030942  F:endoplasmic reticulum signal peptide binding  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF16969  SRP68  
CDD cd15481  SRP68-RBD  
Amino Acid Sequences MDITNFIFSQREEVLLAGDYNAYRAHTTRKLHKLRKKIGQTTPKGRKYTAKPSVTAENVSSNITYVHILLLSSERAWAQAMQMKSAHSADPSAKGITGAARRHIISRFNKSAGYANELVQLLLDQTAGATDTDLLEARAYHASLSGALSLEKRKWEQCMQSYSVSKIIYSVLDRNNKKEAFRDLLSGTVDPSLRYAAYQMKLPRTTPLPSLAIGFFPSDSNLRSEVEKVDPNCLKEDAAGTRRTADGEVQQLPESITWRSRTVSLEDATISQALAAAAAAESRLKTWLSDASGKSASSKDKAAAYDNVIIASQDAVDATKMAIDDLTHEGVDPGDKRMQSLQITRTAVNFALVGWRIGRNRVLCGENDGVHGEADQTKLPKVGKASLQREQAKGKKLARLREKVVLYDSTLQSIEFILELPGVAADTDFVKELGAKRSYFRALRCLTIGRSHGILGKYKNALALFSQALALALESANSAQLSDGSEDLPKLDVSRGQIHTLESTLRALVSQHRGLVTLEKISEQQSKSITERPTIERLHEYPGDGLDLNNIVPYPPQMQPTPVKPLFLDVAWNYIDYPRESTISKAQDQGQAETATEEKKGARRGWFGFGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.15
4 0.11
5 0.12
6 0.11
7 0.11
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.14
12 0.22
13 0.28
14 0.35
15 0.44
16 0.54
17 0.64
18 0.72
19 0.8
20 0.83
21 0.85
22 0.89
23 0.89
24 0.88
25 0.88
26 0.88
27 0.89
28 0.89
29 0.9
30 0.88
31 0.81
32 0.75
33 0.74
34 0.71
35 0.72
36 0.72
37 0.66
38 0.6
39 0.61
40 0.66
41 0.59
42 0.53
43 0.43
44 0.37
45 0.33
46 0.32
47 0.27
48 0.19
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.1
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.18
67 0.18
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.22
74 0.16
75 0.19
76 0.19
77 0.22
78 0.23
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.21
84 0.26
85 0.24
86 0.25
87 0.28
88 0.28
89 0.32
90 0.35
91 0.38
92 0.39
93 0.46
94 0.48
95 0.46
96 0.46
97 0.45
98 0.48
99 0.41
100 0.4
101 0.32
102 0.27
103 0.3
104 0.29
105 0.27
106 0.2
107 0.18
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.11
136 0.13
137 0.15
138 0.18
139 0.21
140 0.22
141 0.28
142 0.34
143 0.4
144 0.43
145 0.48
146 0.47
147 0.5
148 0.5
149 0.46
150 0.43
151 0.35
152 0.28
153 0.22
154 0.2
155 0.16
156 0.16
157 0.2
158 0.23
159 0.32
160 0.34
161 0.37
162 0.43
163 0.44
164 0.43
165 0.41
166 0.4
167 0.37
168 0.37
169 0.37
170 0.29
171 0.3
172 0.3
173 0.25
174 0.2
175 0.16
176 0.15
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.11
183 0.14
184 0.15
185 0.19
186 0.23
187 0.28
188 0.3
189 0.3
190 0.31
191 0.29
192 0.3
193 0.28
194 0.28
195 0.23
196 0.22
197 0.23
198 0.2
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.17
214 0.2
215 0.19
216 0.26
217 0.27
218 0.27
219 0.28
220 0.26
221 0.23
222 0.19
223 0.21
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.2
231 0.18
232 0.14
233 0.13
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.19
250 0.21
251 0.19
252 0.18
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.13
257 0.1
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.07
274 0.09
275 0.11
276 0.17
277 0.17
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.18
290 0.17
291 0.18
292 0.19
293 0.18
294 0.17
295 0.14
296 0.13
297 0.1
298 0.09
299 0.06
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.06
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.17
326 0.18
327 0.22
328 0.22
329 0.25
330 0.27
331 0.27
332 0.26
333 0.24
334 0.21
335 0.17
336 0.14
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.17
346 0.15
347 0.17
348 0.2
349 0.2
350 0.18
351 0.22
352 0.22
353 0.19
354 0.19
355 0.18
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.18
370 0.23
371 0.32
372 0.37
373 0.4
374 0.49
375 0.5
376 0.51
377 0.55
378 0.54
379 0.51
380 0.53
381 0.5
382 0.49
383 0.5
384 0.56
385 0.58
386 0.59
387 0.56
388 0.56
389 0.53
390 0.48
391 0.46
392 0.38
393 0.31
394 0.31
395 0.27
396 0.21
397 0.2
398 0.18
399 0.15
400 0.14
401 0.12
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.07
419 0.1
420 0.16
421 0.19
422 0.19
423 0.21
424 0.25
425 0.31
426 0.33
427 0.32
428 0.34
429 0.33
430 0.35
431 0.35
432 0.34
433 0.31
434 0.32
435 0.32
436 0.25
437 0.24
438 0.22
439 0.24
440 0.23
441 0.25
442 0.22
443 0.26
444 0.26
445 0.25
446 0.27
447 0.23
448 0.22
449 0.18
450 0.2
451 0.15
452 0.14
453 0.13
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.08
458 0.05
459 0.05
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.11
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.12
480 0.16
481 0.24
482 0.25
483 0.27
484 0.28
485 0.28
486 0.28
487 0.26
488 0.23
489 0.16
490 0.15
491 0.13
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.16
496 0.22
497 0.22
498 0.23
499 0.23
500 0.25
501 0.25
502 0.28
503 0.24
504 0.2
505 0.19
506 0.18
507 0.19
508 0.22
509 0.29
510 0.25
511 0.27
512 0.26
513 0.3
514 0.32
515 0.38
516 0.36
517 0.34
518 0.39
519 0.4
520 0.45
521 0.42
522 0.43
523 0.43
524 0.42
525 0.43
526 0.4
527 0.36
528 0.3
529 0.29
530 0.27
531 0.21
532 0.19
533 0.14
534 0.14
535 0.12
536 0.11
537 0.1
538 0.08
539 0.09
540 0.11
541 0.14
542 0.16
543 0.19
544 0.2
545 0.26
546 0.32
547 0.37
548 0.45
549 0.41
550 0.4
551 0.37
552 0.4
553 0.36
554 0.3
555 0.31
556 0.21
557 0.24
558 0.23
559 0.23
560 0.19
561 0.2
562 0.22
563 0.18
564 0.22
565 0.2
566 0.22
567 0.23
568 0.26
569 0.32
570 0.36
571 0.37
572 0.38
573 0.4
574 0.44
575 0.46
576 0.44
577 0.41
578 0.35
579 0.32
580 0.29
581 0.27
582 0.22
583 0.2
584 0.19
585 0.19
586 0.24
587 0.31
588 0.35
589 0.4
590 0.46
591 0.49