Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5MDY4

Protein Details
Accession C5MDY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35SGPATPSPPKMKKSRSARDLFHKLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-27ATPSPPKMKKSRSA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
KEGG ctp:CTRG_03886  -  
Amino Acid Sequences MLFKKRKSNQSGPATPSPPKMKKSRSARDLFHKLSKTPKLTPPSSSSTAAAAIHDPIPLTPKQQTVEEVLLTNIINGRTPRPAPPPPTRSALPYSINDFRQSFSPRSSRNMRPRILDFEIDSLATSTPRGSNFLRRDGVSEYTTDSIFDFAYKSENFHDAGDFIDDKAKDDVLQEEEEEEVDDVEEEEEDDDFMDLDDYKAASDSYSITDTNIQIFKKYNHERKSQQLQETNTDTSLIDNLLNDYEFDQTVEEVKQVKQVKENKDNLDQAGLESNDEYIKNLEMILIQEKQNYKIKQQQREIKHLQTLLDFQNDLNQHLLKRLNIKDNHSHHHHHHHSRDQRLLPPFHVMRRSNSQKEDQDENISLVSSDSFIMSEQFTSSRSTSIEQLRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.69
3 0.68
4 0.68
5 0.65
6 0.63
7 0.66
8 0.66
9 0.71
10 0.78
11 0.8
12 0.8
13 0.81
14 0.82
15 0.82
16 0.83
17 0.8
18 0.77
19 0.71
20 0.64
21 0.65
22 0.67
23 0.63
24 0.6
25 0.62
26 0.62
27 0.61
28 0.63
29 0.59
30 0.58
31 0.56
32 0.52
33 0.44
34 0.37
35 0.36
36 0.31
37 0.25
38 0.19
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.11
44 0.14
45 0.14
46 0.17
47 0.18
48 0.21
49 0.23
50 0.25
51 0.27
52 0.28
53 0.29
54 0.27
55 0.24
56 0.2
57 0.19
58 0.17
59 0.15
60 0.13
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.16
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.32
69 0.39
70 0.44
71 0.53
72 0.57
73 0.55
74 0.59
75 0.55
76 0.51
77 0.49
78 0.47
79 0.41
80 0.36
81 0.39
82 0.39
83 0.39
84 0.38
85 0.33
86 0.29
87 0.31
88 0.33
89 0.29
90 0.3
91 0.36
92 0.35
93 0.41
94 0.48
95 0.52
96 0.58
97 0.65
98 0.62
99 0.6
100 0.61
101 0.61
102 0.57
103 0.49
104 0.39
105 0.32
106 0.3
107 0.24
108 0.2
109 0.14
110 0.11
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.09
115 0.09
116 0.13
117 0.14
118 0.23
119 0.27
120 0.33
121 0.35
122 0.33
123 0.34
124 0.34
125 0.35
126 0.26
127 0.23
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.1
139 0.09
140 0.11
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.08
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.15
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.17
204 0.25
205 0.34
206 0.4
207 0.43
208 0.5
209 0.52
210 0.59
211 0.67
212 0.64
213 0.62
214 0.59
215 0.56
216 0.54
217 0.54
218 0.46
219 0.36
220 0.3
221 0.23
222 0.17
223 0.15
224 0.11
225 0.07
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.17
243 0.22
244 0.23
245 0.29
246 0.37
247 0.44
248 0.52
249 0.58
250 0.56
251 0.58
252 0.58
253 0.51
254 0.46
255 0.36
256 0.27
257 0.25
258 0.2
259 0.14
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.11
273 0.13
274 0.13
275 0.18
276 0.19
277 0.23
278 0.31
279 0.31
280 0.34
281 0.41
282 0.49
283 0.54
284 0.62
285 0.67
286 0.66
287 0.74
288 0.75
289 0.71
290 0.68
291 0.6
292 0.52
293 0.44
294 0.42
295 0.35
296 0.31
297 0.26
298 0.2
299 0.24
300 0.23
301 0.23
302 0.21
303 0.2
304 0.18
305 0.23
306 0.25
307 0.22
308 0.3
309 0.35
310 0.41
311 0.44
312 0.5
313 0.55
314 0.58
315 0.63
316 0.61
317 0.61
318 0.58
319 0.64
320 0.67
321 0.67
322 0.69
323 0.72
324 0.74
325 0.76
326 0.78
327 0.72
328 0.7
329 0.69
330 0.64
331 0.56
332 0.56
333 0.52
334 0.5
335 0.54
336 0.49
337 0.48
338 0.55
339 0.63
340 0.62
341 0.63
342 0.66
343 0.63
344 0.66
345 0.66
346 0.59
347 0.56
348 0.5
349 0.45
350 0.37
351 0.3
352 0.24
353 0.18
354 0.15
355 0.1
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.16
367 0.17
368 0.17
369 0.18
370 0.2
371 0.26