Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MEW2

Protein Details
Accession C5MEW2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
365-386RVKLNNEKFKKNQKLNFQKFTDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040194  Cwf19-like  
IPR006768  Cwf19-like_C_dom-1  
IPR006767  Cwf19-like_C_dom-2  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0061632  F:RNA lariat debranching enzyme activator activity  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ctp:CTRG_04605  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04677  CwfJ_C_1  
PF04676  CwfJ_C_2  
CDD cd07380  MPP_CWF19_N  
Amino Acid Sequences MASKFLILNPSPDALDKVLEKSNLQYTKNGPFEATILLGDVLPQGKKLPTVKVIGSTYFTEGKNGFSEDINIEDSNLVDVADNLTFAKPPFRIIKTVSGFTIMFVSKFEDFELPKIDIDILITYEWPQSIAQMLTTFGNDKVDDLVAKVKPRYHFAVGNEAGMFFELEPFAWPTGQVTRFISLGQEGSGDKWFYAFSISKVEDIPTKLIDNPITSKKRAREEEIIEEKSISKTEAKKPKVVSPDQCFFCVGNANTETHMIVSIGSSAYLTIAKGPLTRSNKNLSFSGHGILIPIEHTATVSQDSPVRKELLRYQDSLVTAFDEQKPNLKLIFWEISRDTNIHHHIQFLPVQDTLLGKFPNSLNLRVKLNNEKFKKNQKLNFQKFTDSSDPALLKIIESNNYMMFTLCENKTNRIYYITPLNENPIDIQFPRRVLAHVLNLPDRVHWDKCQQPKLKEMSDCDNFKSFFQKYDFTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.21
5 0.24
6 0.25
7 0.25
8 0.27
9 0.35
10 0.38
11 0.38
12 0.39
13 0.39
14 0.47
15 0.51
16 0.47
17 0.38
18 0.33
19 0.33
20 0.29
21 0.25
22 0.16
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.2
34 0.23
35 0.27
36 0.29
37 0.34
38 0.35
39 0.39
40 0.4
41 0.36
42 0.36
43 0.32
44 0.3
45 0.31
46 0.29
47 0.26
48 0.24
49 0.25
50 0.24
51 0.24
52 0.21
53 0.17
54 0.2
55 0.17
56 0.19
57 0.19
58 0.17
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.12
63 0.11
64 0.09
65 0.06
66 0.06
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.14
75 0.13
76 0.18
77 0.24
78 0.26
79 0.3
80 0.33
81 0.42
82 0.41
83 0.43
84 0.38
85 0.34
86 0.31
87 0.28
88 0.28
89 0.19
90 0.14
91 0.13
92 0.16
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.2
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.13
105 0.13
106 0.11
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.09
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.15
133 0.15
134 0.18
135 0.2
136 0.23
137 0.25
138 0.29
139 0.33
140 0.31
141 0.34
142 0.32
143 0.4
144 0.36
145 0.36
146 0.31
147 0.26
148 0.22
149 0.18
150 0.16
151 0.06
152 0.06
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.16
190 0.17
191 0.17
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.23
200 0.26
201 0.27
202 0.31
203 0.35
204 0.42
205 0.44
206 0.45
207 0.44
208 0.44
209 0.52
210 0.53
211 0.49
212 0.41
213 0.38
214 0.34
215 0.27
216 0.23
217 0.15
218 0.13
219 0.16
220 0.25
221 0.34
222 0.36
223 0.4
224 0.42
225 0.47
226 0.5
227 0.5
228 0.49
229 0.46
230 0.51
231 0.47
232 0.45
233 0.41
234 0.34
235 0.29
236 0.26
237 0.2
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.1
245 0.1
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.09
262 0.17
263 0.23
264 0.25
265 0.28
266 0.35
267 0.38
268 0.39
269 0.39
270 0.33
271 0.3
272 0.29
273 0.27
274 0.2
275 0.16
276 0.14
277 0.13
278 0.1
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.17
293 0.19
294 0.18
295 0.2
296 0.26
297 0.32
298 0.34
299 0.33
300 0.33
301 0.34
302 0.34
303 0.32
304 0.25
305 0.17
306 0.15
307 0.16
308 0.18
309 0.18
310 0.18
311 0.23
312 0.24
313 0.23
314 0.23
315 0.21
316 0.18
317 0.2
318 0.25
319 0.19
320 0.22
321 0.22
322 0.24
323 0.25
324 0.24
325 0.21
326 0.22
327 0.26
328 0.27
329 0.25
330 0.26
331 0.25
332 0.28
333 0.29
334 0.25
335 0.23
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.16
340 0.14
341 0.16
342 0.14
343 0.11
344 0.15
345 0.15
346 0.23
347 0.25
348 0.3
349 0.32
350 0.35
351 0.39
352 0.39
353 0.44
354 0.46
355 0.52
356 0.56
357 0.55
358 0.6
359 0.64
360 0.72
361 0.78
362 0.76
363 0.75
364 0.76
365 0.82
366 0.84
367 0.84
368 0.76
369 0.72
370 0.64
371 0.64
372 0.58
373 0.49
374 0.42
375 0.38
376 0.36
377 0.3
378 0.31
379 0.24
380 0.18
381 0.2
382 0.2
383 0.18
384 0.19
385 0.2
386 0.18
387 0.19
388 0.19
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.18
393 0.18
394 0.23
395 0.25
396 0.3
397 0.36
398 0.38
399 0.37
400 0.35
401 0.36
402 0.33
403 0.41
404 0.39
405 0.37
406 0.35
407 0.4
408 0.35
409 0.34
410 0.32
411 0.25
412 0.24
413 0.22
414 0.26
415 0.24
416 0.25
417 0.26
418 0.25
419 0.25
420 0.27
421 0.31
422 0.33
423 0.33
424 0.37
425 0.38
426 0.39
427 0.38
428 0.34
429 0.34
430 0.32
431 0.32
432 0.32
433 0.37
434 0.43
435 0.53
436 0.62
437 0.65
438 0.63
439 0.69
440 0.72
441 0.72
442 0.69
443 0.65
444 0.64
445 0.64
446 0.63
447 0.58
448 0.56
449 0.49
450 0.45
451 0.48
452 0.4
453 0.38
454 0.39