Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TGV0

Protein Details
Accession A0A5N6TGV0    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-67KQVARDLASKEKKSRKKKEPTPSSSSESHydrophilic
83-103EEEKPAKKEVKKAAKKQESSSHydrophilic
124-149EDEKPAKKQKEEPKKASKKAAKKESSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-58SQSPKSKSKQVARDLASKEKKSRKKKE
88-97AKKEVKKAAK
127-146KPAKKQKEEPKKASKKAAKK
476-517GGRGGGGGFGGRGRGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGAPNKARGG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVTKKGAEKAVDKTLGKVKDAGVTKASQSPKSKSKQVARDLASKEKKSRKKKEPTPSSSSESDSDEEMDSSSSSSESEEEKPAKKEVKKAAKKQESSSESSSESDSDEEMGDASSSESEDEKPAKKQKEEPKKASKKAAKKESSSESESSDSSESESESEKEKPKKETKAAKPAESSSSSESESSDEEEAPKKAAKESSESSDSDSDSESEDEAPAKAEKKAEKSSESSDSDSSDSSDSESEDSEESAKDSKKRKAEDDESAAPKKTKTEEPAPGASANLFVGNLSWNVDEAWLQSEFEEFGEVSVRIMTERDTGRSRGFGYVEYTNATDAAKAMEAKKGAEIDGRTINLDYATGRPANRDQSGGFQDRAQARARSFGDQASPESDTLFVGNIPFSANENSLSEVFGSAGSIMGIRLPTDPESGRPKGFGYVQFSSVDEARQAFNDLNGAEIDGRAVRLDFSTPRANNGGGGRGGGGGFGGRGRGGPRGGGRGGRGGFGGRGGGAPNKARGGIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.66
3 0.64
4 0.55
5 0.52
6 0.51
7 0.48
8 0.45
9 0.42
10 0.35
11 0.35
12 0.38
13 0.36
14 0.31
15 0.3
16 0.31
17 0.36
18 0.39
19 0.39
20 0.42
21 0.47
22 0.53
23 0.58
24 0.64
25 0.66
26 0.71
27 0.74
28 0.76
29 0.78
30 0.74
31 0.75
32 0.72
33 0.73
34 0.73
35 0.69
36 0.69
37 0.7
38 0.75
39 0.78
40 0.84
41 0.84
42 0.86
43 0.9
44 0.92
45 0.92
46 0.91
47 0.88
48 0.83
49 0.79
50 0.7
51 0.63
52 0.54
53 0.46
54 0.39
55 0.31
56 0.27
57 0.21
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.12
69 0.14
70 0.21
71 0.25
72 0.3
73 0.32
74 0.38
75 0.44
76 0.45
77 0.51
78 0.55
79 0.61
80 0.67
81 0.74
82 0.8
83 0.81
84 0.81
85 0.78
86 0.78
87 0.72
88 0.68
89 0.62
90 0.53
91 0.45
92 0.42
93 0.37
94 0.27
95 0.23
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.12
112 0.16
113 0.18
114 0.26
115 0.34
116 0.4
117 0.43
118 0.51
119 0.58
120 0.65
121 0.73
122 0.75
123 0.78
124 0.82
125 0.84
126 0.86
127 0.84
128 0.83
129 0.83
130 0.84
131 0.79
132 0.73
133 0.73
134 0.7
135 0.67
136 0.62
137 0.53
138 0.44
139 0.39
140 0.35
141 0.3
142 0.24
143 0.18
144 0.14
145 0.13
146 0.11
147 0.1
148 0.12
149 0.11
150 0.13
151 0.18
152 0.25
153 0.31
154 0.35
155 0.43
156 0.49
157 0.57
158 0.63
159 0.69
160 0.71
161 0.75
162 0.75
163 0.71
164 0.66
165 0.59
166 0.55
167 0.47
168 0.4
169 0.32
170 0.29
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.17
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.11
179 0.12
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.14
185 0.16
186 0.19
187 0.18
188 0.21
189 0.23
190 0.27
191 0.28
192 0.28
193 0.28
194 0.26
195 0.25
196 0.2
197 0.18
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.14
211 0.17
212 0.22
213 0.28
214 0.29
215 0.31
216 0.33
217 0.35
218 0.38
219 0.37
220 0.33
221 0.28
222 0.26
223 0.24
224 0.21
225 0.18
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.1
240 0.12
241 0.17
242 0.23
243 0.28
244 0.34
245 0.37
246 0.41
247 0.46
248 0.49
249 0.49
250 0.49
251 0.49
252 0.47
253 0.46
254 0.42
255 0.34
256 0.29
257 0.26
258 0.23
259 0.21
260 0.22
261 0.27
262 0.33
263 0.36
264 0.38
265 0.37
266 0.33
267 0.29
268 0.24
269 0.18
270 0.12
271 0.08
272 0.06
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.1
303 0.11
304 0.14
305 0.16
306 0.19
307 0.19
308 0.21
309 0.21
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.15
334 0.14
335 0.15
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.12
342 0.12
343 0.09
344 0.08
345 0.1
346 0.12
347 0.12
348 0.15
349 0.18
350 0.23
351 0.23
352 0.24
353 0.22
354 0.26
355 0.32
356 0.32
357 0.29
358 0.24
359 0.29
360 0.29
361 0.31
362 0.29
363 0.26
364 0.24
365 0.3
366 0.32
367 0.29
368 0.28
369 0.27
370 0.27
371 0.25
372 0.26
373 0.21
374 0.21
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.15
393 0.14
394 0.14
395 0.12
396 0.1
397 0.1
398 0.08
399 0.08
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.09
410 0.1
411 0.14
412 0.15
413 0.19
414 0.27
415 0.3
416 0.3
417 0.29
418 0.28
419 0.29
420 0.32
421 0.32
422 0.32
423 0.31
424 0.32
425 0.32
426 0.31
427 0.3
428 0.26
429 0.22
430 0.16
431 0.15
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.13
436 0.13
437 0.15
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.12
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.12
452 0.13
453 0.18
454 0.27
455 0.27
456 0.3
457 0.32
458 0.32
459 0.33
460 0.33
461 0.32
462 0.23
463 0.23
464 0.2
465 0.18
466 0.17
467 0.13
468 0.11
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.06
474 0.08
475 0.09
476 0.14
477 0.14
478 0.19
479 0.22
480 0.27
481 0.3
482 0.32
483 0.32
484 0.35
485 0.35
486 0.31
487 0.29
488 0.24
489 0.22
490 0.2
491 0.18
492 0.11
493 0.11
494 0.13
495 0.16
496 0.19
497 0.22
498 0.25
499 0.26
500 0.27
501 0.26
502 0.28
503 0.31
504 0.35
505 0.35
506 0.4
507 0.41
508 0.43