Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MH13

Protein Details
Accession C5MH13    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-92QQPVVKQEKKQEDIKKKSKREYVPINPKLQDHydrophilic
697-722TYYFMLQHYRRKGKKDKVQQLINELNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 22, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ctp:CTRG_05367  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MLRKIVGRTASSSFNQLKVSTPRISTSLLALRYQSSSSTTTTTTTTATTGTTTTSSTPGSEQQPVVKQEKKQEDIKKKSKREYVPINPKLQDISEQIKSAILKNEDLSESFEILEEGISFLKSIQQDERISDSQIFFKFYPLTIELFRLAQNQPKNNQPVFKKSLDELLEFFVNNKIATPWHFLQIGVKDLMVSPGEEITATHYQKFLSLWFKCFEYCKQNEYVYMHTIYSIRGKKGEIDYQPYYLNNLAVYCYVQLCSLGEIKYSPVDASKFSNKENHIPLRYNIQKTLNHLGLYNKGSFQNFANFLRNDEKKRFDPNGAQSLYKIDNTFDKKQLDMVYLELVEVCKERKIQIDEKIICALMERYLKFEEYEEVFTLFENIINSGIKPNIESWNVVIKAMTNPTRIKSESKYSRKQLMENFERTIKTIQASGLKFNAGTIGAIVSGYANFGEFEKANEYMKNYSSIPGATNLANDGLLRGLISNNKTDEAEQKLHEFISQSKAQYKPSTNVMNDFLHYYIQRKNYSAVNGLTQFMRQHEIEENVTTRTILINAYFESLHAIGKTPDLSSYLKQMEQSSKANKKGFNEHMHSTLLKGLIQGGNIEAARQLFDILKKRYPRSSWLNTQIIIAEVTLGDAKLGEDLFNNYIKEIRNDNIIWNTFIHNLLQKDERLADVYFNKLKQQQAQEGKVGPNFYTYYFMLQHYRRKGKKDKVQQLINELNEKDWKDFGNVLPKFINNLTGFVDVPATLLQRVNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.34
4 0.37
5 0.38
6 0.43
7 0.4
8 0.39
9 0.38
10 0.38
11 0.4
12 0.34
13 0.33
14 0.34
15 0.31
16 0.31
17 0.29
18 0.28
19 0.28
20 0.28
21 0.23
22 0.2
23 0.2
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.19
31 0.18
32 0.16
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.18
45 0.21
46 0.24
47 0.28
48 0.28
49 0.32
50 0.38
51 0.43
52 0.47
53 0.47
54 0.48
55 0.53
56 0.61
57 0.6
58 0.62
59 0.67
60 0.71
61 0.77
62 0.82
63 0.83
64 0.83
65 0.87
66 0.87
67 0.85
68 0.84
69 0.84
70 0.85
71 0.85
72 0.84
73 0.82
74 0.74
75 0.67
76 0.58
77 0.49
78 0.42
79 0.36
80 0.34
81 0.3
82 0.29
83 0.28
84 0.29
85 0.29
86 0.28
87 0.3
88 0.26
89 0.25
90 0.25
91 0.28
92 0.27
93 0.26
94 0.27
95 0.22
96 0.2
97 0.18
98 0.17
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.08
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.1
109 0.11
110 0.14
111 0.17
112 0.23
113 0.24
114 0.27
115 0.34
116 0.31
117 0.32
118 0.32
119 0.3
120 0.29
121 0.29
122 0.31
123 0.24
124 0.25
125 0.25
126 0.22
127 0.25
128 0.21
129 0.22
130 0.19
131 0.21
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.2
137 0.24
138 0.29
139 0.34
140 0.36
141 0.43
142 0.5
143 0.49
144 0.54
145 0.52
146 0.54
147 0.54
148 0.53
149 0.48
150 0.41
151 0.45
152 0.41
153 0.38
154 0.3
155 0.27
156 0.25
157 0.22
158 0.22
159 0.17
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.12
165 0.15
166 0.21
167 0.19
168 0.22
169 0.22
170 0.22
171 0.26
172 0.26
173 0.27
174 0.2
175 0.18
176 0.15
177 0.15
178 0.17
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.11
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.21
194 0.19
195 0.21
196 0.22
197 0.25
198 0.25
199 0.26
200 0.27
201 0.29
202 0.31
203 0.31
204 0.32
205 0.33
206 0.35
207 0.35
208 0.38
209 0.38
210 0.36
211 0.3
212 0.28
213 0.24
214 0.21
215 0.21
216 0.18
217 0.23
218 0.24
219 0.22
220 0.22
221 0.23
222 0.26
223 0.3
224 0.36
225 0.31
226 0.35
227 0.35
228 0.36
229 0.37
230 0.32
231 0.29
232 0.23
233 0.2
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.15
258 0.22
259 0.23
260 0.24
261 0.31
262 0.31
263 0.36
264 0.42
265 0.44
266 0.4
267 0.41
268 0.4
269 0.44
270 0.48
271 0.44
272 0.41
273 0.4
274 0.38
275 0.4
276 0.46
277 0.38
278 0.32
279 0.31
280 0.28
281 0.28
282 0.28
283 0.24
284 0.19
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.2
292 0.25
293 0.23
294 0.25
295 0.31
296 0.34
297 0.34
298 0.36
299 0.39
300 0.36
301 0.43
302 0.43
303 0.39
304 0.42
305 0.43
306 0.47
307 0.44
308 0.41
309 0.34
310 0.34
311 0.32
312 0.26
313 0.2
314 0.12
315 0.17
316 0.23
317 0.27
318 0.29
319 0.28
320 0.27
321 0.29
322 0.3
323 0.25
324 0.19
325 0.16
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.14
338 0.19
339 0.24
340 0.31
341 0.4
342 0.39
343 0.4
344 0.39
345 0.34
346 0.28
347 0.24
348 0.17
349 0.11
350 0.13
351 0.12
352 0.14
353 0.14
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.12
359 0.14
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.09
366 0.08
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.09
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.19
382 0.19
383 0.18
384 0.16
385 0.14
386 0.14
387 0.18
388 0.19
389 0.16
390 0.17
391 0.18
392 0.22
393 0.23
394 0.24
395 0.24
396 0.31
397 0.38
398 0.45
399 0.52
400 0.53
401 0.6
402 0.58
403 0.59
404 0.55
405 0.54
406 0.53
407 0.48
408 0.46
409 0.4
410 0.39
411 0.36
412 0.31
413 0.23
414 0.17
415 0.15
416 0.15
417 0.18
418 0.19
419 0.19
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.15
424 0.14
425 0.08
426 0.07
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.09
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.17
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.05
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.09
470 0.1
471 0.12
472 0.13
473 0.14
474 0.15
475 0.16
476 0.19
477 0.21
478 0.23
479 0.21
480 0.22
481 0.22
482 0.21
483 0.21
484 0.18
485 0.14
486 0.17
487 0.19
488 0.19
489 0.24
490 0.26
491 0.29
492 0.34
493 0.35
494 0.32
495 0.36
496 0.41
497 0.37
498 0.38
499 0.38
500 0.33
501 0.3
502 0.28
503 0.22
504 0.17
505 0.17
506 0.17
507 0.18
508 0.23
509 0.24
510 0.24
511 0.26
512 0.28
513 0.3
514 0.32
515 0.28
516 0.26
517 0.25
518 0.25
519 0.23
520 0.21
521 0.19
522 0.16
523 0.18
524 0.14
525 0.15
526 0.18
527 0.2
528 0.2
529 0.21
530 0.21
531 0.19
532 0.19
533 0.16
534 0.13
535 0.11
536 0.1
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.09
550 0.11
551 0.12
552 0.09
553 0.1
554 0.12
555 0.14
556 0.14
557 0.2
558 0.22
559 0.22
560 0.24
561 0.27
562 0.29
563 0.32
564 0.37
565 0.4
566 0.45
567 0.52
568 0.54
569 0.54
570 0.53
571 0.58
572 0.6
573 0.58
574 0.56
575 0.52
576 0.5
577 0.49
578 0.45
579 0.36
580 0.31
581 0.23
582 0.18
583 0.15
584 0.16
585 0.14
586 0.15
587 0.14
588 0.11
589 0.13
590 0.13
591 0.13
592 0.1
593 0.09
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.16
599 0.24
600 0.27
601 0.34
602 0.4
603 0.45
604 0.51
605 0.53
606 0.55
607 0.57
608 0.61
609 0.63
610 0.66
611 0.65
612 0.58
613 0.55
614 0.47
615 0.39
616 0.3
617 0.2
618 0.11
619 0.07
620 0.08
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.07
628 0.06
629 0.07
630 0.1
631 0.13
632 0.16
633 0.16
634 0.15
635 0.18
636 0.2
637 0.22
638 0.23
639 0.22
640 0.26
641 0.26
642 0.31
643 0.34
644 0.34
645 0.32
646 0.29
647 0.3
648 0.26
649 0.26
650 0.24
651 0.22
652 0.21
653 0.24
654 0.26
655 0.24
656 0.26
657 0.26
658 0.25
659 0.23
660 0.22
661 0.23
662 0.22
663 0.28
664 0.3
665 0.3
666 0.34
667 0.36
668 0.4
669 0.43
670 0.48
671 0.51
672 0.55
673 0.59
674 0.58
675 0.58
676 0.57
677 0.52
678 0.47
679 0.37
680 0.31
681 0.28
682 0.24
683 0.25
684 0.21
685 0.23
686 0.23
687 0.25
688 0.3
689 0.34
690 0.42
691 0.48
692 0.58
693 0.59
694 0.67
695 0.75
696 0.78
697 0.83
698 0.85
699 0.85
700 0.85
701 0.88
702 0.83
703 0.81
704 0.78
705 0.71
706 0.66
707 0.56
708 0.49
709 0.46
710 0.44
711 0.37
712 0.31
713 0.29
714 0.26
715 0.3
716 0.32
717 0.36
718 0.35
719 0.36
720 0.37
721 0.36
722 0.36
723 0.33
724 0.36
725 0.26
726 0.28
727 0.27
728 0.27
729 0.26
730 0.23
731 0.23
732 0.15
733 0.15
734 0.15
735 0.13
736 0.13