Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TG30

Protein Details
Accession A0A5N6TG30    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-40MAPDKKDKKRKAAVATAAVDSPAKKTKKVESKPVAAKKDSHydrophilic
182-208VPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQETEEBasic
297-322KGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTRBasic
391-418EVAKKADDTPKKSKKEKQKGARSTEQVTHydrophilic
432-452ASPATKAGSKAKKAKKTKTKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-50KKDKKRKAAVATAAVDSPAKKTKKVESKPVAAKKDSLKSTSKSNKD
54-71AKLKVNGEPARQVKPRKR
99-120NKKTKKADGTAGPAPKGKNAKA
187-200DSKKAKRKILKKQK
298-342GANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWTERIEREQKKRLAKAEK
400-413PKKSKKEKQKGARS
434-452PATKAGSKAKKAKKTKTKA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAVATAAVDSPAKKTKKVESKPVAAKKDSLKSTSKSNKDESTAKLKVNGEPARQVKPRKRAADFLSDNDDSEADVPEKKFEVENKSSNKKTKKADGTAGPAPKGKNAKAQGQTKQKKTEESDEEMEAVASSASESEDEEDDDRTTALIKGFESSGDEDESGDEGFDPDQPVPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQETEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGDITRLRLSRNKFTGRSKHYAFIEFASTSVAKIVAGTMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHPEIWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWTERIEREQKKRLAKAEKLKDLGYDIELPTLKSVDDVPVQQEEPKAIEASEVAAEEPSKAIEAPEEEVAKKADDTPKKSKKEKQKGARSTEQVTAKEQPKKEASEVTASPATKAGSKAKKAKKTKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.74
3 0.66
4 0.56
5 0.47
6 0.39
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.28
12 0.33
13 0.43
14 0.52
15 0.6
16 0.66
17 0.67
18 0.75
19 0.81
20 0.85
21 0.82
22 0.73
23 0.71
24 0.68
25 0.68
26 0.62
27 0.57
28 0.54
29 0.49
30 0.58
31 0.62
32 0.62
33 0.59
34 0.61
35 0.6
36 0.6
37 0.63
38 0.58
39 0.58
40 0.54
41 0.49
42 0.5
43 0.47
44 0.45
45 0.5
46 0.5
47 0.43
48 0.47
49 0.5
50 0.52
51 0.56
52 0.62
53 0.61
54 0.65
55 0.71
56 0.71
57 0.72
58 0.71
59 0.7
60 0.71
61 0.66
62 0.6
63 0.57
64 0.49
65 0.45
66 0.37
67 0.32
68 0.21
69 0.19
70 0.16
71 0.1
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.22
79 0.3
80 0.33
81 0.4
82 0.47
83 0.55
84 0.6
85 0.66
86 0.69
87 0.68
88 0.68
89 0.7
90 0.71
91 0.69
92 0.7
93 0.67
94 0.66
95 0.65
96 0.62
97 0.53
98 0.47
99 0.41
100 0.39
101 0.38
102 0.34
103 0.35
104 0.36
105 0.43
106 0.48
107 0.55
108 0.58
109 0.64
110 0.7
111 0.69
112 0.74
113 0.67
114 0.66
115 0.64
116 0.64
117 0.59
118 0.56
119 0.52
120 0.44
121 0.42
122 0.35
123 0.3
124 0.2
125 0.14
126 0.08
127 0.05
128 0.04
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.08
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.15
170 0.17
171 0.25
172 0.25
173 0.34
174 0.4
175 0.49
176 0.57
177 0.64
178 0.7
179 0.7
180 0.78
181 0.8
182 0.82
183 0.83
184 0.84
185 0.86
186 0.87
187 0.9
188 0.87
189 0.82
190 0.78
191 0.73
192 0.66
193 0.62
194 0.53
195 0.42
196 0.35
197 0.29
198 0.22
199 0.16
200 0.14
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.17
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.2
217 0.13
218 0.15
219 0.13
220 0.13
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.15
227 0.2
228 0.24
229 0.28
230 0.34
231 0.39
232 0.41
233 0.47
234 0.55
235 0.57
236 0.6
237 0.54
238 0.53
239 0.48
240 0.46
241 0.4
242 0.32
243 0.27
244 0.2
245 0.18
246 0.15
247 0.13
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.07
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.18
271 0.22
272 0.25
273 0.31
274 0.3
275 0.39
276 0.42
277 0.46
278 0.44
279 0.41
280 0.36
281 0.33
282 0.31
283 0.26
284 0.27
285 0.3
286 0.37
287 0.4
288 0.48
289 0.49
290 0.54
291 0.61
292 0.67
293 0.7
294 0.71
295 0.79
296 0.8
297 0.84
298 0.89
299 0.87
300 0.86
301 0.85
302 0.84
303 0.8
304 0.8
305 0.78
306 0.79
307 0.77
308 0.74
309 0.73
310 0.68
311 0.69
312 0.65
313 0.66
314 0.57
315 0.59
316 0.62
317 0.62
318 0.67
319 0.67
320 0.69
321 0.68
322 0.72
323 0.71
324 0.72
325 0.72
326 0.74
327 0.74
328 0.75
329 0.69
330 0.63
331 0.55
332 0.48
333 0.4
334 0.32
335 0.25
336 0.18
337 0.19
338 0.19
339 0.19
340 0.17
341 0.16
342 0.14
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.18
350 0.19
351 0.2
352 0.2
353 0.18
354 0.18
355 0.18
356 0.16
357 0.13
358 0.13
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.1
374 0.12
375 0.16
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.2
380 0.19
381 0.18
382 0.21
383 0.27
384 0.33
385 0.4
386 0.5
387 0.59
388 0.67
389 0.75
390 0.78
391 0.81
392 0.84
393 0.87
394 0.87
395 0.88
396 0.89
397 0.9
398 0.9
399 0.84
400 0.77
401 0.74
402 0.69
403 0.6
404 0.55
405 0.55
406 0.53
407 0.56
408 0.54
409 0.54
410 0.53
411 0.56
412 0.55
413 0.54
414 0.49
415 0.48
416 0.47
417 0.45
418 0.45
419 0.4
420 0.37
421 0.32
422 0.3
423 0.25
424 0.29
425 0.32
426 0.36
427 0.45
428 0.55
429 0.63
430 0.72
431 0.79
432 0.86