Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M5S0

Protein Details
Accession C5M5S0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1030-1050AELVMKEKEHQRQDRQRIMNLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
KEGG ctp:CTRG_01200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MTAELDNRRKELLELNIKAWDGEHTFKTASKLDSSLKKNSTFIKKVKSITHESSKSILKDIETLSIEKYLYEVLSSLTEALIKVNKNDDVVASMEIISALHQRFTSQFSPVLLINLLVAIANPPKGTQEEDEKEVSSRISKQRNVLKLIMEFYLIGVFSNLKMCNKDIIPDEILLKFGKSASEPIIIVVIKDLLNYQLKSGNSLVIVQSYLKRFHHVIYQDDNDLLQFEVRNVLRQIFTIYTNATYDTLIGLKKKVHQISERNKKASIRTGRILDEIQTELDSTTKIYEKFKSAAEFLSPVVGIPLPKQLEENDEPEANEENSNVVEVVKTKSMNEDELNGVWEDIKEKNFYTVIPSLGELIEAHPQTEEESQSGSRDGEKIQEFLNKLDNINSYDLDQLVVEFNNLNLNNKATKNRIMKFFMEAFSINSLKYYTRFLKINEVNLSDLIAELITYLDKGFRSQLYQNKLNFKNILFFVEMIKFKMIPTHVIFHKIRNLTINITSTNNIDILSVFYEHVGRFLLYDPDYKDLMRQMIDLLKEKSKQPNLKINDKLAINNLLVTVEPPATKVKALQEKQQLSPRAQFIQRLIRVELDSSSKSLVIRLLRKIPMKQDDECCATLLDCFAHPEFLNYDNIPALATVLESYCEKFKKIVVYTVDTIIENIIRGLELNDYRMNRVRMSQVKFIAEMYNHKVINFKLVNDLLYRIICFGHPNNQPLPNNWDVDIDLPDNYFRIQLCCFLLSNLRSIFIDTDPPSRRKAATRAIEMKKRNDVNKELLGVFITFLQYYIFCKERPLPVELEFKLNDLFTKFKSIPTVKRYETIQEIGQRLSESIQSKQEAESYLENHDDVLNGDEDEDEEEDDYDDDEDSEGDDDEDSDDEEEDSDDDDSDNDDDDDSEDEEEEISSSEEIDDEESDVDNESEKIRLENDKKFMDDLDKEYERIMIESYSSTPTTMSKSIGGSNVRGGTGALGGRLSMPLPRQVLAENKRSSTLESANQENKVSFGLLTRNGKKNDVKQLHLPSDNKFAELVMKEKEHQRQDRQRIMNLVSNMQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.44
4 0.44
5 0.41
6 0.35
7 0.29
8 0.23
9 0.24
10 0.24
11 0.24
12 0.25
13 0.27
14 0.31
15 0.31
16 0.3
17 0.28
18 0.31
19 0.35
20 0.43
21 0.47
22 0.52
23 0.53
24 0.53
25 0.54
26 0.59
27 0.62
28 0.61
29 0.63
30 0.64
31 0.65
32 0.68
33 0.71
34 0.7
35 0.68
36 0.67
37 0.7
38 0.64
39 0.6
40 0.59
41 0.58
42 0.52
43 0.47
44 0.41
45 0.31
46 0.33
47 0.31
48 0.32
49 0.28
50 0.28
51 0.26
52 0.26
53 0.25
54 0.2
55 0.19
56 0.14
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.12
68 0.15
69 0.16
70 0.18
71 0.22
72 0.23
73 0.24
74 0.24
75 0.22
76 0.19
77 0.2
78 0.18
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.15
90 0.17
91 0.23
92 0.24
93 0.21
94 0.23
95 0.22
96 0.25
97 0.24
98 0.24
99 0.18
100 0.16
101 0.13
102 0.1
103 0.09
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.12
112 0.14
113 0.17
114 0.19
115 0.27
116 0.3
117 0.34
118 0.35
119 0.34
120 0.34
121 0.32
122 0.29
123 0.23
124 0.26
125 0.31
126 0.38
127 0.41
128 0.48
129 0.56
130 0.62
131 0.64
132 0.59
133 0.55
134 0.49
135 0.47
136 0.39
137 0.31
138 0.24
139 0.19
140 0.17
141 0.12
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.12
147 0.14
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.23
152 0.23
153 0.26
154 0.25
155 0.28
156 0.28
157 0.27
158 0.28
159 0.23
160 0.24
161 0.21
162 0.18
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.13
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.2
173 0.18
174 0.17
175 0.15
176 0.13
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.21
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.13
193 0.14
194 0.12
195 0.16
196 0.17
197 0.21
198 0.21
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.31
203 0.3
204 0.33
205 0.35
206 0.37
207 0.34
208 0.34
209 0.32
210 0.24
211 0.22
212 0.16
213 0.11
214 0.08
215 0.07
216 0.13
217 0.14
218 0.17
219 0.18
220 0.2
221 0.19
222 0.19
223 0.22
224 0.17
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.21
241 0.29
242 0.32
243 0.35
244 0.42
245 0.51
246 0.6
247 0.69
248 0.71
249 0.66
250 0.65
251 0.63
252 0.6
253 0.59
254 0.58
255 0.53
256 0.51
257 0.51
258 0.5
259 0.49
260 0.45
261 0.36
262 0.29
263 0.23
264 0.18
265 0.15
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.11
273 0.13
274 0.16
275 0.19
276 0.22
277 0.24
278 0.26
279 0.27
280 0.25
281 0.24
282 0.23
283 0.21
284 0.17
285 0.16
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.21
298 0.23
299 0.25
300 0.22
301 0.22
302 0.22
303 0.22
304 0.23
305 0.17
306 0.15
307 0.13
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.09
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.16
320 0.17
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.15
328 0.13
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.09
348 0.08
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.26
374 0.21
375 0.2
376 0.22
377 0.22
378 0.2
379 0.21
380 0.2
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.12
385 0.1
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.1
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.14
397 0.17
398 0.19
399 0.23
400 0.21
401 0.29
402 0.35
403 0.38
404 0.43
405 0.43
406 0.42
407 0.43
408 0.42
409 0.34
410 0.28
411 0.25
412 0.2
413 0.19
414 0.18
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.15
421 0.15
422 0.18
423 0.21
424 0.22
425 0.31
426 0.32
427 0.37
428 0.35
429 0.33
430 0.3
431 0.28
432 0.27
433 0.16
434 0.14
435 0.08
436 0.05
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.11
449 0.16
450 0.22
451 0.28
452 0.34
453 0.37
454 0.45
455 0.46
456 0.46
457 0.43
458 0.37
459 0.35
460 0.29
461 0.27
462 0.19
463 0.17
464 0.16
465 0.18
466 0.18
467 0.14
468 0.14
469 0.12
470 0.11
471 0.14
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.18
476 0.18
477 0.25
478 0.26
479 0.25
480 0.31
481 0.28
482 0.27
483 0.25
484 0.26
485 0.21
486 0.22
487 0.22
488 0.17
489 0.17
490 0.17
491 0.14
492 0.14
493 0.12
494 0.1
495 0.08
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.09
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.14
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.11
520 0.11
521 0.09
522 0.11
523 0.13
524 0.15
525 0.15
526 0.17
527 0.18
528 0.21
529 0.27
530 0.32
531 0.36
532 0.38
533 0.45
534 0.48
535 0.54
536 0.55
537 0.5
538 0.47
539 0.42
540 0.37
541 0.3
542 0.28
543 0.19
544 0.16
545 0.14
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.09
556 0.1
557 0.16
558 0.24
559 0.25
560 0.31
561 0.39
562 0.41
563 0.45
564 0.5
565 0.46
566 0.4
567 0.42
568 0.38
569 0.33
570 0.31
571 0.3
572 0.26
573 0.32
574 0.32
575 0.31
576 0.29
577 0.26
578 0.25
579 0.24
580 0.22
581 0.16
582 0.14
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.13
589 0.15
590 0.18
591 0.21
592 0.26
593 0.3
594 0.33
595 0.35
596 0.38
597 0.41
598 0.41
599 0.41
600 0.4
601 0.39
602 0.4
603 0.38
604 0.32
605 0.25
606 0.21
607 0.17
608 0.14
609 0.1
610 0.06
611 0.08
612 0.07
613 0.09
614 0.09
615 0.1
616 0.11
617 0.12
618 0.14
619 0.12
620 0.12
621 0.11
622 0.11
623 0.1
624 0.08
625 0.07
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.05
631 0.05
632 0.06
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.12
637 0.14
638 0.21
639 0.22
640 0.27
641 0.26
642 0.3
643 0.31
644 0.31
645 0.3
646 0.23
647 0.21
648 0.16
649 0.12
650 0.08
651 0.07
652 0.05
653 0.04
654 0.04
655 0.05
656 0.07
657 0.08
658 0.1
659 0.14
660 0.14
661 0.17
662 0.22
663 0.23
664 0.21
665 0.23
666 0.28
667 0.32
668 0.36
669 0.39
670 0.37
671 0.37
672 0.36
673 0.35
674 0.3
675 0.23
676 0.23
677 0.22
678 0.25
679 0.23
680 0.23
681 0.25
682 0.22
683 0.3
684 0.27
685 0.22
686 0.22
687 0.22
688 0.23
689 0.21
690 0.23
691 0.16
692 0.15
693 0.14
694 0.1
695 0.1
696 0.09
697 0.12
698 0.12
699 0.19
700 0.23
701 0.26
702 0.29
703 0.35
704 0.36
705 0.36
706 0.41
707 0.35
708 0.33
709 0.3
710 0.27
711 0.21
712 0.21
713 0.2
714 0.15
715 0.12
716 0.11
717 0.1
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.08
722 0.1
723 0.1
724 0.13
725 0.14
726 0.15
727 0.15
728 0.14
729 0.2
730 0.18
731 0.22
732 0.19
733 0.19
734 0.17
735 0.18
736 0.19
737 0.14
738 0.19
739 0.17
740 0.25
741 0.29
742 0.31
743 0.33
744 0.33
745 0.35
746 0.34
747 0.4
748 0.41
749 0.43
750 0.5
751 0.57
752 0.62
753 0.68
754 0.68
755 0.65
756 0.64
757 0.63
758 0.6
759 0.56
760 0.54
761 0.52
762 0.51
763 0.49
764 0.4
765 0.35
766 0.3
767 0.24
768 0.19
769 0.13
770 0.1
771 0.07
772 0.07
773 0.07
774 0.07
775 0.09
776 0.12
777 0.13
778 0.13
779 0.16
780 0.21
781 0.26
782 0.29
783 0.3
784 0.3
785 0.32
786 0.4
787 0.37
788 0.38
789 0.32
790 0.3
791 0.27
792 0.24
793 0.21
794 0.16
795 0.17
796 0.13
797 0.21
798 0.2
799 0.21
800 0.3
801 0.35
802 0.4
803 0.45
804 0.52
805 0.46
806 0.49
807 0.49
808 0.45
809 0.44
810 0.38
811 0.36
812 0.34
813 0.34
814 0.31
815 0.3
816 0.26
817 0.22
818 0.2
819 0.21
820 0.17
821 0.19
822 0.23
823 0.24
824 0.24
825 0.25
826 0.26
827 0.23
828 0.24
829 0.23
830 0.2
831 0.21
832 0.21
833 0.21
834 0.18
835 0.17
836 0.14
837 0.11
838 0.12
839 0.1
840 0.09
841 0.09
842 0.08
843 0.08
844 0.09
845 0.09
846 0.07
847 0.07
848 0.07
849 0.08
850 0.08
851 0.08
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.07
859 0.06
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.07
864 0.07
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.08
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.07
877 0.08
878 0.08
879 0.09
880 0.08
881 0.08
882 0.08
883 0.09
884 0.1
885 0.1
886 0.1
887 0.09
888 0.09
889 0.09
890 0.09
891 0.08
892 0.07
893 0.07
894 0.06
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.08
900 0.07
901 0.07
902 0.08
903 0.08
904 0.09
905 0.1
906 0.09
907 0.09
908 0.09
909 0.09
910 0.1
911 0.11
912 0.11
913 0.14
914 0.23
915 0.29
916 0.36
917 0.42
918 0.43
919 0.44
920 0.44
921 0.43
922 0.4
923 0.37
924 0.34
925 0.36
926 0.34
927 0.33
928 0.33
929 0.33
930 0.26
931 0.23
932 0.2
933 0.12
934 0.12
935 0.13
936 0.15
937 0.16
938 0.16
939 0.15
940 0.15
941 0.16
942 0.2
943 0.2
944 0.2
945 0.19
946 0.21
947 0.23
948 0.28
949 0.29
950 0.26
951 0.29
952 0.29
953 0.26
954 0.24
955 0.22
956 0.16
957 0.17
958 0.15
959 0.11
960 0.09
961 0.09
962 0.1
963 0.1
964 0.1
965 0.1
966 0.12
967 0.17
968 0.19
969 0.2
970 0.21
971 0.24
972 0.33
973 0.37
974 0.44
975 0.42
976 0.42
977 0.45
978 0.44
979 0.44
980 0.4
981 0.39
982 0.37
983 0.37
984 0.44
985 0.45
986 0.47
987 0.45
988 0.39
989 0.35
990 0.28
991 0.25
992 0.17
993 0.15
994 0.18
995 0.24
996 0.34
997 0.41
998 0.48
999 0.5
1000 0.56
1001 0.61
1002 0.64
1003 0.68
1004 0.66
1005 0.63
1006 0.64
1007 0.71
1008 0.72
1009 0.71
1010 0.65
1011 0.58
1012 0.62
1013 0.57
1014 0.48
1015 0.39
1016 0.32
1017 0.31
1018 0.3
1019 0.3
1020 0.25
1021 0.28
1022 0.31
1023 0.39
1024 0.47
1025 0.5
1026 0.57
1027 0.64
1028 0.7
1029 0.78
1030 0.84
1031 0.82
1032 0.79
1033 0.76
1034 0.72
1035 0.68
1036 0.6