Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MCQ3

Protein Details
Accession C5MCQ3    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-84GDFLNSIRKNKQKKAQKEETEKANANHydrophilic
87-129GAPKLLSKKEKEKLKKEAEKQKKKEQAQKKKAQQASKKEQIKEBasic
157-177PVEPAKSKPAKKGKKAPAGLAHydrophilic
239-263EGKLLTKKQKEEKKLQERRRQQLLQHydrophilic
277-303SDTPKPKKIVYTKKKSTKPKTFIQKSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-125RKNKQKKAQKEETEKANANNGGAPKLLSKKEKEKLKKEAEKQKKKEQAQKKKAQQASKKE
161-181AKSKPAKKGKKAPAGLAALKK
216-258AKKEAARAAKKERERLKKEQLKAEGKLLTKKQKEEKKLQERRR
289-291KKK
383-408KRKQEEAERKAKQEALKKAAEEAKAK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.833, cyto 10.5, mito_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004161  EFTu-like_2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR005225  Small_GTP-bd_dom  
IPR000795  T_Tr_GTP-bd_dom  
IPR015760  TIF_IF2  
IPR023115  TIF_IF2_dom3  
IPR036925  TIF_IF2_dom3_sf  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0042256  P:cytosolic ribosome assembly  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0006446  P:regulation of translational initiation  
KEGG ctp:CTRG_04004  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00009  GTP_EFTU  
PF03144  GTP_EFTU_D2  
PF11987  IF-2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51722  G_TR_2  
CDD cd03703  aeIF5B_II  
cd01887  IF2_eIF5B  
Amino Acid Sequences MAKKGKKGGQAGGDFWDDEDMAQEQPQAEEFGTPSETATPEPETENSEPQEASAEDISGDFLNSIRKNKQKKAQKEETEKANANNGGAPKLLSKKEKEKLKKEAEKQKKKEQAQKKKAQQASKKEQIKEANKQNAAAAAASSASSSAAATPEPEEAPVEPAKSKPAKKGKKAPAGLAALKKQLELKKQLEEEQRRLEQEEEERRLEEEKLAAEEEAKKEAARAAKKERERLKKEQLKAEGKLLTKKQKEEKKLQERRRQQLLQAGNVSVAGLNKTDSDTPKPKKIVYTKKKSTKPKTFIQKSAQTKAPVAKTEDDEDEALVDDWEKMALDDDEPVVDDWEAALDDENVTKDEEEAGADAEAETEAEKAKAAQLEQERLAAEAKRKQEEAERKAKQEALKKAAEEAKAKELAAQKKSSTPPEQDLRSPICCILGHVDTGKTKLLDKIRQTNVQGGEAGGITQQIGATYFPVESIKQKTAVMAQYEKQTFDVPGLLIIDTPGHESFTNLRSRGSSLCNIAILVIDIMHGLEQQTLESIRLLRDRKAPFVVALNKIDRLYDWKEIPNNSFRDSFARQTKAVQSEFQNRYDQIKLALSEQGLNSELYFQNKNMSKYVSIVPTSAVTGEGVPDLLWLLLELTQKRMSKQLMYLSKVEATILEVKVVEGFGYTIDVVLSNGILREGDRVVLCGLNGPIATNIRALLTPPPSRELRVKSEYVHLKEVKAALGVKIAANDLEKAVAGSRLLVVGEDDDEEELMDEVMDDLTGLLDTVDTSGKGVVVQASTLGSLEALLDFLKDMKIPVMSIGLGPVYKRDVMKACTMLEKAPELAVMLCFDVKVDKEAEQYAEEQNIKIFNADIIYHLFDAFTAYQAKLMEVRRKEFMEYAVFPCVLKTIQIINKRNPMIIGVDVVEGTVKIGTPICAVRTDPVTKQPNILLLGTVVSLEVSHKPHDSVKKGQTSAGVAMRLENPSSSQPTWGRHVDESDNLYSLITRKSIDTLKDPAFRDSVSRDDWLLIKKLKPVFDIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.33
3 0.27
4 0.18
5 0.14
6 0.15
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.13
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.14
22 0.15
23 0.16
24 0.15
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.21
29 0.21
30 0.25
31 0.28
32 0.33
33 0.32
34 0.31
35 0.3
36 0.27
37 0.29
38 0.22
39 0.22
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.11
46 0.11
47 0.08
48 0.08
49 0.16
50 0.19
51 0.25
52 0.32
53 0.41
54 0.5
55 0.59
56 0.69
57 0.71
58 0.79
59 0.84
60 0.86
61 0.88
62 0.89
63 0.87
64 0.86
65 0.84
66 0.76
67 0.68
68 0.65
69 0.55
70 0.46
71 0.42
72 0.35
73 0.28
74 0.25
75 0.23
76 0.21
77 0.26
78 0.32
79 0.34
80 0.4
81 0.49
82 0.56
83 0.66
84 0.72
85 0.74
86 0.78
87 0.83
88 0.86
89 0.86
90 0.89
91 0.9
92 0.9
93 0.89
94 0.89
95 0.88
96 0.87
97 0.88
98 0.88
99 0.88
100 0.88
101 0.91
102 0.9
103 0.9
104 0.88
105 0.88
106 0.86
107 0.85
108 0.85
109 0.84
110 0.82
111 0.75
112 0.75
113 0.75
114 0.74
115 0.73
116 0.73
117 0.73
118 0.66
119 0.64
120 0.57
121 0.5
122 0.42
123 0.32
124 0.22
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.09
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.25
149 0.31
150 0.35
151 0.41
152 0.5
153 0.59
154 0.67
155 0.78
156 0.8
157 0.82
158 0.82
159 0.77
160 0.74
161 0.7
162 0.66
163 0.61
164 0.54
165 0.48
166 0.44
167 0.4
168 0.38
169 0.37
170 0.39
171 0.41
172 0.42
173 0.45
174 0.47
175 0.54
176 0.58
177 0.6
178 0.6
179 0.6
180 0.6
181 0.54
182 0.53
183 0.47
184 0.41
185 0.42
186 0.45
187 0.42
188 0.4
189 0.39
190 0.38
191 0.38
192 0.34
193 0.27
194 0.2
195 0.16
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.16
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.16
205 0.16
206 0.2
207 0.25
208 0.27
209 0.32
210 0.39
211 0.48
212 0.53
213 0.62
214 0.68
215 0.71
216 0.73
217 0.76
218 0.78
219 0.78
220 0.79
221 0.78
222 0.78
223 0.74
224 0.69
225 0.65
226 0.59
227 0.53
228 0.54
229 0.53
230 0.53
231 0.51
232 0.56
233 0.59
234 0.63
235 0.68
236 0.71
237 0.75
238 0.77
239 0.82
240 0.86
241 0.87
242 0.88
243 0.88
244 0.88
245 0.79
246 0.71
247 0.69
248 0.63
249 0.58
250 0.5
251 0.42
252 0.32
253 0.29
254 0.25
255 0.18
256 0.14
257 0.08
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.12
263 0.14
264 0.21
265 0.31
266 0.36
267 0.43
268 0.46
269 0.46
270 0.51
271 0.58
272 0.62
273 0.63
274 0.69
275 0.72
276 0.79
277 0.86
278 0.88
279 0.89
280 0.88
281 0.84
282 0.82
283 0.83
284 0.81
285 0.8
286 0.77
287 0.76
288 0.72
289 0.72
290 0.68
291 0.58
292 0.54
293 0.51
294 0.47
295 0.41
296 0.38
297 0.35
298 0.32
299 0.33
300 0.31
301 0.27
302 0.23
303 0.19
304 0.16
305 0.14
306 0.11
307 0.08
308 0.07
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.05
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.13
359 0.16
360 0.2
361 0.2
362 0.21
363 0.2
364 0.19
365 0.21
366 0.17
367 0.18
368 0.2
369 0.24
370 0.25
371 0.25
372 0.26
373 0.33
374 0.41
375 0.43
376 0.49
377 0.48
378 0.48
379 0.5
380 0.53
381 0.49
382 0.47
383 0.47
384 0.42
385 0.41
386 0.39
387 0.41
388 0.41
389 0.4
390 0.35
391 0.3
392 0.28
393 0.27
394 0.27
395 0.27
396 0.29
397 0.32
398 0.33
399 0.32
400 0.29
401 0.34
402 0.37
403 0.38
404 0.36
405 0.33
406 0.35
407 0.39
408 0.4
409 0.36
410 0.38
411 0.35
412 0.32
413 0.3
414 0.24
415 0.2
416 0.18
417 0.17
418 0.16
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.14
423 0.12
424 0.14
425 0.14
426 0.11
427 0.11
428 0.16
429 0.21
430 0.25
431 0.29
432 0.37
433 0.4
434 0.44
435 0.45
436 0.45
437 0.4
438 0.35
439 0.31
440 0.21
441 0.18
442 0.13
443 0.12
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.03
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.07
458 0.09
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.18
465 0.2
466 0.19
467 0.18
468 0.18
469 0.22
470 0.23
471 0.23
472 0.2
473 0.18
474 0.16
475 0.14
476 0.13
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.04
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.1
491 0.14
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.17
497 0.19
498 0.2
499 0.18
500 0.16
501 0.16
502 0.15
503 0.15
504 0.13
505 0.11
506 0.08
507 0.05
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.04
517 0.03
518 0.04
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.12
525 0.14
526 0.16
527 0.24
528 0.25
529 0.27
530 0.28
531 0.28
532 0.23
533 0.27
534 0.3
535 0.25
536 0.26
537 0.24
538 0.24
539 0.24
540 0.23
541 0.17
542 0.17
543 0.18
544 0.19
545 0.2
546 0.21
547 0.25
548 0.26
549 0.29
550 0.3
551 0.29
552 0.28
553 0.27
554 0.25
555 0.27
556 0.28
557 0.31
558 0.31
559 0.32
560 0.3
561 0.31
562 0.35
563 0.35
564 0.33
565 0.3
566 0.28
567 0.35
568 0.38
569 0.37
570 0.35
571 0.31
572 0.33
573 0.32
574 0.28
575 0.19
576 0.18
577 0.17
578 0.15
579 0.16
580 0.13
581 0.14
582 0.13
583 0.12
584 0.11
585 0.11
586 0.09
587 0.1
588 0.11
589 0.12
590 0.13
591 0.12
592 0.18
593 0.22
594 0.24
595 0.23
596 0.24
597 0.21
598 0.23
599 0.26
600 0.22
601 0.19
602 0.18
603 0.17
604 0.15
605 0.15
606 0.12
607 0.09
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.03
620 0.06
621 0.09
622 0.09
623 0.12
624 0.18
625 0.19
626 0.2
627 0.24
628 0.23
629 0.23
630 0.26
631 0.31
632 0.32
633 0.35
634 0.35
635 0.32
636 0.31
637 0.29
638 0.25
639 0.17
640 0.13
641 0.14
642 0.13
643 0.12
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.09
649 0.04
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.04
665 0.06
666 0.06
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.08
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.1
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.12
687 0.17
688 0.19
689 0.2
690 0.24
691 0.25
692 0.28
693 0.33
694 0.34
695 0.36
696 0.38
697 0.38
698 0.36
699 0.43
700 0.48
701 0.45
702 0.47
703 0.41
704 0.36
705 0.37
706 0.36
707 0.28
708 0.23
709 0.2
710 0.13
711 0.14
712 0.14
713 0.11
714 0.11
715 0.11
716 0.09
717 0.09
718 0.09
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.05
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.04
742 0.04
743 0.04
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.03
748 0.03
749 0.03
750 0.03
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.04
756 0.05
757 0.05
758 0.05
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.07
766 0.07
767 0.07
768 0.07
769 0.07
770 0.06
771 0.05
772 0.04
773 0.05
774 0.04
775 0.04
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.06
783 0.07
784 0.08
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.08
793 0.08
794 0.09
795 0.1
796 0.13
797 0.13
798 0.17
799 0.21
800 0.24
801 0.29
802 0.31
803 0.3
804 0.31
805 0.32
806 0.29
807 0.26
808 0.25
809 0.2
810 0.17
811 0.16
812 0.12
813 0.11
814 0.11
815 0.09
816 0.08
817 0.08
818 0.07
819 0.07
820 0.09
821 0.09
822 0.1
823 0.11
824 0.12
825 0.14
826 0.16
827 0.18
828 0.17
829 0.19
830 0.19
831 0.22
832 0.22
833 0.2
834 0.2
835 0.19
836 0.18
837 0.16
838 0.14
839 0.1
840 0.11
841 0.11
842 0.11
843 0.12
844 0.13
845 0.13
846 0.13
847 0.12
848 0.1
849 0.13
850 0.12
851 0.12
852 0.12
853 0.12
854 0.14
855 0.15
856 0.16
857 0.18
858 0.24
859 0.3
860 0.33
861 0.36
862 0.39
863 0.4
864 0.42
865 0.39
866 0.36
867 0.35
868 0.33
869 0.33
870 0.31
871 0.3
872 0.27
873 0.25
874 0.23
875 0.16
876 0.13
877 0.13
878 0.17
879 0.24
880 0.34
881 0.4
882 0.46
883 0.54
884 0.55
885 0.54
886 0.46
887 0.41
888 0.34
889 0.29
890 0.23
891 0.16
892 0.15
893 0.14
894 0.13
895 0.11
896 0.08
897 0.08
898 0.06
899 0.05
900 0.06
901 0.07
902 0.08
903 0.1
904 0.12
905 0.13
906 0.15
907 0.16
908 0.18
909 0.23
910 0.27
911 0.27
912 0.35
913 0.4
914 0.39
915 0.42
916 0.41
917 0.4
918 0.38
919 0.36
920 0.26
921 0.2
922 0.2
923 0.16
924 0.14
925 0.09
926 0.06
927 0.06
928 0.07
929 0.11
930 0.13
931 0.16
932 0.17
933 0.2
934 0.27
935 0.36
936 0.4
937 0.46
938 0.52
939 0.59
940 0.58
941 0.58
942 0.55
943 0.5
944 0.49
945 0.43
946 0.36
947 0.27
948 0.29
949 0.3
950 0.28
951 0.25
952 0.2
953 0.18
954 0.21
955 0.28
956 0.26
957 0.3
958 0.33
959 0.37
960 0.42
961 0.44
962 0.44
963 0.4
964 0.44
965 0.41
966 0.42
967 0.42
968 0.38
969 0.34
970 0.3
971 0.27
972 0.24
973 0.23
974 0.2
975 0.16
976 0.16
977 0.16
978 0.21
979 0.27
980 0.3
981 0.32
982 0.37
983 0.43
984 0.49
985 0.49
986 0.47
987 0.44
988 0.41
989 0.4
990 0.36
991 0.35
992 0.31
993 0.31
994 0.28
995 0.29
996 0.32
997 0.33
998 0.36
999 0.36
1000 0.35
1001 0.4
1002 0.45
1003 0.46