Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TTF6

Protein Details
Accession A0A5N6TTF6    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-143PGAKSDTGDKKKRKRAPPDPNAPKRALBasic
254-280SPEPVKEPTPPRTKRRRSETNKAAKEAHydrophilic
282-335SPAENKRASPEKKKTTRTPAKKAQEETPASTRKTTAQDKTRGKKKRKSEVAADEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-140DKKKRKRAPPDPNAPK
263-328PPRTKRRRSETNKAAKEAASPAENKRASPEKKKTTRTPAKKAQEETPASTRKTTAQDKTRGKKKRK
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARRASKRSGAQSLGPTHQLLLAIARVTNSANAAASVVGATRASLPTEAQLTYAQVIVSLAQLQSAVSELSKAYINHANTVLNRGETVEIGSIANITNALYESGLLGTIGGARATSPGAKSDTGDKKKRKRAPPDPNAPKRALTPFFLFMQHNRSKIAEELGSSAKPKDVSDEGTRRWADMPEEEKEYWKKTYADNLAIYKEKMKAYKAGLPYSDDVQAANQLQQEADRAEATAAEESEEEEEEEQEQEQEESSPEPVKEPTPPRTKRRRSETNKAAKEAASPAENKRASPEKKKTTRTPAKKAQEETPASTRKTTAQDKTRGKKKRKSEVAADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.49
3 0.41
4 0.34
5 0.32
6 0.27
7 0.2
8 0.16
9 0.14
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.11
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.1
59 0.1
60 0.14
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.22
67 0.27
68 0.24
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.15
73 0.12
74 0.13
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.08
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.2
109 0.3
110 0.37
111 0.46
112 0.53
113 0.61
114 0.7
115 0.79
116 0.79
117 0.8
118 0.83
119 0.85
120 0.87
121 0.88
122 0.89
123 0.88
124 0.84
125 0.74
126 0.64
127 0.56
128 0.51
129 0.42
130 0.34
131 0.28
132 0.26
133 0.25
134 0.27
135 0.24
136 0.2
137 0.26
138 0.26
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.21
143 0.21
144 0.22
145 0.14
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.15
158 0.21
159 0.25
160 0.24
161 0.3
162 0.3
163 0.28
164 0.28
165 0.25
166 0.19
167 0.2
168 0.22
169 0.18
170 0.22
171 0.21
172 0.24
173 0.25
174 0.26
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.2
179 0.28
180 0.29
181 0.31
182 0.31
183 0.31
184 0.31
185 0.3
186 0.29
187 0.24
188 0.23
189 0.21
190 0.2
191 0.2
192 0.22
193 0.24
194 0.3
195 0.31
196 0.3
197 0.29
198 0.3
199 0.29
200 0.27
201 0.25
202 0.19
203 0.15
204 0.13
205 0.15
206 0.12
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.09
214 0.1
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.16
246 0.23
247 0.28
248 0.36
249 0.43
250 0.51
251 0.6
252 0.7
253 0.78
254 0.8
255 0.84
256 0.86
257 0.85
258 0.88
259 0.89
260 0.89
261 0.85
262 0.79
263 0.71
264 0.6
265 0.54
266 0.46
267 0.38
268 0.31
269 0.27
270 0.27
271 0.35
272 0.35
273 0.32
274 0.35
275 0.42
276 0.46
277 0.54
278 0.61
279 0.62
280 0.71
281 0.8
282 0.83
283 0.84
284 0.88
285 0.88
286 0.88
287 0.87
288 0.88
289 0.87
290 0.82
291 0.78
292 0.77
293 0.71
294 0.67
295 0.65
296 0.61
297 0.55
298 0.52
299 0.47
300 0.43
301 0.46
302 0.49
303 0.5
304 0.53
305 0.61
306 0.7
307 0.78
308 0.82
309 0.84
310 0.86
311 0.85
312 0.87
313 0.88
314 0.88
315 0.86