FuNGI

A0A5N6TS99

Protein Details

Accession

A0A5N6TS99

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
323-343	GGTPIRKKKRKGAMTNPSAYS	Hydrophilic
435-459	NNTSAQAKRKGAKNKRGKNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-119	AKGKAKGK
328-333	RKKKRK
442-453	KRKGAKNKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 8, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQNDPLIHDAGADDRVLAAVSGPAAGPSDPGTRGKNLNDLVGEFGTQSVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHLRELGTGGGDSYFVEAKAKGKAKGKGMKLEDALRGVSLDDSRSEMGSVYGSEMRSTASSYVRQPTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDENDEDVFGKLTSQAEEMDQYDWEDTLFDEEDDDGWESDATEKAPVQPSTTDYKPQQKDTSEEDAEPGELPDHDAPAPDLHPQDQGWMREFAKFKKDAKSKPVAAPAAPPSIVPSEQRSTLASTVFTVGGTPIRKKKRKGAMTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRVEALYALDEEDEGEYDDSMSMVSGMTGMTDMTSFSTASSQAPNLVDANGREVAPRESFNTVMDDFLSGWDNNTSAQAKRKGAKNKRGKNGNEAIGIRMLDEVRQGLGPARMPGKVPGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.57
6	0.51
7	0.52
8	0.5
9	0.51
10	0.56
11	0.48
12	0.4
13	0.43
14	0.41
15	0.34
16	0.31
17	0.26
18	0.19
19	0.18
20	0.15
21	0.11
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.07
26	0.06
27	0.05
28	0.05
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.07
33	0.07
34	0.08
35	0.1
36	0.13
37	0.15
38	0.19
39	0.22
40	0.25
41	0.29
42	0.31
43	0.35
44	0.33
45	0.34
46	0.32
47	0.3
48	0.29
49	0.25
50	0.23
51	0.15
52	0.15
53	0.14
54	0.14
55	0.16
56	0.17
57	0.2
58	0.2
59	0.22
60	0.27
61	0.29
62	0.3
63	0.29
64	0.29
65	0.25
66	0.25
67	0.23
68	0.17
69	0.14
70	0.13
71	0.12
72	0.1
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.16
77	0.2
78	0.24
79	0.25
80	0.25
81	0.26
82	0.26
83	0.26
84	0.24
85	0.19
86	0.14
87	0.13
88	0.11
89	0.08
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.08
96	0.09
97	0.11
98	0.18
99	0.22
100	0.26
101	0.32
102	0.38
103	0.46
104	0.53
105	0.56
106	0.57
107	0.57
108	0.57
109	0.53
110	0.52
111	0.44
112	0.38
113	0.33
114	0.24
115	0.21
116	0.16
117	0.14
118	0.11
119	0.09
120	0.08
121	0.1
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.09
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.1
134	0.11
135	0.1
136	0.11
137	0.11
138	0.12
139	0.14
140	0.18
141	0.24
142	0.24
143	0.24
144	0.26
145	0.3
146	0.35
147	0.38
148	0.39
149	0.35
150	0.37
151	0.4
152	0.38
153	0.32
154	0.25
155	0.19
156	0.15
157	0.14
158	0.11
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.13
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.12
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.08
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.13
229	0.16
230	0.2
231	0.21
232	0.23
233	0.23
234	0.32
235	0.33
236	0.37
237	0.38
238	0.34
239	0.37
240	0.38
241	0.42
242	0.34
243	0.31
244	0.28
245	0.24
246	0.23
247	0.19
248	0.13
249	0.07
250	0.05
251	0.07
252	0.07
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.15
265	0.18
266	0.18
267	0.18
268	0.21
269	0.21
270	0.24
271	0.27
272	0.25
273	0.28
274	0.31
275	0.33
276	0.39
277	0.46
278	0.47
279	0.52
280	0.58
281	0.56
282	0.56
283	0.6
284	0.51
285	0.44
286	0.43
287	0.38
288	0.32
289	0.27
290	0.22
291	0.17
292	0.18
293	0.18
294	0.15
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.19
299	0.18
300	0.19
301	0.19
302	0.18
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.12
307	0.11
308	0.08
309	0.08
310	0.11
311	0.13
312	0.17
313	0.24
314	0.35
315	0.42
316	0.46
317	0.55
318	0.62
319	0.7
320	0.76
321	0.78
322	0.79
323	0.8
324	0.81
325	0.72
326	0.64
327	0.54
328	0.44
329	0.35
330	0.25
331	0.17
332	0.13
333	0.12
334	0.1
335	0.11
336	0.12
337	0.11
338	0.12
339	0.17
340	0.16
341	0.17
342	0.18
343	0.19
344	0.2
345	0.27
346	0.26
347	0.24
348	0.23
349	0.23
350	0.22
351	0.2
352	0.21
353	0.13
354	0.13
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.11
389	0.13
390	0.12
391	0.15
392	0.16
393	0.17
394	0.16
395	0.16
396	0.17
397	0.15
398	0.19
399	0.17
400	0.16
401	0.16
402	0.17
403	0.2
404	0.2
405	0.21
406	0.2
407	0.21
408	0.22
409	0.22
410	0.25
411	0.21
412	0.19
413	0.18
414	0.16
415	0.13
416	0.14
417	0.16
418	0.11
419	0.12
420	0.13
421	0.12
422	0.12
423	0.17
424	0.18
425	0.18
426	0.27
427	0.33
428	0.39
429	0.45
430	0.53
431	0.6
432	0.68
433	0.76
434	0.78
435	0.81
436	0.85
437	0.88
438	0.84
439	0.83
440	0.81
441	0.77
442	0.73
443	0.63
444	0.55
445	0.49
446	0.44
447	0.34
448	0.27
449	0.22
450	0.15
451	0.16
452	0.14
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.17
458	0.19
459	0.22
460	0.24
461	0.24
462	0.25
463	0.32

A0A5N6TS99

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer