Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6TIR7

Protein Details
Accession A0A5N6TIR7    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-53AESNARPRPSRRGRGRGHRGSHRRPQAQTBasic
77-102QQQPIPDAPRSRRNPRRGRGGARGGGHydrophilic
985-1008SVSECVKLRERQRQKDREAQRLATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-48ARPRPSRRGRGRGHRGSHRR
85-119PRSRRNPRRGRGGARGGGAPPEGNSRRQRQRGGDR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MSANYTAFNRLSSFEIMSDAPAPAAESNARPRPSRRGRGRGHRGSHRRPQAQTEQSPNIPQPPAGQPSQAQPAESSQQQPIPDAPRSRRNPRRGRGGARGGGAPPEGNSRRQRQRGGDRITASAGRRFEGRLTKPDQAPENDQVDGASDPQNLGMRADAPTFVPGLPSENPTTQTTPSTTPSAAKGKSKANNVQPPRPPKVTTKSVAPDIATRIHEDIANTLYECPICTGELGRRSRVWSCELCWTVFHLSCVKKWSKNEGAAAQDASRRQDGEASAPRAWRCPGCNLPHEIFPTGYHCWCEKEVDPRPLPGLPPHSCGQTCARPRKGCPHPCDATCHAGPCAPCTAMGPTQDCFCGRNSSTTRCQDTDYDNGWSCGEICGDLLPCGEHTCSRPCHEGLCGACEVRVEARCYCGKVETEMLCSSKDEEQDSQTLHNESDEDRVEEWVGCFSCGDLCSRPFDCGIHFCQKGCHPQEVHPAHCPRSPDVVLHCPCGKTPLTEIPGYSPRTSCEDPIPNCLEACGKILPCGHACDKVCHTGPCGLCTRSVPVSCRCGRNSYMSICHQGHLEPPQCFRVCKAGLHCGRHACTERCCPGEQKAIERQALRRKLKAHLRPSDEDVEAEHICTRVCGRMLKCGRHTCPELCHKGPCNTCREAIFEEISCNCGRSVLYPPLPCGTQPPPCSAPCERPKPCGHPQTPHNCHTDDEVCPKCPYLTEKMCLCGKQALKNVPCWLADARCGRICGAPLKCGSHTCQKNCHRPGDCEDALKPCQQACGKTKTLCGHPCTEPCHAPYPCSEKTPCSSTVTVTCGCGRLRQQRRCNAAKAVASKGQLHQPQRTPSLTPLTCDDECARLERNRSLASALGVEINQSTTVAQNLTATNLPYSTETLDMYIQLSSSAPLSTLQSYESTLHSLALNTTQRSVRFQPAKSSLRAFVHSLAADWGFASESFDPEPHRHVFVLKPTVWNPPLLGLGNGTAIGIGGMSVSECVKLRERQRQKDREAQRLATAEAKAQREAVKAQASATSEGGWAQVAASRRSNASTRSTTPTPGAGSLSGSMYAALAEGGGAWGAPKKEKLVLRSGVGAGKQLRTPPAPAPVVDSWEEEEEKQEEEERAREQVQEDDHKEPEGDTGKTDPADAGEDIAALPVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.19
4 0.2
5 0.19
6 0.16
7 0.13
8 0.12
9 0.13
10 0.1
11 0.13
12 0.13
13 0.16
14 0.25
15 0.33
16 0.37
17 0.4
18 0.44
19 0.53
20 0.61
21 0.68
22 0.7
23 0.72
24 0.79
25 0.86
26 0.92
27 0.91
28 0.9
29 0.9
30 0.9
31 0.89
32 0.89
33 0.89
34 0.86
35 0.8
36 0.79
37 0.78
38 0.78
39 0.76
40 0.74
41 0.71
42 0.66
43 0.66
44 0.6
45 0.55
46 0.47
47 0.39
48 0.35
49 0.36
50 0.37
51 0.34
52 0.35
53 0.3
54 0.35
55 0.43
56 0.39
57 0.33
58 0.29
59 0.32
60 0.34
61 0.35
62 0.33
63 0.28
64 0.31
65 0.3
66 0.31
67 0.32
68 0.33
69 0.37
70 0.42
71 0.45
72 0.52
73 0.6
74 0.69
75 0.74
76 0.79
77 0.82
78 0.83
79 0.87
80 0.86
81 0.86
82 0.85
83 0.84
84 0.78
85 0.7
86 0.64
87 0.53
88 0.46
89 0.39
90 0.29
91 0.21
92 0.25
93 0.25
94 0.3
95 0.37
96 0.45
97 0.54
98 0.61
99 0.68
100 0.68
101 0.77
102 0.79
103 0.79
104 0.77
105 0.69
106 0.64
107 0.6
108 0.54
109 0.46
110 0.41
111 0.35
112 0.28
113 0.27
114 0.27
115 0.29
116 0.34
117 0.36
118 0.39
119 0.44
120 0.5
121 0.52
122 0.56
123 0.56
124 0.52
125 0.53
126 0.52
127 0.49
128 0.41
129 0.38
130 0.32
131 0.28
132 0.23
133 0.19
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.14
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.14
153 0.15
154 0.18
155 0.2
156 0.21
157 0.25
158 0.27
159 0.3
160 0.27
161 0.28
162 0.28
163 0.27
164 0.29
165 0.29
166 0.26
167 0.26
168 0.3
169 0.34
170 0.35
171 0.37
172 0.38
173 0.43
174 0.49
175 0.55
176 0.58
177 0.6
178 0.67
179 0.69
180 0.73
181 0.73
182 0.75
183 0.74
184 0.71
185 0.64
186 0.62
187 0.63
188 0.62
189 0.57
190 0.57
191 0.55
192 0.54
193 0.53
194 0.46
195 0.4
196 0.35
197 0.37
198 0.29
199 0.26
200 0.23
201 0.22
202 0.22
203 0.19
204 0.18
205 0.15
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.12
217 0.17
218 0.25
219 0.28
220 0.29
221 0.3
222 0.34
223 0.37
224 0.38
225 0.38
226 0.32
227 0.32
228 0.38
229 0.38
230 0.35
231 0.32
232 0.32
233 0.31
234 0.29
235 0.28
236 0.26
237 0.26
238 0.28
239 0.34
240 0.36
241 0.37
242 0.41
243 0.48
244 0.49
245 0.53
246 0.55
247 0.53
248 0.51
249 0.47
250 0.44
251 0.36
252 0.31
253 0.28
254 0.25
255 0.22
256 0.19
257 0.17
258 0.2
259 0.19
260 0.24
261 0.3
262 0.32
263 0.33
264 0.35
265 0.36
266 0.35
267 0.37
268 0.32
269 0.27
270 0.3
271 0.36
272 0.38
273 0.42
274 0.45
275 0.45
276 0.46
277 0.45
278 0.39
279 0.32
280 0.27
281 0.27
282 0.24
283 0.23
284 0.21
285 0.19
286 0.21
287 0.21
288 0.24
289 0.23
290 0.3
291 0.37
292 0.44
293 0.44
294 0.43
295 0.44
296 0.41
297 0.4
298 0.35
299 0.35
300 0.28
301 0.31
302 0.3
303 0.32
304 0.31
305 0.32
306 0.33
307 0.33
308 0.4
309 0.45
310 0.53
311 0.53
312 0.57
313 0.64
314 0.69
315 0.7
316 0.66
317 0.65
318 0.62
319 0.6
320 0.63
321 0.57
322 0.52
323 0.44
324 0.4
325 0.32
326 0.29
327 0.27
328 0.22
329 0.21
330 0.15
331 0.14
332 0.14
333 0.17
334 0.17
335 0.2
336 0.19
337 0.18
338 0.18
339 0.2
340 0.19
341 0.16
342 0.15
343 0.19
344 0.18
345 0.26
346 0.29
347 0.34
348 0.41
349 0.47
350 0.49
351 0.44
352 0.46
353 0.4
354 0.4
355 0.4
356 0.34
357 0.32
358 0.28
359 0.28
360 0.26
361 0.23
362 0.19
363 0.14
364 0.12
365 0.07
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.11
377 0.16
378 0.19
379 0.22
380 0.26
381 0.25
382 0.26
383 0.25
384 0.28
385 0.23
386 0.23
387 0.21
388 0.17
389 0.17
390 0.15
391 0.15
392 0.13
393 0.15
394 0.14
395 0.14
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.21
400 0.2
401 0.18
402 0.17
403 0.22
404 0.19
405 0.21
406 0.22
407 0.22
408 0.2
409 0.19
410 0.19
411 0.17
412 0.17
413 0.16
414 0.16
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.18
420 0.17
421 0.15
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.14
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.13
430 0.13
431 0.13
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.15
444 0.15
445 0.16
446 0.16
447 0.16
448 0.15
449 0.17
450 0.21
451 0.24
452 0.24
453 0.23
454 0.26
455 0.29
456 0.36
457 0.35
458 0.36
459 0.3
460 0.33
461 0.44
462 0.44
463 0.44
464 0.42
465 0.42
466 0.39
467 0.4
468 0.38
469 0.3
470 0.32
471 0.3
472 0.25
473 0.26
474 0.32
475 0.32
476 0.33
477 0.32
478 0.26
479 0.25
480 0.27
481 0.23
482 0.15
483 0.17
484 0.21
485 0.22
486 0.22
487 0.23
488 0.23
489 0.28
490 0.29
491 0.27
492 0.21
493 0.19
494 0.25
495 0.25
496 0.23
497 0.23
498 0.28
499 0.28
500 0.33
501 0.35
502 0.29
503 0.28
504 0.27
505 0.22
506 0.15
507 0.16
508 0.13
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.14
513 0.14
514 0.17
515 0.16
516 0.19
517 0.2
518 0.21
519 0.23
520 0.25
521 0.26
522 0.23
523 0.23
524 0.24
525 0.23
526 0.23
527 0.24
528 0.2
529 0.2
530 0.2
531 0.21
532 0.19
533 0.2
534 0.2
535 0.2
536 0.27
537 0.29
538 0.33
539 0.31
540 0.32
541 0.32
542 0.34
543 0.34
544 0.3
545 0.31
546 0.29
547 0.33
548 0.3
549 0.28
550 0.23
551 0.2
552 0.2
553 0.21
554 0.24
555 0.19
556 0.2
557 0.25
558 0.25
559 0.25
560 0.24
561 0.24
562 0.21
563 0.23
564 0.24
565 0.28
566 0.33
567 0.36
568 0.37
569 0.33
570 0.32
571 0.34
572 0.35
573 0.28
574 0.27
575 0.3
576 0.31
577 0.3
578 0.31
579 0.29
580 0.28
581 0.34
582 0.31
583 0.3
584 0.33
585 0.35
586 0.37
587 0.36
588 0.38
589 0.39
590 0.48
591 0.45
592 0.43
593 0.41
594 0.46
595 0.54
596 0.57
597 0.58
598 0.56
599 0.59
600 0.58
601 0.59
602 0.55
603 0.46
604 0.37
605 0.28
606 0.24
607 0.18
608 0.16
609 0.13
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.07
615 0.09
616 0.14
617 0.14
618 0.23
619 0.29
620 0.33
621 0.4
622 0.45
623 0.46
624 0.46
625 0.49
626 0.41
627 0.43
628 0.46
629 0.46
630 0.4
631 0.42
632 0.41
633 0.44
634 0.47
635 0.45
636 0.43
637 0.38
638 0.38
639 0.34
640 0.34
641 0.29
642 0.26
643 0.23
644 0.18
645 0.17
646 0.16
647 0.17
648 0.14
649 0.12
650 0.1
651 0.09
652 0.09
653 0.09
654 0.15
655 0.19
656 0.23
657 0.23
658 0.25
659 0.25
660 0.25
661 0.23
662 0.23
663 0.21
664 0.24
665 0.24
666 0.28
667 0.3
668 0.31
669 0.36
670 0.33
671 0.38
672 0.39
673 0.48
674 0.46
675 0.49
676 0.53
677 0.56
678 0.62
679 0.63
680 0.58
681 0.55
682 0.61
683 0.65
684 0.67
685 0.63
686 0.58
687 0.48
688 0.45
689 0.43
690 0.37
691 0.29
692 0.31
693 0.29
694 0.28
695 0.27
696 0.27
697 0.23
698 0.22
699 0.23
700 0.24
701 0.25
702 0.28
703 0.29
704 0.33
705 0.35
706 0.33
707 0.31
708 0.29
709 0.27
710 0.29
711 0.34
712 0.38
713 0.37
714 0.4
715 0.42
716 0.37
717 0.35
718 0.31
719 0.27
720 0.2
721 0.24
722 0.23
723 0.24
724 0.24
725 0.24
726 0.23
727 0.22
728 0.23
729 0.24
730 0.23
731 0.23
732 0.23
733 0.25
734 0.25
735 0.26
736 0.28
737 0.31
738 0.36
739 0.37
740 0.45
741 0.51
742 0.6
743 0.64
744 0.69
745 0.63
746 0.6
747 0.62
748 0.61
749 0.53
750 0.46
751 0.42
752 0.38
753 0.36
754 0.34
755 0.3
756 0.21
757 0.25
758 0.25
759 0.29
760 0.3
761 0.35
762 0.37
763 0.38
764 0.43
765 0.41
766 0.47
767 0.46
768 0.44
769 0.42
770 0.41
771 0.44
772 0.43
773 0.43
774 0.38
775 0.35
776 0.4
777 0.36
778 0.33
779 0.34
780 0.37
781 0.34
782 0.37
783 0.35
784 0.3
785 0.33
786 0.36
787 0.34
788 0.31
789 0.3
790 0.27
791 0.29
792 0.3
793 0.27
794 0.24
795 0.22
796 0.21
797 0.2
798 0.22
799 0.26
800 0.33
801 0.43
802 0.51
803 0.59
804 0.65
805 0.73
806 0.74
807 0.72
808 0.66
809 0.62
810 0.57
811 0.52
812 0.48
813 0.44
814 0.4
815 0.38
816 0.34
817 0.36
818 0.37
819 0.38
820 0.4
821 0.41
822 0.45
823 0.47
824 0.47
825 0.42
826 0.39
827 0.44
828 0.38
829 0.34
830 0.32
831 0.34
832 0.32
833 0.32
834 0.29
835 0.23
836 0.23
837 0.24
838 0.25
839 0.22
840 0.26
841 0.27
842 0.3
843 0.28
844 0.29
845 0.27
846 0.24
847 0.22
848 0.19
849 0.16
850 0.12
851 0.11
852 0.1
853 0.09
854 0.08
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.06
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.09
863 0.09
864 0.11
865 0.12
866 0.12
867 0.12
868 0.11
869 0.12
870 0.11
871 0.12
872 0.11
873 0.11
874 0.11
875 0.12
876 0.12
877 0.11
878 0.11
879 0.09
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.06
884 0.07
885 0.06
886 0.06
887 0.07
888 0.09
889 0.1
890 0.1
891 0.11
892 0.11
893 0.13
894 0.14
895 0.14
896 0.14
897 0.14
898 0.14
899 0.13
900 0.13
901 0.12
902 0.17
903 0.2
904 0.18
905 0.21
906 0.23
907 0.24
908 0.29
909 0.33
910 0.36
911 0.39
912 0.4
913 0.46
914 0.53
915 0.56
916 0.54
917 0.54
918 0.5
919 0.46
920 0.47
921 0.4
922 0.33
923 0.32
924 0.28
925 0.25
926 0.21
927 0.18
928 0.15
929 0.13
930 0.11
931 0.08
932 0.08
933 0.1
934 0.09
935 0.11
936 0.12
937 0.13
938 0.16
939 0.17
940 0.22
941 0.21
942 0.23
943 0.22
944 0.24
945 0.27
946 0.32
947 0.38
948 0.35
949 0.38
950 0.37
951 0.45
952 0.43
953 0.4
954 0.32
955 0.26
956 0.28
957 0.23
958 0.22
959 0.14
960 0.14
961 0.13
962 0.13
963 0.1
964 0.07
965 0.06
966 0.05
967 0.04
968 0.03
969 0.02
970 0.02
971 0.03
972 0.04
973 0.04
974 0.06
975 0.07
976 0.1
977 0.16
978 0.23
979 0.32
980 0.42
981 0.52
982 0.62
983 0.73
984 0.79
985 0.81
986 0.85
987 0.84
988 0.84
989 0.8
990 0.72
991 0.67
992 0.59
993 0.54
994 0.48
995 0.41
996 0.36
997 0.35
998 0.34
999 0.29
1000 0.3
1001 0.31
1002 0.29
1003 0.3
1004 0.31
1005 0.29
1006 0.27
1007 0.27
1008 0.28
1009 0.28
1010 0.27
1011 0.26
1012 0.2
1013 0.16
1014 0.15
1015 0.15
1016 0.11
1017 0.09
1018 0.07
1019 0.09
1020 0.12
1021 0.15
1022 0.18
1023 0.19
1024 0.21
1025 0.25
1026 0.28
1027 0.29
1028 0.34
1029 0.36
1030 0.38
1031 0.44
1032 0.45
1033 0.44
1034 0.42
1035 0.42
1036 0.36
1037 0.31
1038 0.28
1039 0.21
1040 0.21
1041 0.19
1042 0.18
1043 0.15
1044 0.13
1045 0.11
1046 0.09
1047 0.08
1048 0.07
1049 0.05
1050 0.04
1051 0.03
1052 0.03
1053 0.03
1054 0.03
1055 0.03
1056 0.04
1057 0.07
1058 0.09
1059 0.13
1060 0.15
1061 0.17
1062 0.25
1063 0.3
1064 0.34
1065 0.39
1066 0.42
1067 0.42
1068 0.44
1069 0.43
1070 0.4
1071 0.36
1072 0.36
1073 0.31
1074 0.29
1075 0.29
1076 0.29
1077 0.32
1078 0.31
1079 0.34
1080 0.33
1081 0.38
1082 0.38
1083 0.35
1084 0.38
1085 0.35
1086 0.37
1087 0.35
1088 0.32
1089 0.27
1090 0.28
1091 0.3
1092 0.23
1093 0.25
1094 0.22
1095 0.22
1096 0.21
1097 0.22
1098 0.21
1099 0.23
1100 0.26
1101 0.25
1102 0.28
1103 0.28
1104 0.29
1105 0.27
1106 0.3
1107 0.34
1108 0.4
1109 0.42
1110 0.42
1111 0.42
1112 0.4
1113 0.39
1114 0.34
1115 0.33
1116 0.29
1117 0.25
1118 0.23
1119 0.25
1120 0.27
1121 0.27
1122 0.27
1123 0.21
1124 0.18
1125 0.2
1126 0.18
1127 0.16
1128 0.13
1129 0.13
1130 0.12