Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M7F0

Protein Details
Accession C5M7F0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
901-923ILCNRVNRSSNKIRINRNKVVIAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR018835  RNA-binding_domain_put  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ctp:CTRG_01782  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10378  RRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MYQHHHQQQQQQQNSYYNMPRSIDLPPPLHIQQQGYPPNYYPQGPITPFDLSYGQSMIPSNLLVSSPYFTPPPSATPQYFNAVHQHSLPQQSPSPRISQLKLRGKQGGYKKNGPYLTSMNSSTSSVDQHHSNNQKPTSVSRTIVFKNINDSVSLHQFLDAIDHGPIEYCKMFTKKIPKSLIKNENDFDGATSFQVCYLSFNNSIIANHFFSKYAENMDPLKEKLLDSKFLKIQLNDGDSTQDYIKLKTLNYILESNATRATTISFSIVHKDTKEELKDEDEEEIKQFIYHQCEKFGSVEDFKFSWVENSNGDDNNDDEEHIPGRIYGRVTAHYCSIDSGIRCFEDYLRRIHNDSQRDGNTGNKKGKRGTKFANDINQKYDLKFSHVGFSKDRCDKTTIEQPQEAIDSDNINNPIQSIPEDEESIEGPLNSSTDLKTFITSPEIERTPNGLNIDDPISPNSSDIETSPAMKSPLNSNDINEHDDDSDNTADYSILSSNAQFPMQPPQPAAFVPIIPYVSGNPLMTHSNPSLVSTHSADPVNYGNRSIYLGNLHPKTTIEEIANNVRAGGLVESINYHPEKRVCFITFVDPNVAYKFYMNHQILHQLVIHGYEIIVGWAKQQSGPLHRDIMLAVTAGASRNVYIGIPSSGCGLVLPSEDELRKDFGNFGGMEQINFIHNRECGFMNFLHIGDAINVVSCFEFDKEECLNRLMKTSRLETETEIEEFYNKYKNFKIRFAKDRCGNSPKFSFKKKITEDHFGYSHYQRRSSTNSFRNRRESSGDTTLETENFNRETIAEEAAMVFGIVHKDKEIETETEHEHEQDETMSRSTELVDVPEEADEGEDEGEDEGATTIKNNDDDEEENEQQQQEEEDESDDDDDDVSIIIGSDETASTTFTRMLKRILCNRVNRSSNKIRINRNKVVIAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.59
4 0.53
5 0.5
6 0.45
7 0.41
8 0.38
9 0.38
10 0.38
11 0.38
12 0.35
13 0.33
14 0.38
15 0.39
16 0.41
17 0.4
18 0.37
19 0.35
20 0.43
21 0.48
22 0.45
23 0.45
24 0.43
25 0.45
26 0.45
27 0.41
28 0.35
29 0.32
30 0.36
31 0.36
32 0.36
33 0.33
34 0.32
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.2
39 0.2
40 0.2
41 0.16
42 0.15
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.18
58 0.19
59 0.23
60 0.28
61 0.33
62 0.34
63 0.37
64 0.4
65 0.42
66 0.42
67 0.39
68 0.39
69 0.36
70 0.35
71 0.32
72 0.34
73 0.32
74 0.37
75 0.37
76 0.34
77 0.36
78 0.41
79 0.45
80 0.43
81 0.42
82 0.43
83 0.47
84 0.46
85 0.5
86 0.54
87 0.6
88 0.62
89 0.63
90 0.64
91 0.6
92 0.65
93 0.66
94 0.65
95 0.62
96 0.66
97 0.64
98 0.64
99 0.65
100 0.58
101 0.53
102 0.48
103 0.45
104 0.41
105 0.37
106 0.32
107 0.3
108 0.3
109 0.26
110 0.23
111 0.2
112 0.19
113 0.2
114 0.21
115 0.23
116 0.32
117 0.38
118 0.43
119 0.49
120 0.48
121 0.49
122 0.47
123 0.5
124 0.48
125 0.45
126 0.41
127 0.36
128 0.41
129 0.39
130 0.44
131 0.41
132 0.35
133 0.37
134 0.38
135 0.36
136 0.3
137 0.3
138 0.27
139 0.29
140 0.29
141 0.23
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.19
146 0.15
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.15
157 0.18
158 0.21
159 0.26
160 0.37
161 0.41
162 0.5
163 0.58
164 0.61
165 0.67
166 0.75
167 0.79
168 0.74
169 0.73
170 0.65
171 0.58
172 0.51
173 0.42
174 0.33
175 0.24
176 0.18
177 0.13
178 0.13
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.19
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.19
199 0.18
200 0.19
201 0.18
202 0.2
203 0.21
204 0.24
205 0.26
206 0.24
207 0.25
208 0.21
209 0.21
210 0.26
211 0.27
212 0.31
213 0.3
214 0.35
215 0.35
216 0.4
217 0.43
218 0.35
219 0.37
220 0.34
221 0.35
222 0.3
223 0.27
224 0.25
225 0.21
226 0.23
227 0.19
228 0.18
229 0.16
230 0.16
231 0.19
232 0.18
233 0.18
234 0.21
235 0.22
236 0.2
237 0.22
238 0.22
239 0.2
240 0.22
241 0.23
242 0.2
243 0.2
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.16
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.2
258 0.22
259 0.27
260 0.28
261 0.25
262 0.25
263 0.27
264 0.28
265 0.26
266 0.25
267 0.2
268 0.18
269 0.18
270 0.17
271 0.13
272 0.11
273 0.13
274 0.14
275 0.2
276 0.26
277 0.25
278 0.28
279 0.29
280 0.3
281 0.29
282 0.29
283 0.25
284 0.22
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.16
291 0.16
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.17
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.17
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.12
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.07
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.12
314 0.13
315 0.17
316 0.19
317 0.19
318 0.2
319 0.18
320 0.18
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.18
332 0.2
333 0.23
334 0.26
335 0.27
336 0.29
337 0.36
338 0.39
339 0.37
340 0.38
341 0.41
342 0.38
343 0.38
344 0.36
345 0.37
346 0.37
347 0.39
348 0.44
349 0.41
350 0.43
351 0.47
352 0.55
353 0.53
354 0.53
355 0.53
356 0.54
357 0.57
358 0.58
359 0.61
360 0.59
361 0.55
362 0.51
363 0.49
364 0.4
365 0.34
366 0.34
367 0.26
368 0.25
369 0.27
370 0.25
371 0.27
372 0.29
373 0.31
374 0.29
375 0.32
376 0.34
377 0.36
378 0.37
379 0.32
380 0.32
381 0.31
382 0.34
383 0.4
384 0.39
385 0.37
386 0.37
387 0.35
388 0.32
389 0.32
390 0.27
391 0.18
392 0.12
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.08
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.14
429 0.15
430 0.15
431 0.15
432 0.17
433 0.16
434 0.17
435 0.17
436 0.13
437 0.12
438 0.13
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.1
451 0.09
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.17
460 0.2
461 0.2
462 0.19
463 0.22
464 0.24
465 0.25
466 0.2
467 0.17
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.12
472 0.1
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.07
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.15
489 0.17
490 0.18
491 0.17
492 0.17
493 0.18
494 0.18
495 0.19
496 0.12
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.1
501 0.09
502 0.1
503 0.08
504 0.08
505 0.1
506 0.08
507 0.07
508 0.09
509 0.11
510 0.11
511 0.13
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.14
519 0.14
520 0.14
521 0.15
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.17
526 0.17
527 0.15
528 0.15
529 0.12
530 0.12
531 0.14
532 0.13
533 0.11
534 0.1
535 0.13
536 0.19
537 0.2
538 0.2
539 0.19
540 0.19
541 0.21
542 0.2
543 0.2
544 0.14
545 0.14
546 0.16
547 0.2
548 0.22
549 0.19
550 0.17
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.1
555 0.07
556 0.05
557 0.05
558 0.07
559 0.07
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.12
564 0.15
565 0.16
566 0.18
567 0.22
568 0.2
569 0.22
570 0.23
571 0.27
572 0.27
573 0.26
574 0.27
575 0.22
576 0.22
577 0.21
578 0.2
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.11
583 0.2
584 0.2
585 0.2
586 0.2
587 0.25
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.14
592 0.13
593 0.13
594 0.12
595 0.07
596 0.07
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.05
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.12
607 0.16
608 0.21
609 0.24
610 0.25
611 0.26
612 0.26
613 0.26
614 0.22
615 0.2
616 0.14
617 0.11
618 0.09
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.07
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.08
641 0.07
642 0.1
643 0.1
644 0.12
645 0.13
646 0.14
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.12
651 0.15
652 0.14
653 0.13
654 0.18
655 0.18
656 0.17
657 0.17
658 0.17
659 0.15
660 0.15
661 0.16
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.14
666 0.15
667 0.14
668 0.16
669 0.15
670 0.17
671 0.17
672 0.16
673 0.15
674 0.14
675 0.13
676 0.1
677 0.11
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.07
686 0.09
687 0.08
688 0.13
689 0.15
690 0.18
691 0.19
692 0.21
693 0.23
694 0.22
695 0.28
696 0.25
697 0.28
698 0.29
699 0.32
700 0.33
701 0.33
702 0.34
703 0.3
704 0.31
705 0.29
706 0.25
707 0.22
708 0.18
709 0.17
710 0.16
711 0.16
712 0.2
713 0.18
714 0.21
715 0.27
716 0.36
717 0.4
718 0.48
719 0.57
720 0.58
721 0.68
722 0.71
723 0.75
724 0.74
725 0.76
726 0.74
727 0.73
728 0.67
729 0.63
730 0.64
731 0.64
732 0.63
733 0.63
734 0.64
735 0.62
736 0.69
737 0.69
738 0.7
739 0.67
740 0.69
741 0.66
742 0.63
743 0.58
744 0.49
745 0.48
746 0.45
747 0.45
748 0.39
749 0.39
750 0.35
751 0.4
752 0.46
753 0.49
754 0.54
755 0.56
756 0.63
757 0.68
758 0.73
759 0.77
760 0.73
761 0.69
762 0.66
763 0.61
764 0.58
765 0.57
766 0.51
767 0.43
768 0.42
769 0.39
770 0.33
771 0.3
772 0.23
773 0.19
774 0.19
775 0.18
776 0.15
777 0.14
778 0.16
779 0.16
780 0.17
781 0.13
782 0.12
783 0.12
784 0.12
785 0.11
786 0.07
787 0.06
788 0.05
789 0.09
790 0.1
791 0.1
792 0.1
793 0.12
794 0.12
795 0.16
796 0.19
797 0.17
798 0.19
799 0.23
800 0.25
801 0.27
802 0.27
803 0.24
804 0.21
805 0.19
806 0.17
807 0.15
808 0.15
809 0.15
810 0.15
811 0.15
812 0.15
813 0.15
814 0.15
815 0.15
816 0.13
817 0.13
818 0.13
819 0.13
820 0.13
821 0.13
822 0.12
823 0.1
824 0.1
825 0.08
826 0.07
827 0.07
828 0.06
829 0.06
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.05
835 0.06
836 0.06
837 0.06
838 0.08
839 0.11
840 0.13
841 0.13
842 0.15
843 0.18
844 0.21
845 0.25
846 0.31
847 0.3
848 0.3
849 0.32
850 0.3
851 0.27
852 0.25
853 0.21
854 0.15
855 0.15
856 0.14
857 0.14
858 0.14
859 0.15
860 0.15
861 0.14
862 0.12
863 0.11
864 0.1
865 0.08
866 0.07
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.05
871 0.04
872 0.05
873 0.05
874 0.05
875 0.06
876 0.07
877 0.08
878 0.09
879 0.11
880 0.15
881 0.18
882 0.24
883 0.25
884 0.32
885 0.37
886 0.46
887 0.54
888 0.6
889 0.64
890 0.68
891 0.74
892 0.77
893 0.78
894 0.74
895 0.74
896 0.74
897 0.76
898 0.76
899 0.76
900 0.77
901 0.8
902 0.85
903 0.85
904 0.81