Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5M1T6

Protein Details
Accession C5M1T6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
372-392YENIKRLVKKRSTNEDGQQSKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG ctp:CTRG_00025  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MSSLPSDIVLPPNEIKQTIEKTVGYVIKNGKSFEERLLNNNKNDKFDFINPDNENYPYYKWKLTTLQDQAEKTPDESQNDQDIIIPTPRELSFLIELPVISKYDLDVIKTTALYIAQNGKEKIPDLLNHETVLGKKAQFEFLNDSHSLNCLFQKYVDQYKSIIKLYKSENHPLQKRILPKQQHFTMLTEAYDRAQFIKQNTVNEKKAQEVERERQLHYASIDWQDFTLVAKVDFDAIDEVQELSVPLKRDDLIKRSLEAKSKEVELPKAAVIQREEHKEDEPKEVEAAVVPGPFKGMKIKPAGTSRLKKSSTPASTAKSTIKCPITGKLIPESEFDNHLRTLLRDPRYKKEQENYIKKNFTYASNITTDQVYENIKRLVKKRSTNEDGQQSKRPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.29
4 0.33
5 0.33
6 0.36
7 0.32
8 0.31
9 0.37
10 0.4
11 0.33
12 0.34
13 0.36
14 0.38
15 0.41
16 0.4
17 0.37
18 0.37
19 0.38
20 0.39
21 0.41
22 0.37
23 0.42
24 0.51
25 0.53
26 0.56
27 0.63
28 0.59
29 0.56
30 0.56
31 0.52
32 0.47
33 0.47
34 0.48
35 0.43
36 0.49
37 0.45
38 0.46
39 0.45
40 0.41
41 0.36
42 0.3
43 0.3
44 0.28
45 0.3
46 0.31
47 0.3
48 0.34
49 0.39
50 0.42
51 0.48
52 0.49
53 0.53
54 0.54
55 0.54
56 0.51
57 0.48
58 0.44
59 0.36
60 0.36
61 0.33
62 0.32
63 0.34
64 0.36
65 0.36
66 0.35
67 0.34
68 0.29
69 0.26
70 0.24
71 0.23
72 0.2
73 0.14
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.17
81 0.18
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.11
99 0.11
100 0.09
101 0.11
102 0.16
103 0.17
104 0.22
105 0.23
106 0.23
107 0.23
108 0.24
109 0.24
110 0.21
111 0.2
112 0.22
113 0.27
114 0.27
115 0.26
116 0.26
117 0.24
118 0.22
119 0.21
120 0.17
121 0.12
122 0.14
123 0.15
124 0.19
125 0.19
126 0.21
127 0.25
128 0.23
129 0.27
130 0.25
131 0.24
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.13
136 0.14
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.15
141 0.18
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.25
146 0.28
147 0.31
148 0.29
149 0.29
150 0.22
151 0.25
152 0.29
153 0.35
154 0.35
155 0.38
156 0.43
157 0.47
158 0.51
159 0.49
160 0.48
161 0.45
162 0.48
163 0.48
164 0.5
165 0.5
166 0.5
167 0.55
168 0.53
169 0.54
170 0.49
171 0.43
172 0.38
173 0.3
174 0.26
175 0.2
176 0.17
177 0.13
178 0.12
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.2
185 0.21
186 0.26
187 0.32
188 0.36
189 0.37
190 0.38
191 0.38
192 0.31
193 0.34
194 0.31
195 0.32
196 0.32
197 0.35
198 0.4
199 0.42
200 0.4
201 0.38
202 0.37
203 0.31
204 0.26
205 0.22
206 0.16
207 0.17
208 0.17
209 0.14
210 0.14
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.16
237 0.21
238 0.24
239 0.28
240 0.28
241 0.29
242 0.32
243 0.35
244 0.36
245 0.35
246 0.33
247 0.29
248 0.3
249 0.33
250 0.31
251 0.3
252 0.25
253 0.24
254 0.21
255 0.24
256 0.23
257 0.22
258 0.21
259 0.23
260 0.27
261 0.31
262 0.33
263 0.3
264 0.32
265 0.35
266 0.36
267 0.38
268 0.35
269 0.3
270 0.28
271 0.26
272 0.23
273 0.17
274 0.16
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.16
283 0.17
284 0.21
285 0.27
286 0.3
287 0.35
288 0.4
289 0.47
290 0.49
291 0.55
292 0.56
293 0.6
294 0.59
295 0.55
296 0.55
297 0.58
298 0.53
299 0.5
300 0.49
301 0.44
302 0.45
303 0.48
304 0.49
305 0.42
306 0.41
307 0.42
308 0.4
309 0.38
310 0.38
311 0.39
312 0.39
313 0.39
314 0.39
315 0.39
316 0.39
317 0.37
318 0.36
319 0.34
320 0.29
321 0.31
322 0.29
323 0.25
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.2
328 0.26
329 0.3
330 0.36
331 0.42
332 0.47
333 0.54
334 0.62
335 0.67
336 0.67
337 0.67
338 0.7
339 0.73
340 0.79
341 0.78
342 0.79
343 0.78
344 0.7
345 0.68
346 0.59
347 0.52
348 0.49
349 0.43
350 0.38
351 0.36
352 0.37
353 0.32
354 0.31
355 0.27
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.21
360 0.24
361 0.29
362 0.32
363 0.38
364 0.43
365 0.5
366 0.54
367 0.62
368 0.67
369 0.72
370 0.76
371 0.78
372 0.81
373 0.81
374 0.8
375 0.76