Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M9B0

Protein Details
Accession C5M9B0    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MCCKKNKNRQHLTRQYEKYIYHydrophilic
418-446VAKVIGKKLGEKKKKNNKIKPAKGKVSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-124KPAASPKVSKTKASPKVKASPKAKQTPEK
423-446GKKLGEKKKKNNKIKPAKGKVSKK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG ctp:CTRG_02982  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MCCKKNKNRQHLTRQYEKYIYIKIVLIYTTLICSQKKMRNTEMRLKFFDFFLTTASLVYFFSNTKFFFFLNSILIMARTRSKTNAAASPASSKVTKPAASPKVSKTKASPKVKASPKAKQTPEKKEQESSIIPEKVLNKAISELKKFNERQQEAKENDEDKKSQLFDNDQEDEESFYLTIESKKFFSSKPQFKPKSIRLSKSIHPESTSTCLIIRDEFIKTDEMLEQLENETDLKINEFVPLKIVKNEYKNFEKRREFHSKFDFFLVDESILSIMPNALGKIFYQSKKFPIPIKVSSSGSPKELSLVTLKNQVNKALSSTSYLPPIGTNISVKIGFINYDTKDLIENINDVVKTLDINEIKSIHLKSTTSPALPLFYTDSLYSENDVAKEEEQEEEETEGKLTAFEEGLLELGDAEEVAKVIGKKLGEKKKKNNKIKPAKGKVSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.83
3 0.76
4 0.69
5 0.62
6 0.56
7 0.49
8 0.41
9 0.37
10 0.31
11 0.28
12 0.24
13 0.21
14 0.17
15 0.15
16 0.14
17 0.16
18 0.19
19 0.17
20 0.21
21 0.3
22 0.35
23 0.42
24 0.47
25 0.54
26 0.6
27 0.68
28 0.74
29 0.76
30 0.76
31 0.73
32 0.71
33 0.62
34 0.52
35 0.48
36 0.39
37 0.29
38 0.24
39 0.21
40 0.17
41 0.16
42 0.16
43 0.13
44 0.11
45 0.12
46 0.11
47 0.09
48 0.11
49 0.15
50 0.15
51 0.17
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.2
56 0.2
57 0.18
58 0.18
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.13
64 0.17
65 0.18
66 0.2
67 0.22
68 0.26
69 0.3
70 0.34
71 0.37
72 0.35
73 0.35
74 0.35
75 0.36
76 0.33
77 0.31
78 0.27
79 0.22
80 0.23
81 0.26
82 0.26
83 0.25
84 0.33
85 0.39
86 0.43
87 0.48
88 0.5
89 0.55
90 0.56
91 0.55
92 0.53
93 0.56
94 0.61
95 0.65
96 0.65
97 0.61
98 0.69
99 0.75
100 0.77
101 0.73
102 0.72
103 0.72
104 0.75
105 0.75
106 0.75
107 0.76
108 0.77
109 0.79
110 0.79
111 0.74
112 0.68
113 0.63
114 0.6
115 0.53
116 0.47
117 0.45
118 0.38
119 0.34
120 0.33
121 0.32
122 0.29
123 0.31
124 0.26
125 0.18
126 0.21
127 0.28
128 0.29
129 0.32
130 0.31
131 0.29
132 0.38
133 0.39
134 0.42
135 0.47
136 0.45
137 0.47
138 0.52
139 0.58
140 0.51
141 0.53
142 0.52
143 0.45
144 0.45
145 0.42
146 0.36
147 0.29
148 0.3
149 0.28
150 0.24
151 0.24
152 0.23
153 0.24
154 0.28
155 0.28
156 0.25
157 0.24
158 0.23
159 0.21
160 0.18
161 0.15
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.14
172 0.14
173 0.24
174 0.32
175 0.4
176 0.48
177 0.58
178 0.61
179 0.64
180 0.73
181 0.7
182 0.71
183 0.67
184 0.62
185 0.57
186 0.58
187 0.58
188 0.59
189 0.56
190 0.45
191 0.4
192 0.37
193 0.33
194 0.33
195 0.28
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.12
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.19
232 0.2
233 0.26
234 0.3
235 0.32
236 0.39
237 0.46
238 0.49
239 0.55
240 0.59
241 0.55
242 0.6
243 0.66
244 0.6
245 0.6
246 0.64
247 0.57
248 0.51
249 0.49
250 0.42
251 0.31
252 0.29
253 0.22
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.1
269 0.16
270 0.18
271 0.22
272 0.24
273 0.28
274 0.33
275 0.36
276 0.36
277 0.38
278 0.42
279 0.43
280 0.47
281 0.46
282 0.44
283 0.43
284 0.44
285 0.37
286 0.33
287 0.29
288 0.22
289 0.21
290 0.19
291 0.17
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.25
296 0.26
297 0.29
298 0.3
299 0.31
300 0.29
301 0.27
302 0.28
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.21
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.18
311 0.16
312 0.17
313 0.15
314 0.13
315 0.13
316 0.11
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.16
325 0.14
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.17
330 0.18
331 0.17
332 0.13
333 0.13
334 0.11
335 0.14
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.16
343 0.14
344 0.15
345 0.18
346 0.18
347 0.19
348 0.24
349 0.23
350 0.19
351 0.21
352 0.2
353 0.19
354 0.26
355 0.29
356 0.25
357 0.26
358 0.25
359 0.24
360 0.24
361 0.24
362 0.2
363 0.17
364 0.18
365 0.16
366 0.17
367 0.17
368 0.18
369 0.18
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.18
381 0.17
382 0.17
383 0.17
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.12
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.07
407 0.08
408 0.1
409 0.13
410 0.14
411 0.22
412 0.33
413 0.44
414 0.52
415 0.62
416 0.71
417 0.79
418 0.89
419 0.92
420 0.93
421 0.93
422 0.94
423 0.95
424 0.95
425 0.94
426 0.94