Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TCX4

Protein Details
Accession A0A5N6TCX4    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-106EREGPRRDRGGRRNDRQSRTBasic
204-227EEYIKGKEEKAKQQRSRKEKNVLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-42KR
45-46PK
81-99REKPTDEREGPRRDRGGRR
190-202PKWAKAKEFKRGE
206-223YIKGKEEKAKQQRSRKEK
237-265RGNSGPRGRGGRGGRGGRGGRPSNAPPRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNLYELLGNDPELDPNRAPEPPAKAVDRPAQRVGKRDTPKEAPQPRPGQNSRRGNNASGNEAAFRDRNAGRNQNREKPTDEREGPRRDRGGRRNDRQSRTGQTDTGKKVNQGWGGQSGDKEWADERAAEKIAKNDETEPQTPAEEAEPVDKSKSLADYLAEKAAQGDLSAKPVRSANEGSKADPKWAKAKEFKRGEDEEYIKGKEEKAKQQRSRKEKNVLDVDMRFVEAPRGNSGPRGRGGRGGRGGRGGRPSNAPPRGERSAPVTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.22
8 0.22
9 0.25
10 0.24
11 0.26
12 0.27
13 0.31
14 0.33
15 0.38
16 0.38
17 0.37
18 0.43
19 0.49
20 0.51
21 0.49
22 0.51
23 0.55
24 0.54
25 0.59
26 0.6
27 0.61
28 0.62
29 0.62
30 0.62
31 0.61
32 0.66
33 0.69
34 0.71
35 0.69
36 0.7
37 0.74
38 0.73
39 0.75
40 0.74
41 0.72
42 0.73
43 0.76
44 0.69
45 0.7
46 0.66
47 0.59
48 0.59
49 0.53
50 0.47
51 0.38
52 0.36
53 0.28
54 0.25
55 0.24
56 0.18
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.23
61 0.28
62 0.37
63 0.41
64 0.51
65 0.58
66 0.62
67 0.64
68 0.61
69 0.59
70 0.55
71 0.55
72 0.54
73 0.52
74 0.49
75 0.54
76 0.6
77 0.6
78 0.6
79 0.6
80 0.58
81 0.63
82 0.64
83 0.67
84 0.68
85 0.72
86 0.77
87 0.81
88 0.78
89 0.73
90 0.7
91 0.65
92 0.61
93 0.55
94 0.47
95 0.42
96 0.44
97 0.44
98 0.44
99 0.38
100 0.32
101 0.33
102 0.35
103 0.34
104 0.28
105 0.25
106 0.24
107 0.24
108 0.24
109 0.21
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.18
129 0.22
130 0.22
131 0.2
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.12
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.16
166 0.17
167 0.19
168 0.22
169 0.21
170 0.28
171 0.29
172 0.3
173 0.35
174 0.34
175 0.36
176 0.35
177 0.34
178 0.33
179 0.36
180 0.4
181 0.43
182 0.48
183 0.53
184 0.58
185 0.58
186 0.57
187 0.56
188 0.53
189 0.52
190 0.49
191 0.44
192 0.41
193 0.39
194 0.34
195 0.32
196 0.3
197 0.3
198 0.34
199 0.39
200 0.46
201 0.56
202 0.63
203 0.73
204 0.8
205 0.83
206 0.87
207 0.85
208 0.85
209 0.79
210 0.79
211 0.77
212 0.7
213 0.65
214 0.56
215 0.5
216 0.4
217 0.36
218 0.27
219 0.19
220 0.21
221 0.19
222 0.2
223 0.21
224 0.23
225 0.23
226 0.29
227 0.33
228 0.32
229 0.34
230 0.37
231 0.35
232 0.4
233 0.44
234 0.45
235 0.5
236 0.49
237 0.46
238 0.49
239 0.5
240 0.46
241 0.51
242 0.46
243 0.4
244 0.43
245 0.48
246 0.5
247 0.55
248 0.53
249 0.49
250 0.53
251 0.56
252 0.52
253 0.47
254 0.43
255 0.44
256 0.42
257 0.41
258 0.36
259 0.34
260 0.36
261 0.38
262 0.34
263 0.29
264 0.28