FuNGI

A0A5N6TFA8

Protein Details

Accession

A0A5N6TFA8

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-40	APPMRIRRPKAADPLVRPKRKP	Basic
134-155	AQFTRPVRLQRRDPRARPHDGN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-43	MRIRRPKAADPLVRPKRKPVAK
411-434	REKKEKEARRVLGKKVRKALQKRE

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPTNGPTSRIQTPPNGAPPMRIRRPKAADPLVRPKRKPVAKPTGSMLDNGPAQKPAYTRPFTSNPLPAPPPEKVKTIPSASDFTANGFSGPLLSETYVDYPLVTTKRALREGLKHHVARFTSKKTIDPRDEAQFTRPVRLQRRDPRARPHDGNLEKSQDTPKAASDSSHQMDEVEREELEAKKTAREKERAENLAQIAPSVGSAPKRANVPKQKTQQVSKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFVLEDTGKMRMIPIEKWYRFNVKNQFKALSIEEAEKFMTKKVKDPRWFMEKQQEMAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPSRVEGLEADDMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEEAKAAEKRIKKDQLKANIFDLKDEKDYEEEELREKKEKEARRVLGKKVRKALQKREKNFDYSSGSDVNPYSDEESSEDSETEKPKDEERKTEDDKNKKDTTVPSKGSGTPSGRAKQIDIMKKGTITAPRKRPGSPNASDASGTDTSRKKERSKHMSSQPVASNSRSMATAVSSSMPKRVRNVTTGGAGSGSDADGGAGSGGEISENGKAKKLKLNPPTATSQVGTPQGSRAGSPMPLANMSFPGSRASSPESSRVQNRVSTPGIAGNQSFPTPAEIHAAIPSSGILSSDLLKIFRPRIGDSKENHRRFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.54
3	0.55
4	0.55
5	0.49
6	0.51
7	0.57
8	0.61
9	0.64
10	0.66
11	0.64
12	0.67
13	0.75
14	0.77
15	0.77
16	0.77
17	0.76
18	0.76
19	0.81
20	0.82
21	0.83
22	0.76
23	0.75
24	0.76
25	0.76
26	0.76
27	0.76
28	0.76
29	0.73
30	0.75
31	0.72
32	0.7
33	0.62
34	0.54
35	0.45
36	0.38
37	0.36
38	0.34
39	0.29
40	0.23
41	0.23
42	0.24
43	0.24
44	0.27
45	0.33
46	0.35
47	0.37
48	0.42
49	0.47
50	0.5
51	0.54
52	0.53
53	0.47
54	0.5
55	0.49
56	0.45
57	0.45
58	0.44
59	0.46
60	0.41
61	0.43
62	0.39
63	0.42
64	0.46
65	0.45
66	0.45
67	0.4
68	0.41
69	0.38
70	0.39
71	0.34
72	0.29
73	0.28
74	0.24
75	0.2
76	0.16
77	0.15
78	0.11
79	0.11
80	0.1
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.15
91	0.16
92	0.16
93	0.17
94	0.22
95	0.28
96	0.31
97	0.34
98	0.35
99	0.42
100	0.48
101	0.54
102	0.57
103	0.53
104	0.52
105	0.55
106	0.51
107	0.5
108	0.5
109	0.48
110	0.48
111	0.47
112	0.52
113	0.55
114	0.63
115	0.61
116	0.59
117	0.57
118	0.57
119	0.59
120	0.54
121	0.49
122	0.47
123	0.42
124	0.42
125	0.41
126	0.41
127	0.46
128	0.53
129	0.59
130	0.62
131	0.72
132	0.77
133	0.8
134	0.82
135	0.81
136	0.82
137	0.76
138	0.72
139	0.72
140	0.66
141	0.66
142	0.59
143	0.57
144	0.48
145	0.46
146	0.44
147	0.36
148	0.34
149	0.29
150	0.26
151	0.25
152	0.25
153	0.23
154	0.23
155	0.27
156	0.27
157	0.26
158	0.24
159	0.2
160	0.21
161	0.22
162	0.2
163	0.14
164	0.11
165	0.12
166	0.14
167	0.15
168	0.16
169	0.19
170	0.18
171	0.22
172	0.28
173	0.34
174	0.4
175	0.46
176	0.48
177	0.53
178	0.61
179	0.59
180	0.56
181	0.52
182	0.47
183	0.42
184	0.37
185	0.27
186	0.19
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.1
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.14
195	0.2
196	0.24
197	0.33
198	0.42
199	0.49
200	0.56
201	0.63
202	0.69
203	0.7
204	0.72
205	0.7
206	0.66
207	0.64
208	0.57
209	0.52
210	0.47
211	0.41
212	0.37
213	0.31
214	0.26
215	0.24
216	0.24
217	0.23
218	0.23
219	0.23
220	0.21
221	0.21
222	0.22
223	0.19
224	0.2
225	0.24
226	0.25
227	0.28
228	0.27
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.21
233	0.17
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.16
242	0.13
243	0.09
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.08
258	0.06
259	0.07
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.1
267	0.11
268	0.17
269	0.27
270	0.28
271	0.31
272	0.34
273	0.4
274	0.39
275	0.46
276	0.5
277	0.48
278	0.52
279	0.52
280	0.5
281	0.43
282	0.44
283	0.37
284	0.3
285	0.23
286	0.2
287	0.17
288	0.16
289	0.16
290	0.14
291	0.13
292	0.13
293	0.18
294	0.16
295	0.22
296	0.31
297	0.4
298	0.46
299	0.51
300	0.54
301	0.57
302	0.58
303	0.54
304	0.55
305	0.48
306	0.43
307	0.45
308	0.46
309	0.41
310	0.41
311	0.43
312	0.35
313	0.33
314	0.35
315	0.31
316	0.25
317	0.27
318	0.34
319	0.37
320	0.42
321	0.42
322	0.4
323	0.41
324	0.44
325	0.42
326	0.44
327	0.41
328	0.38
329	0.45
330	0.46
331	0.45
332	0.4
333	0.39
334	0.3
335	0.24
336	0.21
337	0.14
338	0.13
339	0.12
340	0.1
341	0.1
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.09
356	0.09
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.06
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.12
371	0.16
372	0.2
373	0.28
374	0.37
375	0.4
376	0.48
377	0.54
378	0.59
379	0.6
380	0.59
381	0.54
382	0.5
383	0.46
384	0.4
385	0.35
386	0.26
387	0.23
388	0.21
389	0.18
390	0.14
391	0.15
392	0.15
393	0.16
394	0.14
395	0.16
396	0.19
397	0.2
398	0.25
399	0.25
400	0.29
401	0.34
402	0.4
403	0.45
404	0.51
405	0.54
406	0.59
407	0.63
408	0.65
409	0.67
410	0.67
411	0.65
412	0.63
413	0.65
414	0.63
415	0.66
416	0.7
417	0.71
418	0.74
419	0.73
420	0.75
421	0.72
422	0.68
423	0.61
424	0.54
425	0.49
426	0.4
427	0.37
428	0.3
429	0.27
430	0.24
431	0.22
432	0.18
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.13
443	0.13
444	0.16
445	0.18
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.23
450	0.32
451	0.34
452	0.39
453	0.43
454	0.5
455	0.52
456	0.61
457	0.64
458	0.64
459	0.67
460	0.67
461	0.63
462	0.55
463	0.54
464	0.52
465	0.53
466	0.52
467	0.49
468	0.45
469	0.45
470	0.46
471	0.45
472	0.43
473	0.37
474	0.33
475	0.36
476	0.36
477	0.36
478	0.34
479	0.32
480	0.32
481	0.37
482	0.4
483	0.37
484	0.38
485	0.36
486	0.35
487	0.35
488	0.32
489	0.33
490	0.33
491	0.39
492	0.44
493	0.5
494	0.53
495	0.55
496	0.58
497	0.58
498	0.59
499	0.53
500	0.5
501	0.45
502	0.44
503	0.41
504	0.34
505	0.31
506	0.24
507	0.22
508	0.22
509	0.24
510	0.26
511	0.33
512	0.39
513	0.4
514	0.47
515	0.57
516	0.62
517	0.67
518	0.73
519	0.75
520	0.8
521	0.75
522	0.72
523	0.67
524	0.62
525	0.56
526	0.47
527	0.4
528	0.3
529	0.29
530	0.23
531	0.19
532	0.13
533	0.12
534	0.11
535	0.1
536	0.11
537	0.13
538	0.13
539	0.2
540	0.24
541	0.25
542	0.29
543	0.35
544	0.37
545	0.38
546	0.41
547	0.37
548	0.37
549	0.35
550	0.31
551	0.23
552	0.2
553	0.17
554	0.13
555	0.1
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.09
570	0.13
571	0.14
572	0.19
573	0.22
574	0.25
575	0.33
576	0.41
577	0.47
578	0.52
579	0.62
580	0.6
581	0.62
582	0.65
583	0.59
584	0.53
585	0.44
586	0.37
587	0.31
588	0.32
589	0.29
590	0.24
591	0.23
592	0.24
593	0.24
594	0.22
595	0.19
596	0.17
597	0.17
598	0.18
599	0.17
600	0.16
601	0.17
602	0.17
603	0.16
604	0.16
605	0.17
606	0.16
607	0.15
608	0.16
609	0.17
610	0.17
611	0.19
612	0.23
613	0.26
614	0.28
615	0.34
616	0.35
617	0.39
618	0.45
619	0.47
620	0.44
621	0.44
622	0.44
623	0.44
624	0.42
625	0.38
626	0.33
627	0.33
628	0.32
629	0.29
630	0.27
631	0.23
632	0.23
633	0.22
634	0.21
635	0.16
636	0.18
637	0.17
638	0.17
639	0.19
640	0.18
641	0.18
642	0.2
643	0.21
644	0.17
645	0.16
646	0.15
647	0.11
648	0.1
649	0.1
650	0.09
651	0.08
652	0.1
653	0.13
654	0.14
655	0.14
656	0.17
657	0.22
658	0.24
659	0.25
660	0.27
661	0.28
662	0.36
663	0.43
664	0.48
665	0.48
666	0.56
667	0.64
668	0.65
669	0.64
670	0.56
671	0.5
672	0.45
673	0.49
674	0.45
675	0.39
676	0.37
677	0.35
678	0.35
679	0.33
680	0.32
681	0.25
682	0.19
683	0.17
684	0.18
685	0.21
686	0.22
687	0.23
688	0.29
689	0.31
690	0.3
691	0.34

A0A5N6TFA8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer