FuNGI

C5MF76

Protein Details

Accession

C5MF76

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-127	VDVAKRRDRKDQSTQEGRNKSN	Hydrophilic
145-166	RNLPWSCKKPDQLKKIFNKYGA	Hydrophilic
683-718	NQKNNKDSKFDSKRQKKGRKGSQKKGNMNKGNMNKG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
110-112	KRR
652-674	KRRREKEMIARNINKDGGKKRKR
693-755	DSKRQKKGRKGSQKKGNMNKGNMNKGGKSNDNAAKSEPKKKSGLSDDVKKIIGIKRMRRKSKK

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034809 Nop4_RRM4 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0042802 F:identical protein binding GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	ctp:CTRG_04719 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12677 RRM4_Nop4p

Amino Acid Sequences

MSTEEDKSVHVETVKSEEPVSTKSTPSEDGLDHKTLFVRSIPFEATSEELSEFFSQFVPVKHAVIVTDNEKKSRGFGFVSFTLDDDCLTALVESRKTKFKGRLLRVDVAKRRDRKDQSTQEGRNKSNDNSKITPIEKRRARLIIRNLPWSCKKPDQLKKIFNKYGAVFDAYIPKKKGGQMCGFAFVIMKKKSAAEKAVKECQGLKIDGREVAVDFAVEKSKWEQLKDEEDDQDEEEEESEEAKEDEKEDDEQEIKDDKESDDEEEDEENDDDENEDFDKLNEINSDDEPDSSDDIEIDIEEEEEEEEERKPRKKLNKQEAYSVFVRNIPYDADAESLKEHFSTFGPVKYALPVVDKETGLSKGSAFVAFAKESAYLDCLDNAPSVASTSMLIADDVSPSYVYQGRILSIASAVDRESANKLAERNSLKRKEALGKAPGEKDKRNLFLLNEGRITENSKLAQFISKTDLELREKSYKLRVQQLNKNPTLHLSLTRLAIRNLPRAMNAKALKALGRKAVVQFATEVKEEKRQPLSKEEVNRSVKFKHSFGDKEGEEEPVKSKNSKHKGVVKQAKVIMEVKGSGETGRSRGYGFIEFRDHKAALMGLRWLNAHEVSIPEILEGLSDEQKKMAELEGLSKRRLIVEFAIENAQVVKRRREKEMIARNINKDGGKKRKREDSDEDDDNQKNNKDSKFDSKRQKKGRKGSQKKGNMNKGNMNKGGKSNDNAAKSEPKKKSGLSDDVKKIIGIKRMRRKSKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.25
3	0.23
4	0.23
5	0.24
6	0.26
7	0.3
8	0.26
9	0.25
10	0.27
11	0.3
12	0.3
13	0.3
14	0.31
15	0.27
16	0.31
17	0.34
18	0.35
19	0.32
20	0.31
21	0.31
22	0.28
23	0.27
24	0.25
25	0.24
26	0.22
27	0.25
28	0.26
29	0.24
30	0.25
31	0.25
32	0.24
33	0.21
34	0.21
35	0.18
36	0.16
37	0.17
38	0.18
39	0.16
40	0.14
41	0.13
42	0.14
43	0.15
44	0.17
45	0.19
46	0.19
47	0.2
48	0.2
49	0.21
50	0.19
51	0.2
52	0.23
53	0.23
54	0.31
55	0.32
56	0.33
57	0.34
58	0.34
59	0.34
60	0.33
61	0.3
62	0.24
63	0.24
64	0.29
65	0.29
66	0.33
67	0.3
68	0.28
69	0.25
70	0.22
71	0.2
72	0.14
73	0.12
74	0.08
75	0.08
76	0.07
77	0.09
78	0.13
79	0.18
80	0.22
81	0.25
82	0.33
83	0.36
84	0.44
85	0.49
86	0.55
87	0.6
88	0.65
89	0.72
90	0.71
91	0.76
92	0.76
93	0.77
94	0.76
95	0.73
96	0.73
97	0.71
98	0.68
99	0.7
100	0.71
101	0.7
102	0.73
103	0.75
104	0.76
105	0.79
106	0.83
107	0.82
108	0.82
109	0.76
110	0.72
111	0.66
112	0.61
113	0.6
114	0.58
115	0.56
116	0.51
117	0.53
118	0.52
119	0.51
120	0.55
121	0.53
122	0.56
123	0.55
124	0.55
125	0.58
126	0.59
127	0.61
128	0.61
129	0.64
130	0.64
131	0.63
132	0.7
133	0.64
134	0.63
135	0.65
136	0.61
137	0.57
138	0.55
139	0.58
140	0.59
141	0.67
142	0.71
143	0.74
144	0.79
145	0.82
146	0.85
147	0.82
148	0.74
149	0.69
150	0.6
151	0.54
152	0.46
153	0.38
154	0.29
155	0.25
156	0.32
157	0.29
158	0.33
159	0.3
160	0.3
161	0.31
162	0.35
163	0.4
164	0.38
165	0.42
166	0.43
167	0.43
168	0.45
169	0.42
170	0.37
171	0.32
172	0.26
173	0.28
174	0.22
175	0.21
176	0.18
177	0.21
178	0.26
179	0.3
180	0.35
181	0.35
182	0.42
183	0.48
184	0.55
185	0.54
186	0.51
187	0.48
188	0.45
189	0.41
190	0.34
191	0.3
192	0.25
193	0.26
194	0.25
195	0.24
196	0.19
197	0.16
198	0.15
199	0.13
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.1
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.17
208	0.19
209	0.2
210	0.23
211	0.25
212	0.33
213	0.36
214	0.37
215	0.33
216	0.33
217	0.32
218	0.29
219	0.25
220	0.18
221	0.14
222	0.11
223	0.1
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.09
233	0.1
234	0.11
235	0.12
236	0.14
237	0.14
238	0.14
239	0.15
240	0.17
241	0.15
242	0.15
243	0.16
244	0.13
245	0.15
246	0.16
247	0.16
248	0.15
249	0.15
250	0.15
251	0.14
252	0.14
253	0.13
254	0.12
255	0.1
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.09
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.11
272	0.14
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.11
279	0.11
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.1
295	0.15
296	0.2
297	0.22
298	0.29
299	0.39
300	0.48
301	0.59
302	0.65
303	0.71
304	0.69
305	0.75
306	0.71
307	0.65
308	0.57
309	0.47
310	0.37
311	0.29
312	0.28
313	0.19
314	0.17
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.1
319	0.09
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.11
330	0.11
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.14
337	0.1
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.14
342	0.13
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.13
347	0.13
348	0.1
349	0.09
350	0.1
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.06
387	0.08
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.1
392	0.11
393	0.11
394	0.09
395	0.07
396	0.07
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.08
404	0.1
405	0.11
406	0.12
407	0.13
408	0.14
409	0.2
410	0.23
411	0.28
412	0.36
413	0.4
414	0.4
415	0.42
416	0.44
417	0.45
418	0.46
419	0.46
420	0.42
421	0.41
422	0.43
423	0.44
424	0.46
425	0.43
426	0.4
427	0.4
428	0.39
429	0.38
430	0.37
431	0.35
432	0.29
433	0.34
434	0.35
435	0.32
436	0.28
437	0.25
438	0.24
439	0.23
440	0.25
441	0.17
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.14
446	0.14
447	0.16
448	0.14
449	0.14
450	0.16
451	0.16
452	0.16
453	0.18
454	0.22
455	0.22
456	0.24
457	0.27
458	0.29
459	0.29
460	0.3
461	0.35
462	0.35
463	0.35
464	0.43
465	0.46
466	0.48
467	0.56
468	0.64
469	0.66
470	0.65
471	0.62
472	0.52
473	0.47
474	0.43
475	0.35
476	0.28
477	0.22
478	0.21
479	0.22
480	0.25
481	0.24
482	0.21
483	0.25
484	0.26
485	0.28
486	0.28
487	0.27
488	0.26
489	0.29
490	0.3
491	0.33
492	0.31
493	0.26
494	0.26
495	0.26
496	0.26
497	0.25
498	0.26
499	0.22
500	0.22
501	0.22
502	0.22
503	0.26
504	0.23
505	0.21
506	0.2
507	0.18
508	0.2
509	0.18
510	0.19
511	0.15
512	0.23
513	0.24
514	0.28
515	0.35
516	0.37
517	0.39
518	0.45
519	0.49
520	0.48
521	0.54
522	0.55
523	0.56
524	0.58
525	0.58
526	0.54
527	0.51
528	0.52
529	0.47
530	0.42
531	0.37
532	0.38
533	0.38
534	0.38
535	0.42
536	0.35
537	0.35
538	0.34
539	0.34
540	0.27
541	0.25
542	0.24
543	0.21
544	0.23
545	0.22
546	0.28
547	0.34
548	0.42
549	0.48
550	0.54
551	0.59
552	0.66
553	0.74
554	0.79
555	0.72
556	0.71
557	0.67
558	0.61
559	0.54
560	0.47
561	0.37
562	0.28
563	0.25
564	0.19
565	0.16
566	0.15
567	0.12
568	0.13
569	0.13
570	0.14
571	0.15
572	0.15
573	0.14
574	0.16
575	0.18
576	0.22
577	0.22
578	0.23
579	0.29
580	0.3
581	0.32
582	0.35
583	0.33
584	0.27
585	0.26
586	0.25
587	0.18
588	0.18
589	0.19
590	0.15
591	0.16
592	0.16
593	0.16
594	0.17
595	0.15
596	0.14
597	0.11
598	0.11
599	0.13
600	0.14
601	0.13
602	0.1
603	0.1
604	0.09
605	0.08
606	0.08
607	0.09
608	0.13
609	0.14
610	0.15
611	0.15
612	0.16
613	0.16
614	0.16
615	0.15
616	0.13
617	0.12
618	0.2
619	0.29
620	0.32
621	0.32
622	0.32
623	0.31
624	0.31
625	0.32
626	0.27
627	0.2
628	0.24
629	0.24
630	0.25
631	0.27
632	0.23
633	0.22
634	0.21
635	0.21
636	0.2
637	0.23
638	0.31
639	0.38
640	0.42
641	0.49
642	0.54
643	0.59
644	0.64
645	0.71
646	0.71
647	0.72
648	0.76
649	0.72
650	0.7
651	0.66
652	0.58
653	0.55
654	0.55
655	0.56
656	0.58
657	0.63
658	0.66
659	0.73
660	0.77
661	0.78
662	0.77
663	0.75
664	0.74
665	0.71
666	0.66
667	0.62
668	0.57
669	0.52
670	0.48
671	0.42
672	0.39
673	0.41
674	0.41
675	0.4
676	0.44
677	0.51
678	0.56
679	0.63
680	0.69
681	0.73
682	0.8
683	0.85
684	0.9
685	0.89
686	0.9
687	0.92
688	0.92
689	0.93
690	0.93
691	0.93
692	0.93
693	0.93
694	0.93
695	0.92
696	0.9
697	0.85
698	0.84
699	0.82
700	0.8
701	0.76
702	0.7
703	0.63
704	0.6
705	0.6
706	0.56
707	0.51
708	0.51
709	0.51
710	0.51
711	0.49
712	0.47
713	0.51
714	0.52
715	0.59
716	0.56
717	0.55
718	0.56
719	0.57
720	0.62
721	0.6
722	0.64
723	0.63
724	0.67
725	0.68
726	0.67
727	0.64
728	0.55
729	0.52
730	0.47
731	0.47
732	0.46
733	0.49
734	0.57
735	0.67

C5MF76

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer