Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MFA6

Protein Details
Accession C5MFA6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-234MEQFIKEKKDKHTKHRSHRSHRHRSHRHRSKERERSRSPKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-234KEKKDKHTKHRSHRSHRHRSHRHRSKERERSRSPKR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ctp:CTRG_04749  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MNTVKQINQINQKELNSNTSYKSSWHYDYRDTNYIYIGNIPFNLNEKDIIIIFSQYGIPTHINLIKDKETGKHRGFGFLKYANFKSCILAIDNFNGIKLGDRILRVDHNYYKLRGDEKEDDYLINYDEVRKEIEAKQDKEDIKLIEDKKETIKEPIKEENTSDVDEFKDPMADFLNSEKKDNDDDDDDEFKDPMEQFIKEKKDKHTKHRSHRSHRHRSHRHRSKERERSRSPKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.4
4 0.38
5 0.35
6 0.33
7 0.32
8 0.29
9 0.32
10 0.32
11 0.33
12 0.38
13 0.39
14 0.43
15 0.5
16 0.55
17 0.57
18 0.53
19 0.48
20 0.42
21 0.39
22 0.32
23 0.28
24 0.22
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.18
30 0.2
31 0.16
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.18
51 0.21
52 0.21
53 0.23
54 0.23
55 0.26
56 0.28
57 0.35
58 0.35
59 0.38
60 0.36
61 0.43
62 0.43
63 0.39
64 0.39
65 0.35
66 0.36
67 0.34
68 0.35
69 0.28
70 0.29
71 0.27
72 0.23
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.14
92 0.14
93 0.18
94 0.19
95 0.22
96 0.24
97 0.24
98 0.24
99 0.23
100 0.24
101 0.21
102 0.24
103 0.24
104 0.25
105 0.26
106 0.25
107 0.23
108 0.21
109 0.21
110 0.16
111 0.11
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.11
119 0.13
120 0.22
121 0.29
122 0.3
123 0.32
124 0.38
125 0.38
126 0.37
127 0.37
128 0.29
129 0.23
130 0.28
131 0.27
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.26
136 0.29
137 0.28
138 0.29
139 0.35
140 0.33
141 0.37
142 0.44
143 0.43
144 0.41
145 0.41
146 0.39
147 0.34
148 0.33
149 0.28
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.12
155 0.13
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.17
162 0.25
163 0.23
164 0.25
165 0.25
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.27
170 0.22
171 0.23
172 0.26
173 0.28
174 0.27
175 0.25
176 0.23
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.2
184 0.28
185 0.37
186 0.39
187 0.45
188 0.51
189 0.59
190 0.66
191 0.73
192 0.76
193 0.78
194 0.84
195 0.9
196 0.91
197 0.91
198 0.94
199 0.94
200 0.94
201 0.94
202 0.94
203 0.94
204 0.94
205 0.95
206 0.94
207 0.94
208 0.94
209 0.95
210 0.95
211 0.95
212 0.94
213 0.93
214 0.93