Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDF4

Protein Details
Accession C5MDF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-316VIINPQKHTTPKRRVIKLHKKAAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-314PKRRVIKLHKKAA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
KEGG ctp:CTRG_04255  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MSFKVNWNTLETDALTSWTKDLLTSALNSGKSPNILASEITIKDLNFGKIAPDFEILEIGELDKDRFRGIFKINYQGDFHLTLHTKVQCNPLNNYFQNSLENEIDNQERHQFITPNFLLSKERFSVPLDLQLSDIKLNGIASVVFSKSRGATVVFKNDPLEGIKVNSTFDNFEMLSSFLQKQIEKNLSELFRETMPSVINKLSIKLLDIESVSSAAAAAKAGRTSLEKSSSSSLSSDTTENNTPSSPMGNNSLEEEISKRNLVQIASLYRSRETMGLSIPKMDVTTGTSRKVIINPQKHTTPKRRVIKLHKKAAKEVEPEPEVKPTVDVKKEKEEVVHAVSEKVNIQNHEFLFSQIGLGALKTMNKFNEKMLTPSPATPPPYSYSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.19
4 0.18
5 0.16
6 0.15
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.18
13 0.21
14 0.22
15 0.22
16 0.23
17 0.23
18 0.22
19 0.22
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.18
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.18
30 0.21
31 0.24
32 0.22
33 0.18
34 0.17
35 0.18
36 0.19
37 0.21
38 0.19
39 0.18
40 0.17
41 0.16
42 0.18
43 0.15
44 0.13
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.18
56 0.23
57 0.3
58 0.31
59 0.4
60 0.42
61 0.43
62 0.43
63 0.39
64 0.37
65 0.31
66 0.28
67 0.25
68 0.24
69 0.23
70 0.27
71 0.3
72 0.29
73 0.3
74 0.38
75 0.37
76 0.39
77 0.44
78 0.44
79 0.47
80 0.46
81 0.47
82 0.41
83 0.37
84 0.36
85 0.32
86 0.3
87 0.23
88 0.23
89 0.19
90 0.2
91 0.21
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.18
97 0.2
98 0.21
99 0.19
100 0.28
101 0.27
102 0.27
103 0.26
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.28
108 0.21
109 0.21
110 0.19
111 0.21
112 0.25
113 0.22
114 0.28
115 0.24
116 0.23
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.17
121 0.16
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.14
139 0.18
140 0.25
141 0.25
142 0.25
143 0.26
144 0.25
145 0.23
146 0.19
147 0.18
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.18
170 0.23
171 0.21
172 0.22
173 0.24
174 0.23
175 0.23
176 0.23
177 0.17
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.07
211 0.1
212 0.13
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.22
217 0.22
218 0.21
219 0.19
220 0.17
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.12
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.16
252 0.18
253 0.21
254 0.23
255 0.22
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.18
260 0.16
261 0.14
262 0.16
263 0.2
264 0.19
265 0.2
266 0.19
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.12
271 0.11
272 0.19
273 0.2
274 0.22
275 0.23
276 0.24
277 0.26
278 0.28
279 0.34
280 0.36
281 0.42
282 0.45
283 0.49
284 0.55
285 0.6
286 0.67
287 0.68
288 0.68
289 0.69
290 0.74
291 0.77
292 0.8
293 0.84
294 0.87
295 0.86
296 0.87
297 0.83
298 0.77
299 0.77
300 0.76
301 0.72
302 0.66
303 0.59
304 0.56
305 0.52
306 0.51
307 0.45
308 0.4
309 0.33
310 0.28
311 0.28
312 0.26
313 0.31
314 0.37
315 0.41
316 0.42
317 0.5
318 0.52
319 0.51
320 0.47
321 0.44
322 0.4
323 0.38
324 0.38
325 0.29
326 0.29
327 0.28
328 0.27
329 0.25
330 0.25
331 0.26
332 0.24
333 0.27
334 0.31
335 0.31
336 0.33
337 0.31
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.2
342 0.13
343 0.14
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.12
349 0.14
350 0.18
351 0.23
352 0.27
353 0.29
354 0.31
355 0.38
356 0.37
357 0.4
358 0.4
359 0.42
360 0.4
361 0.42
362 0.44
363 0.42
364 0.45
365 0.41
366 0.41