FuNGI

C5M7M8

Protein Details

Accession

C5M7M8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-21	SSSNKPQKSMKQDYIAKVRY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
195-196	RK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	ctp:CTRG_01860 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSSNKPQKSMKQDYIAKVRYTNNLPPPPLNPKFIAYNTTDPISTKQEGEYLMASLFRKENFQNLMERIDDQLGLNLNLINNHGFLSEEKIEAIGKLKYDQLHPKDRILLRDAGIGRISKNEPGVSFLRRTEYISERPLSKGSSGLSTANEEVKNKERLSKDEHFDASSQLLKVEEGFTVANESLNDLSKLKHPRKRHLKAVGAWPLLPDTSMMDNKFFNLKFIGSASIERELKQQQDRNKSNKEIINKALESSLFRPIKSDDGEWVSMFKIEDEEQIKNLYEKLHSTKREQPINLLDEEEEVIEEFKFKYKKNYDMSFQEFKQENEELAIKFVPVDEDNSEQLNGKSIKKRKIAYYYPINGKIDLKKHRASTNSEINKYIKEQTFDGINFKLREPTTNELKKMDTIRSEYDPMEYEGEDEEEEDDDDDDDEHGEDNQEPSQLHTQAVTDEKESSVENGDNHE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.8
3	0.76
4	0.68
5	0.64
6	0.6
7	0.57
8	0.56
9	0.57
10	0.56
11	0.58
12	0.59
13	0.57
14	0.58
15	0.61
16	0.59
17	0.55
18	0.47
19	0.43
20	0.45
21	0.44
22	0.43
23	0.38
24	0.4
25	0.38
26	0.37
27	0.34
28	0.29
29	0.32
30	0.33
31	0.3
32	0.25
33	0.23
34	0.24
35	0.25
36	0.25
37	0.22
38	0.17
39	0.15
40	0.17
41	0.17
42	0.17
43	0.18
44	0.17
45	0.2
46	0.2
47	0.26
48	0.28
49	0.3
50	0.33
51	0.33
52	0.35
53	0.32
54	0.32
55	0.27
56	0.24
57	0.22
58	0.16
59	0.17
60	0.16
61	0.15
62	0.15
63	0.14
64	0.13
65	0.13
66	0.14
67	0.12
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.15
74	0.15
75	0.15
76	0.14
77	0.15
78	0.15
79	0.15
80	0.17
81	0.12
82	0.11
83	0.13
84	0.16
85	0.17
86	0.23
87	0.32
88	0.36
89	0.45
90	0.46
91	0.48
92	0.53
93	0.54
94	0.52
95	0.47
96	0.43
97	0.34
98	0.38
99	0.36
100	0.29
101	0.28
102	0.25
103	0.21
104	0.22
105	0.23
106	0.18
107	0.2
108	0.2
109	0.18
110	0.21
111	0.24
112	0.23
113	0.24
114	0.23
115	0.25
116	0.24
117	0.26
118	0.27
119	0.29
120	0.31
121	0.33
122	0.34
123	0.32
124	0.33
125	0.32
126	0.29
127	0.24
128	0.21
129	0.17
130	0.17
131	0.17
132	0.16
133	0.16
134	0.16
135	0.17
136	0.19
137	0.19
138	0.18
139	0.2
140	0.24
141	0.29
142	0.27
143	0.32
144	0.3
145	0.33
146	0.41
147	0.44
148	0.42
149	0.42
150	0.43
151	0.37
152	0.36
153	0.33
154	0.26
155	0.21
156	0.18
157	0.13
158	0.12
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.1
174	0.08
175	0.09
176	0.15
177	0.25
178	0.32
179	0.38
180	0.43
181	0.53
182	0.64
183	0.7
184	0.73
185	0.73
186	0.72
187	0.69
188	0.72
189	0.7
190	0.59
191	0.52
192	0.43
193	0.34
194	0.27
195	0.22
196	0.13
197	0.07
198	0.09
199	0.11
200	0.11
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.17
205	0.15
206	0.13
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.12
211	0.13
212	0.09
213	0.1
214	0.11
215	0.14
216	0.14
217	0.14
218	0.17
219	0.17
220	0.2
221	0.25
222	0.28
223	0.31
224	0.41
225	0.48
226	0.52
227	0.56
228	0.54
229	0.55
230	0.54
231	0.52
232	0.46
233	0.42
234	0.4
235	0.34
236	0.32
237	0.27
238	0.24
239	0.21
240	0.19
241	0.24
242	0.2
243	0.19
244	0.2
245	0.21
246	0.24
247	0.23
248	0.22
249	0.16
250	0.18
251	0.2
252	0.18
253	0.18
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.1
258	0.08
259	0.08
260	0.12
261	0.14
262	0.14
263	0.14
264	0.16
265	0.16
266	0.15
267	0.15
268	0.13
269	0.11
270	0.13
271	0.19
272	0.26
273	0.28
274	0.33
275	0.41
276	0.47
277	0.53
278	0.5
279	0.48
280	0.47
281	0.47
282	0.42
283	0.34
284	0.26
285	0.2
286	0.2
287	0.15
288	0.09
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.11
295	0.14
296	0.15
297	0.25
298	0.3
299	0.38
300	0.46
301	0.5
302	0.5
303	0.54
304	0.61
305	0.56
306	0.51
307	0.51
308	0.44
309	0.4
310	0.39
311	0.32
312	0.25
313	0.22
314	0.25
315	0.17
316	0.17
317	0.17
318	0.12
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.14
326	0.15
327	0.16
328	0.16
329	0.16
330	0.15
331	0.19
332	0.2
333	0.23
334	0.31
335	0.38
336	0.46
337	0.51
338	0.56
339	0.57
340	0.64
341	0.65
342	0.65
343	0.68
344	0.67
345	0.68
346	0.69
347	0.62
348	0.55
349	0.52
350	0.5
351	0.48
352	0.49
353	0.48
354	0.47
355	0.51
356	0.55
357	0.55
358	0.57
359	0.56
360	0.59
361	0.61
362	0.58
363	0.57
364	0.53
365	0.51
366	0.46
367	0.46
368	0.39
369	0.33
370	0.32
371	0.3
372	0.34
373	0.33
374	0.33
375	0.28
376	0.3
377	0.29
378	0.28
379	0.33
380	0.28
381	0.31
382	0.33
383	0.37
384	0.42
385	0.48
386	0.49
387	0.45
388	0.46
389	0.47
390	0.45
391	0.44
392	0.39
393	0.37
394	0.39
395	0.41
396	0.43
397	0.38
398	0.36
399	0.33
400	0.3
401	0.27
402	0.22
403	0.18
404	0.16
405	0.17
406	0.14
407	0.12
408	0.11
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.12
424	0.13
425	0.15
426	0.14
427	0.19
428	0.25
429	0.25
430	0.24
431	0.23
432	0.23
433	0.24
434	0.29
435	0.26
436	0.21
437	0.21
438	0.21
439	0.21
440	0.22
441	0.19
442	0.19
443	0.2

C5M7M8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer