Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MGZ6

Protein Details
Accession C5MGZ6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-375DGRKLDDGRKRVQRDQRDQRDQRDQRRRIBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
KEGG ctp:CTRG_05350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MTTTNVNDNNLAFFKSLTPYVIRDKPVGSYMGNSEVITMAINPTGNRIVYSRTDKTIRIWKSTPDSAVDPKIIIDPHNKAVESISFNPKTEFSFATVGKDEYVKIWNSQNGDKIREIKCDFDTLKLVRYSNDGKLLIVVDRTSNIMILNVEMNYKLVHTFKVNEHVYDLKWFHHEHQFFLIAMHDGSVLLYEVAEETREDEEERIIYSTKLRSKIKGHNSSITSIAISPRGTYFCLGSSEGVVSVWNVEGTLINSHVITDVDQSISHLSCSKDGAYLTVAYDSDSNSRVYDYESGQLMYEIPNTSSGSQTFSSANWYPNKTGFICTSDHGTTVTIMKKLDDGRKLEDGRKLDDGRKRVQRDQRDQRDQRDQRRRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.2
4 0.18
5 0.19
6 0.22
7 0.3
8 0.35
9 0.36
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.35
14 0.34
15 0.26
16 0.24
17 0.23
18 0.26
19 0.25
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.14
25 0.12
26 0.08
27 0.08
28 0.1
29 0.09
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.18
36 0.24
37 0.32
38 0.32
39 0.35
40 0.38
41 0.39
42 0.44
43 0.49
44 0.47
45 0.46
46 0.45
47 0.46
48 0.5
49 0.53
50 0.49
51 0.43
52 0.43
53 0.4
54 0.41
55 0.35
56 0.28
57 0.24
58 0.25
59 0.22
60 0.21
61 0.22
62 0.23
63 0.27
64 0.3
65 0.29
66 0.27
67 0.28
68 0.29
69 0.29
70 0.3
71 0.34
72 0.33
73 0.33
74 0.34
75 0.34
76 0.32
77 0.29
78 0.25
79 0.19
80 0.23
81 0.22
82 0.25
83 0.25
84 0.23
85 0.21
86 0.21
87 0.17
88 0.14
89 0.17
90 0.15
91 0.16
92 0.19
93 0.21
94 0.24
95 0.26
96 0.32
97 0.32
98 0.34
99 0.34
100 0.38
101 0.37
102 0.42
103 0.4
104 0.37
105 0.35
106 0.37
107 0.35
108 0.3
109 0.33
110 0.26
111 0.3
112 0.28
113 0.27
114 0.22
115 0.26
116 0.27
117 0.24
118 0.29
119 0.24
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.18
124 0.15
125 0.13
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.22
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.22
154 0.23
155 0.23
156 0.15
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.25
161 0.25
162 0.22
163 0.24
164 0.24
165 0.21
166 0.2
167 0.18
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.14
196 0.19
197 0.25
198 0.26
199 0.3
200 0.36
201 0.45
202 0.53
203 0.58
204 0.57
205 0.56
206 0.56
207 0.53
208 0.48
209 0.39
210 0.29
211 0.2
212 0.18
213 0.13
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.13
277 0.15
278 0.15
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.17
283 0.17
284 0.15
285 0.13
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.16
293 0.15
294 0.17
295 0.16
296 0.18
297 0.16
298 0.15
299 0.21
300 0.22
301 0.27
302 0.29
303 0.32
304 0.33
305 0.35
306 0.39
307 0.34
308 0.35
309 0.32
310 0.28
311 0.27
312 0.26
313 0.29
314 0.25
315 0.24
316 0.21
317 0.19
318 0.18
319 0.21
320 0.23
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.23
325 0.29
326 0.35
327 0.37
328 0.38
329 0.41
330 0.5
331 0.54
332 0.54
333 0.54
334 0.5
335 0.48
336 0.52
337 0.51
338 0.5
339 0.53
340 0.54
341 0.57
342 0.63
343 0.66
344 0.67
345 0.73
346 0.77
347 0.8
348 0.85
349 0.87
350 0.88
351 0.89
352 0.89
353 0.9
354 0.89
355 0.89