Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TJ89

Protein Details
Accession A0A5N6TJ89    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-412LSITRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-403GKGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 12, mito 4.5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAGHKEKKASPAKMTQDKKASVPPQLVASIESFLTEFGFSKTSQAFVKEQASKSISKSDIKDAPSLLQIFQNWTSQADNAKSSEESASSGSSESSSSSEDSDSSSDESSDSDVEMNDAPKAQPKKQSKSSSPSSSSSSSSSSSSSSSSGSESDADDESEEEAAPAKPQGTKRKAESDSSSSESESESDKAPQNKKTKVSAKEDSSSSDSSSSDSDSSSGSESESNDDNDASSDSSSDSDSSDSEEDTKKDDKKALKAAKKTPLPPSDSSSSDSSSSDSSSDSDSDSSDDSSKSEKSAKKSPSAESSSSSGTLENSDSNAQKSASSAPETGSSSASPAPDNGPAQKRHTGARPTPLALLSEQPYDHHPSNTYVPYAYAEKAWKDLSITRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.72
4 0.68
5 0.64
6 0.65
7 0.6
8 0.56
9 0.55
10 0.48
11 0.43
12 0.41
13 0.38
14 0.3
15 0.26
16 0.2
17 0.16
18 0.15
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.09
24 0.09
25 0.11
26 0.11
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.19
31 0.22
32 0.22
33 0.25
34 0.34
35 0.36
36 0.37
37 0.41
38 0.43
39 0.41
40 0.41
41 0.44
42 0.4
43 0.39
44 0.41
45 0.42
46 0.44
47 0.45
48 0.45
49 0.39
50 0.37
51 0.36
52 0.34
53 0.27
54 0.24
55 0.22
56 0.24
57 0.24
58 0.25
59 0.2
60 0.2
61 0.21
62 0.2
63 0.24
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.16
107 0.21
108 0.24
109 0.32
110 0.41
111 0.49
112 0.58
113 0.67
114 0.67
115 0.7
116 0.74
117 0.73
118 0.68
119 0.62
120 0.57
121 0.5
122 0.44
123 0.39
124 0.32
125 0.26
126 0.22
127 0.21
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.11
154 0.17
155 0.27
156 0.32
157 0.36
158 0.4
159 0.48
160 0.5
161 0.5
162 0.49
163 0.44
164 0.42
165 0.41
166 0.38
167 0.28
168 0.26
169 0.22
170 0.18
171 0.15
172 0.12
173 0.1
174 0.12
175 0.16
176 0.23
177 0.27
178 0.34
179 0.39
180 0.44
181 0.47
182 0.52
183 0.56
184 0.56
185 0.59
186 0.58
187 0.55
188 0.53
189 0.5
190 0.44
191 0.4
192 0.33
193 0.26
194 0.21
195 0.17
196 0.14
197 0.14
198 0.12
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.15
234 0.2
235 0.21
236 0.23
237 0.28
238 0.3
239 0.35
240 0.44
241 0.5
242 0.52
243 0.56
244 0.61
245 0.64
246 0.65
247 0.64
248 0.63
249 0.59
250 0.57
251 0.52
252 0.51
253 0.45
254 0.42
255 0.4
256 0.34
257 0.3
258 0.25
259 0.23
260 0.19
261 0.16
262 0.15
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.22
281 0.25
282 0.29
283 0.38
284 0.41
285 0.47
286 0.5
287 0.52
288 0.53
289 0.54
290 0.5
291 0.44
292 0.42
293 0.36
294 0.33
295 0.29
296 0.21
297 0.15
298 0.15
299 0.13
300 0.11
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.18
310 0.18
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.21
315 0.23
316 0.23
317 0.2
318 0.17
319 0.16
320 0.17
321 0.17
322 0.14
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.19
327 0.24
328 0.29
329 0.32
330 0.37
331 0.42
332 0.42
333 0.43
334 0.49
335 0.51
336 0.5
337 0.54
338 0.53
339 0.49
340 0.5
341 0.46
342 0.39
343 0.31
344 0.3
345 0.24
346 0.22
347 0.2
348 0.19
349 0.22
350 0.27
351 0.28
352 0.26
353 0.26
354 0.27
355 0.33
356 0.35
357 0.32
358 0.26
359 0.25
360 0.26
361 0.26
362 0.23
363 0.21
364 0.22
365 0.22
366 0.25
367 0.25
368 0.23
369 0.23
370 0.27
371 0.31
372 0.36
373 0.38
374 0.37
375 0.42
376 0.42
377 0.47
378 0.5
379 0.53
380 0.55
381 0.63
382 0.71
383 0.76
384 0.85
385 0.87
386 0.9
387 0.91
388 0.9
389 0.9
390 0.89
391 0.88
392 0.88
393 0.83
394 0.72
395 0.62
396 0.57
397 0.48
398 0.43
399 0.34
400 0.26
401 0.23