Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6U8M0

Protein Details
Accession A0A5N6U8M0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-38GVPRVASKTRYPNQRRDSSPHydrophilic
696-719TEETSEKLNKRNHRKSLINNPVETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024420  TRAPP_III_complex_Trs85  
Pfam View protein in Pfam  
PF12739  TRAPPC-Trs85  
Amino Acid Sequences MTSPGDAAPVRPPPSFSPGVPRVASKTRYPNQRRDSSPALDSDLVESRIASSPPQPPLSATAAELPIRSASPYARSVRSSTPQLTRSSLGSPTDGRFDGPDDIRSLIIRSFSPVVGVYASVDTDELVRQKGFQGGFWELIRPFGENVPGKIVVRDSVGASRGWEDFGVRFVDLGGHPETSESQNSLSQLEAALEKQLESPDNPLGGVLRPKDFLSFPTTSPLYKSFLRQLLSVETPTPHETFRHPVASVIVISSRNTSPLETLRRLYADTSSGDRRQPEWVHPEYLRYYVLVHDEDRDDITESTKLYDQMKRHFGLHCHLLRLRSNQCVVTDDDSCQIPESEWLSPSERLSGRSEPLVDLDTDGLPYLFESDVTAIKAFVRELVAQSVIPYMENRVTVWNDQVASRRRGISGRFMSMSRRWAGFGSGSRSSLIGSGGGISGNFDLNHGYYKPDVPEAVLRKMADFAFMLRDWKLSASTYELLRSDYANDKAWKYHAGVHEMCAVSMLLNPLAMPGKTKIDDINQMVETACYSYMTRCSDAPNALRSLTLAMELLKSRGGSGIESAAKWAMRAMDLGLVGSIGQALFSERISACYASRNPIHGVKWGSRHRKAGMWSVLAADLWLRLGNPSLASAALEEAERLYADIMDSNGLFPMPDMQTFVDNLRHSVRMSYFEARGLDIGEDTAPADPLETLETEETSEKLNKRNHRKSLINNPVETGGFNIGQEDDNPANDDFERA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.43
3 0.38
4 0.4
5 0.41
6 0.47
7 0.44
8 0.43
9 0.42
10 0.46
11 0.49
12 0.47
13 0.52
14 0.54
15 0.64
16 0.7
17 0.74
18 0.76
19 0.81
20 0.79
21 0.76
22 0.75
23 0.69
24 0.64
25 0.56
26 0.52
27 0.44
28 0.39
29 0.34
30 0.31
31 0.27
32 0.24
33 0.21
34 0.19
35 0.2
36 0.21
37 0.19
38 0.2
39 0.26
40 0.32
41 0.34
42 0.32
43 0.3
44 0.35
45 0.37
46 0.32
47 0.27
48 0.25
49 0.25
50 0.26
51 0.25
52 0.21
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.13
58 0.17
59 0.24
60 0.28
61 0.31
62 0.33
63 0.36
64 0.41
65 0.45
66 0.47
67 0.47
68 0.49
69 0.5
70 0.5
71 0.5
72 0.45
73 0.41
74 0.37
75 0.35
76 0.29
77 0.28
78 0.28
79 0.26
80 0.28
81 0.26
82 0.24
83 0.21
84 0.22
85 0.25
86 0.24
87 0.24
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.16
97 0.17
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.14
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.21
121 0.22
122 0.24
123 0.24
124 0.26
125 0.21
126 0.23
127 0.22
128 0.18
129 0.17
130 0.15
131 0.23
132 0.21
133 0.22
134 0.24
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.24
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.13
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.11
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.13
169 0.13
170 0.15
171 0.16
172 0.16
173 0.14
174 0.12
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.08
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.17
194 0.16
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.24
205 0.25
206 0.23
207 0.25
208 0.25
209 0.22
210 0.22
211 0.24
212 0.25
213 0.29
214 0.3
215 0.28
216 0.28
217 0.28
218 0.29
219 0.26
220 0.21
221 0.17
222 0.19
223 0.21
224 0.2
225 0.16
226 0.16
227 0.18
228 0.22
229 0.25
230 0.25
231 0.23
232 0.22
233 0.23
234 0.22
235 0.2
236 0.15
237 0.13
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.19
247 0.25
248 0.24
249 0.25
250 0.25
251 0.25
252 0.26
253 0.24
254 0.19
255 0.15
256 0.14
257 0.17
258 0.2
259 0.22
260 0.23
261 0.24
262 0.24
263 0.28
264 0.29
265 0.3
266 0.32
267 0.33
268 0.35
269 0.33
270 0.35
271 0.3
272 0.3
273 0.25
274 0.18
275 0.16
276 0.13
277 0.15
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.2
295 0.22
296 0.27
297 0.32
298 0.32
299 0.32
300 0.33
301 0.32
302 0.31
303 0.35
304 0.3
305 0.29
306 0.29
307 0.3
308 0.3
309 0.35
310 0.34
311 0.3
312 0.3
313 0.27
314 0.26
315 0.26
316 0.25
317 0.21
318 0.19
319 0.16
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.12
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.18
335 0.16
336 0.18
337 0.21
338 0.21
339 0.2
340 0.2
341 0.2
342 0.15
343 0.16
344 0.14
345 0.1
346 0.09
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.19
390 0.21
391 0.22
392 0.24
393 0.24
394 0.24
395 0.26
396 0.26
397 0.29
398 0.27
399 0.27
400 0.27
401 0.26
402 0.29
403 0.29
404 0.31
405 0.23
406 0.21
407 0.19
408 0.18
409 0.19
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.19
414 0.19
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.15
419 0.12
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.17
443 0.19
444 0.21
445 0.22
446 0.21
447 0.2
448 0.22
449 0.21
450 0.16
451 0.12
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.11
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.12
461 0.09
462 0.1
463 0.12
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.16
473 0.18
474 0.21
475 0.23
476 0.23
477 0.24
478 0.25
479 0.25
480 0.22
481 0.25
482 0.24
483 0.28
484 0.27
485 0.27
486 0.31
487 0.29
488 0.27
489 0.22
490 0.18
491 0.12
492 0.13
493 0.12
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.14
503 0.14
504 0.16
505 0.17
506 0.19
507 0.25
508 0.25
509 0.27
510 0.24
511 0.23
512 0.23
513 0.2
514 0.17
515 0.12
516 0.1
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.13
521 0.16
522 0.17
523 0.17
524 0.21
525 0.23
526 0.28
527 0.3
528 0.28
529 0.27
530 0.26
531 0.25
532 0.22
533 0.19
534 0.15
535 0.12
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.1
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.1
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.15
553 0.15
554 0.14
555 0.14
556 0.1
557 0.09
558 0.1
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.05
572 0.06
573 0.06
574 0.09
575 0.09
576 0.12
577 0.14
578 0.15
579 0.14
580 0.21
581 0.23
582 0.25
583 0.28
584 0.28
585 0.3
586 0.34
587 0.35
588 0.33
589 0.36
590 0.36
591 0.43
592 0.5
593 0.56
594 0.57
595 0.61
596 0.58
597 0.58
598 0.58
599 0.58
600 0.54
601 0.46
602 0.41
603 0.36
604 0.34
605 0.28
606 0.24
607 0.15
608 0.09
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.09
619 0.09
620 0.09
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.07
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.07
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.08
639 0.08
640 0.07
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.14
645 0.15
646 0.16
647 0.18
648 0.2
649 0.21
650 0.2
651 0.23
652 0.24
653 0.25
654 0.24
655 0.27
656 0.27
657 0.26
658 0.31
659 0.33
660 0.31
661 0.33
662 0.33
663 0.29
664 0.28
665 0.23
666 0.19
667 0.14
668 0.13
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.08
674 0.07
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.09
680 0.11
681 0.11
682 0.12
683 0.13
684 0.14
685 0.14
686 0.16
687 0.22
688 0.24
689 0.31
690 0.39
691 0.47
692 0.58
693 0.68
694 0.73
695 0.76
696 0.81
697 0.83
698 0.87
699 0.87
700 0.83
701 0.74
702 0.66
703 0.6
704 0.52
705 0.42
706 0.33
707 0.26
708 0.19
709 0.18
710 0.17
711 0.15
712 0.15
713 0.15
714 0.19
715 0.16
716 0.17
717 0.2
718 0.19
719 0.2